MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Uncultured Termite group 1 bacterium phylotype Rs-D17 plasmid pTGRD3 DNA

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020422	GAC	2	6	82	87	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189485780
2	NC_020422	AATT	2	8	149	156	50 %	50 %	0 %	0 %	189485780
3	NC_020422	TAA	2	6	164	169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485780
4	NC_020422	ACA	2	6	253	258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485780
5	NC_020422	TAA	2	6	272	277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485780
6	NC_020422	ATA	2	6	374	379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485780
7	NC_020422	CGT	2	6	420	425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189485780
8	NC_020422	A	8	8	477	484	100 %	0 %	0 %	0 %	189485780
9	NC_020422	AAAT	2	8	494	501	75 %	25 %	0 %	0 %	189485780
10	NC_020422	TAA	2	6	510	515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485780
11	NC_020422	AAC	2	6	585	590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485780
12	NC_020422	ACGC	2	8	592	599	25 %	0 %	25 %	50 %	189485780
13	NC_020422	GTT	2	6	673	678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189485780
14	NC_020422	ATT	2	6	747	752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485780
15	NC_020422	CT	3	6	821	826	0 %	50 %	0 %	50 %	189485780
16	NC_020422	A	7	7	853	859	100 %	0 %	0 %	0 %	189485780
17	NC_020422	TTA	2	6	890	895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485780
18	NC_020422	AAC	2	6	911	916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485780
19	NC_020422	GAAA	2	8	922	929	75 %	0 %	25 %	0 %	189485780
20	NC_020422	AAT	2	6	1008	1013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485780
21	NC_020422	AT	3	6	1037	1042	50 %	50 %	0 %	0 %	189485780
22	NC_020422	TAAATA	2	12	1067	1078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485780
23	NC_020422	A	6	6	1104	1109	100 %	0 %	0 %	0 %	189485780
24	NC_020422	ACA	2	6	1224	1229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485780
25	NC_020422	TCTT	2	8	1309	1316	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_020422	GCCT	2	8	1321	1328	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_020422	A	7	7	1331	1337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020422	TCTTTA	2	12	1389	1400	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_020422	A	7	7	1400	1406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020422	GTT	2	6	1407	1412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020422	A	6	6	1413	1418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020422	TAA	2	6	1440	1445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020422	ATT	2	6	1461	1466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020422	ATA	2	6	1486	1491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485781
35	NC_020422	CTT	2	6	1499	1504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189485781
36	NC_020422	T	8	8	1521	1528	0 %	100 %	0 %	0 %	189485781
37	NC_020422	GGAT	2	8	1589	1596	25 %	25 %	50 %	0 %	189485781
38	NC_020422	TGAAA	2	10	1685	1694	60 %	20 %	20 %	0 %	189485781
39	NC_020422	A	7	7	1723	1729	100 %	0 %	0 %	0 %	189485781
40	NC_020422	ATG	2	6	1735	1740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189485781
41	NC_020422	A	6	6	1748	1753	100 %	0 %	0 %	0 %	189485781
42	NC_020422	AGTAA	2	10	1772	1781	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020422	T	6	6	1794	1799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020422	AAT	2	6	1843	1848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020422	GAT	2	6	1861	1866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020422	TAAA	2	8	1869	1876	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020422	ATT	2	6	1881	1886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020422	AAAGG	2	10	1899	1908	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020422	A	6	6	1967	1972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020422	TA	3	6	1999	2004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020422	TAT	2	6	2016	2021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020422	ATA	4	12	2053	2064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020422	TG	3	6	2082	2087	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020422	AAAT	2	8	2093	2100	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020422	AT	4	8	2145	2152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020422	AAAAT	2	10	2156	2165	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020422	AAT	2	6	2184	2189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020422	ATT	2	6	2194	2199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020422	GTT	2	6	2241	2246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020422	T	6	6	2266	2271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020422	TA	3	6	2283	2288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020422	ATA	2	6	2302	2307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020422	AGT	2	6	2342	2347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020422	AAT	2	6	2384	2389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020422	CTT	2	6	2395	2400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_020422	CTTTTC	2	12	2480	2491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_020422	TAA	3	9	2541	2549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020422	CTTG	2	8	2629	2636	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_020422	CT	3	6	2643	2648	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_020422	GCCT	2	8	2654	2661	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_020422	A	8	8	2664	2671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020422	A	8	8	2728	2735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020422	A	7	7	2738	2744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020422	TGT	2	6	2747	2752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020422	AGC	2	6	2794	2799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_020422	TGT	2	6	2816	2821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020422	A	8	8	2859	2866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020422	TAAA	2	8	3023	3030	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020422	A	7	7	3038	3044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020422	A	6	6	3046	3051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020422	A	8	8	3094	3101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020422	GCGT	2	8	3173	3180	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_020422	TTG	2	6	3225	3230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020422	A	6	6	3233	3238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020422	A	8	8	3243	3250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020422	TC	3	6	3335	3340	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_020422	A	8	8	3418	3425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020422	TA	3	6	3474	3479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020422	A	6	6	3506	3511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020422	TA	3	6	3521	3526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020422	ATA	2	6	3585	3590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020422	TAT	2	6	3669	3674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020422	AT	3	6	3673	3678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020422	A	10	10	3752	3761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020422	GAAG	2	8	3772	3779	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020422	TC	3	6	3861	3866	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_020422	A	6	6	3884	3889	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020422	ATG	2	6	3893	3898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020422	ATTA	2	8	3903	3910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020422	CTG	2	6	3975	3980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_020422	A	6	6	4007	4012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020422	GTTTG	2	10	4054	4063	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020422	GCT	2	6	4126	4131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_020422	CGA	2	6	4132	4137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_020422	TAG	2	6	4189	4194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020422	TAAT	2	8	4306	4313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020422	A	6	6	4314	4319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020422	GTT	2	6	4320	4325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020422	A	6	6	4326	4331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020422	A	7	7	4364	4370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020422	TGT	2	6	4389	4394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020422	ATG	2	6	4452	4457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020422	TTCAAC	2	12	4459	4470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_020422	CCTACT	2	12	4490	4501	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_020422	GCCTAC	2	12	4525	4536	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	189485782
116	NC_020422	A	7	7	4586	4592	100 %	0 %	0 %	0 %	189485782
117	NC_020422	GTT	2	6	4597	4602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189485782
118	NC_020422	TTTA	2	8	4628	4635	25 %	75 %	0 %	0 %	189485782
119	NC_020422	CAT	2	6	4668	4673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189485782
120	NC_020422	CAA	2	6	4695	4700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485782
121	NC_020422	CAGT	2	8	4869	4876	25 %	25 %	25 %	25 %	189485782
122	NC_020422	ATTA	2	8	4979	4986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020422	T	7	7	5027	5033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020422	AT	3	6	5076	5081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020422	TTAA	2	8	5097	5104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020422	A	6	6	5225	5230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020422	CT	3	6	5257	5262	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_020422	TAA	2	6	5268	5273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020422	TAA	2	6	5278	5283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020422	T	6	6	5313	5318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020422	ACAAAA	2	12	5341	5352	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.