MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Uncultured Termite group 1 bacterium phylotype Rs-D17 plasmid pTGRD2 DNA

Total Repeats: 155

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020421	A	6	6	32	37	100 %	0 %	0 %	0 %	189485776
2	NC_020421	AT	3	6	86	91	50 %	50 %	0 %	0 %	189485776
3	NC_020421	TTG	2	6	209	214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189485776
4	NC_020421	A	7	7	274	280	100 %	0 %	0 %	0 %	189485776
5	NC_020421	TAA	2	6	396	401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485776
6	NC_020421	CTT	2	6	422	427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189485776
7	NC_020421	T	6	6	448	453	0 %	100 %	0 %	0 %	189485776
8	NC_020421	A	7	7	475	481	100 %	0 %	0 %	0 %	189485776
9	NC_020421	GTT	2	6	517	522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189485776
10	NC_020421	TA	3	6	527	532	50 %	50 %	0 %	0 %	189485776
11	NC_020421	ACGC	2	8	589	596	25 %	0 %	25 %	50 %	189485776
12	NC_020421	T	6	6	604	609	0 %	100 %	0 %	0 %	189485776
13	NC_020421	ATT	2	6	613	618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485776
14	NC_020421	AT	3	6	620	625	50 %	50 %	0 %	0 %	189485776
15	NC_020421	ATA	2	6	653	658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485776
16	NC_020421	GTT	2	6	673	678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189485776
17	NC_020421	ATT	2	6	747	752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485776
18	NC_020421	GACG	2	8	796	803	25 %	0 %	50 %	25 %	189485776
19	NC_020421	TACTTT	2	12	813	824	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	189485776
20	NC_020421	T	6	6	822	827	0 %	100 %	0 %	0 %	189485776
21	NC_020421	TCA	2	6	852	857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189485776
22	NC_020421	GAAA	2	8	922	929	75 %	0 %	25 %	0 %	189485776
23	NC_020421	TGTTA	2	10	989	998	20 %	60 %	20 %	0 %	189485776
24	NC_020421	AGT	2	6	1008	1013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189485776
25	NC_020421	TAA	2	6	1020	1025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485776
26	NC_020421	AT	4	8	1037	1044	50 %	50 %	0 %	0 %	189485776
27	NC_020421	AT	3	6	1070	1075	50 %	50 %	0 %	0 %	189485776
28	NC_020421	TGTA	2	8	1157	1164	25 %	50 %	25 %	0 %	189485776
29	NC_020421	ACA	2	6	1224	1229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485776
30	NC_020421	TTA	2	6	1243	1248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485776
31	NC_020421	CT	3	6	1320	1325	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_020421	GCCT	2	8	1331	1338	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_020421	A	6	6	1342	1347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020421	A	6	6	1404	1409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020421	A	7	7	1415	1421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020421	TGT	2	6	1424	1429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020421	TTAT	2	8	1488	1495	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020421	TGTCT	2	10	1496	1505	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_020421	A	6	6	1537	1542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020421	ATA	2	6	1616	1621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020421	TAAA	2	8	1700	1707	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020421	A	8	8	1715	1722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020421	A	6	6	1724	1729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020421	A	8	8	1772	1779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020421	A	6	6	1807	1812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020421	GCGT	2	8	1843	1850	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_020421	TTG	2	6	1895	1900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020421	A	6	6	1903	1908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020421	A	6	6	1915	1920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020421	A	9	9	1949	1957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020421	AATCT	2	10	2045	2054	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_020421	ATA	2	6	2060	2065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020421	CTT	2	6	2106	2111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_020421	CTGA	2	8	2159	2166	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_020421	CAA	2	6	2167	2172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_020421	AAT	2	6	2173	2178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020421	TGT	2	6	2234	2239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020421	TAT	2	6	2257	2262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020421	AT	3	6	2261	2266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020421	A	6	6	2350	2355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020421	AGCGA	2	10	2358	2367	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_020421	AT	3	6	2390	2395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020421	ATA	2	6	2434	2439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020421	A	9	9	2512	2520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020421	A	7	7	2523	2529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020421	A	7	7	2537	2543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020421	A	7	7	2547	2553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020421	AC	3	6	2618	2623	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_020421	A	7	7	2624	2630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020421	A	8	8	2649	2656	100 %	0 %	0 %	0 %	189485777
71	NC_020421	A	6	6	2665	2670	100 %	0 %	0 %	0 %	189485777
72	NC_020421	ATA	2	6	2798	2803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485777
73	NC_020421	AAT	2	6	2808	2813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485777
74	NC_020421	AGAA	2	8	2822	2829	75 %	0 %	25 %	0 %	189485777
75	NC_020421	A	8	8	2844	2851	100 %	0 %	0 %	0 %	189485777
76	NC_020421	AAT	2	6	2857	2862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485777
77	NC_020421	ATA	2	6	2894	2899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485777
78	NC_020421	ATA	2	6	2960	2965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485777
79	NC_020421	TAG	2	6	2973	2978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189485777
80	NC_020421	AGCGA	2	10	2995	3004	40 %	0 %	40 %	20 %	189485777
81	NC_020421	CAAGTT	2	12	3172	3183	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	189485777
82	NC_020421	CAG	2	6	3185	3190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189485777
