MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermococcus litoralis DSM 5473

Total Repeats: 4586

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022084	AGG	3	9	10	18	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022084	TTC	2	6	36	41	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_022084	TGAA	2	8	72	79	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022084	A	6	6	78	83	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022084	TTC	2	6	103	108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_022084	CTTG	2	8	130	137	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_022084	TTC	2	6	169	174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_022084	TTC	2	6	236	241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_022084	TTC	2	6	305	310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_022084	TTC	2	6	375	380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_022084	TTC	2	6	448	453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_022084	TTC	2	6	516	521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_022084	TTC	2	6	583	588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_022084	AAT	2	6	627	632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022084	TTC	2	6	649	654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_022084	TTC	2	6	716	721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_022084	TTC	2	6	784	789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_022084	ATT	2	6	824	829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022084	TTC	2	6	852	857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_022084	CT	3	6	899	904	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_022084	TTC	2	6	921	926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_022084	TTTC	2	8	984	991	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_022084	TTC	2	6	994	999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_022084	TTC	2	6	1062	1067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_022084	ACC	2	6	1083	1088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_022084	TCT	2	6	1110	1115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_022084	TTC	2	6	1128	1133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_022084	AT	3	6	1160	1165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022084	GAAC	2	8	1168	1175	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_022084	TTC	2	6	1194	1199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_022084	TTC	2	6	1262	1267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_022084	TTC	2	6	1335	1340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_022084	TTC	2	6	1406	1411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_022084	TTC	2	6	1474	1479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_022084	AAT	2	6	1518	1523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022084	TTC	2	6	1540	1545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_022084	TTC	2	6	1607	1612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_022084	TTC	2	6	1675	1680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_022084	TCG	2	6	1716	1721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_022084	TTC	2	6	1741	1746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_022084	TC	3	6	1784	1789	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_022084	TTC	2	6	1807	1812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_022084	ACG	2	6	1833	1838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_022084	CTTT	2	8	1867	1874	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_022084	TTC	2	6	1878	1883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_022084	A	6	6	1931	1936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022084	TTTC	2	8	1937	1944	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_022084	TTC	2	6	1947	1952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_022084	GGC	2	6	1983	1988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_022084	TTC	2	6	2015	2020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_022084	GAA	2	6	2061	2066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022084	TTC	2	6	2080	2085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_022084	TTC	2	6	2151	2156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_022084	GCG	2	6	2186	2191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_022084	TTC	2	6	2216	2221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_022084	TTTC	2	8	2270	2277	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_022084	TTC	2	6	2280	2285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_022084	TTC	2	6	2346	2351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_022084	GTG	2	6	2369	2374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022084	TTC	2	6	2415	2420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_022084	TTC	2	6	2482	2487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_022084	AAG	2	6	2506	2511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022084	TTC	2	6	2550	2555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_022084	TGG	2	6	2587	2592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022084	TTC	2	6	2620	2625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_022084	T	6	6	2661	2666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022084	TTC	2	6	2688	2693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_022084	TAC	2	6	2735	2740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_022084	TTC	2	6	2757	2762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_022084	AGA	2	6	2896	2901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022084	CACT	2	8	2910	2917	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_022084	T	6	6	2933	2938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022084	TAA	2	6	3005	3010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022084	A	6	6	3025	3030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022084	GAG	2	6	3045	3050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022084	A	6	6	3094	3099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022084	CCT	2	6	3130	3135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_022084	A	6	6	3257	3262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022084	AAAG	2	8	3267	3274	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022084	ACC	2	6	9133	9138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_022084	TAA	2	6	10505	10510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022084	T	7	7	10546	10552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022084	GAG	2	6	10561	10566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022084	ATC	2	6	18463	18468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_022084	TAG	2	6	18484	18489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022084	CAA	2	6	18525	18530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_022084	GAA	2	6	18558	18563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022084	TTA	2	6	18574	18579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022084	AAG	2	6	18602	18607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022084	ACC	2	6	22458	22463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_022084	ATT	2	6	22471	22476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022084	AAT	2	6	22516	22521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022084	AGGTA	2	10	22526	22535	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022084	AT	3	6	22537	22542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022084	AAT	2	6	22597	22602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022084	CAT	2	6	23975	23980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_022084	CAA	2	6	24078	24083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_022084	ACA	2	6	26269	26274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_022084	AGGTG	2	10	26288	26297	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022084	TTTA	2	8	27858	27