83	NC_020421	CAAGTT	2	12	3208	3219	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	189485777
84	NC_020421	CAG	2	6	3221	3226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189485777
85	NC_020421	TCAAGT	2	12	3243	3254	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	189485777
86	NC_020421	CAG	2	6	3257	3262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189485777
87	NC_020421	TCAAGT	2	12	3279	3290	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	189485777
88	NC_020421	CAG	2	6	3293	3298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189485777
89	NC_020421	TCAAGT	2	12	3315	3326	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	189485777
90	NC_020421	CAG	2	6	3329	3334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189485777
91	NC_020421	TCAAGT	2	12	3351	3362	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	189485777
92	NC_020421	CAG	2	6	3365	3370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189485777
93	NC_020421	CAAGTT	2	12	3388	3399	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	189485777
94	NC_020421	CAG	2	6	3401	3406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189485777
95	NC_020421	TCAAGT	2	12	3423	3434	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	189485777
96	NC_020421	CAG	2	6	3437	3442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189485777
97	NC_020421	CAAGTT	2	12	3460	3471	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	189485777
98	NC_020421	CAG	2	6	3473	3478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189485777
99	NC_020421	AT	3	6	3531	3536	50 %	50 %	0 %	0 %	189485777
100	NC_020421	AT	3	6	3588	3593	50 %	50 %	0 %	0 %	189485777
101	NC_020421	TAG	2	6	3626	3631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189485777
102	NC_020421	CTA	2	6	3682	3687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189485777
103	NC_020421	TCAAGT	2	12	3699	3710	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	189485777
104	NC_020421	CAG	2	6	3713	3718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189485777
105	NC_020421	CAA	3	9	3736	3744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485777
106	NC_020421	CAA	2	6	3823	3828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485777
107	NC_020421	AGAGGC	2	12	3837	3848	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	189485777
108	NC_020421	TGA	2	6	3897	3902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189485777
109	NC_020421	AT	3	6	3995	4000	50 %	50 %	0 %	0 %	189485777
110	NC_020421	ACC	3	9	4022	4030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189485777
111	NC_020421	ACCT	2	8	4049	4056	25 %	25 %	0 %	50 %	189485777
112	NC_020421	AAC	2	6	4103	4108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485777
113	NC_020421	CAA	2	6	4123	4128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485777
114	NC_020421	CAA	2	6	4144	4149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485777
115	NC_020421	CAA	2	6	4204	4209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485777
116	NC_020421	CAA	2	6	4213	4218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485777
117	NC_020421	ATT	2	6	4281	4286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485777
118	NC_020421	TA	3	6	4296	4301	50 %	50 %	0 %	0 %	189485777
119	NC_020421	A	6	6	4313	4318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020421	CTG	2	6	4353	4358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_020421	TA	3	6	4439	4444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020421	ACC	2	6	4457	4462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_020421	A	6	6	4471	4476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020421	AT	3	6	4503	4508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020421	A	7	7	4565	4571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020421	ATA	2	6	4575	4580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020421	ATA	2	6	4584	4589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020421	TAAT	2	8	4668	4675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020421	A	6	6	4676	4681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020421	GTT	2	6	4682	4687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020421	A	6	6	4688	4693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020421	A	7	7	4726	4732	100 %	0 %	0 %	0 %	189485778
133	NC_020421	TGT	2	6	4751	4756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189485778
134	NC_020421	ATG	2	6	4814	4819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189485778
135	NC_020421	TTCAAC	2	12	4821	4832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189485778
136	NC_020421	CCTACT	2	12	4852	4863	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	189485778
137	NC_020421	CCTACT	2	12	4882	4893	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	189485778
138	NC_020421	CCTACT	2	12	4912	4923	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	189485778
139	NC_020421	CCTACT	2	12	4942	4953	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	189485778
140	NC_020421	CCTACT	2	12	4972	4983	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	189485778
141	NC_020421	CCTACT	2	12	5002	5013	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	189485778
142	NC_020421	GGATGA	2	12	5097	5108	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	189485778
143	NC_020421	TTA	2	6	5109	5114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485778
144	NC_020421	TGA	3	9	5148	5156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189485778
145	NC_020421	TAG	2	6	5204	5209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189485778
146	NC_020421	TTA	3	9	5266	5274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020421	AATT	2	8	5346	5353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020421	T	8	8	5397	5404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020421	T	6	6	5545	5550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020421	A	6	6	5552	5557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020421	CT	3	6	5584	5589	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_020421	ACT	2	6	5597	5602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_020421	TAC	2	6	5607	5612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_020421	A	6	6	5665	5670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_020421	A	6	6	5674	5679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.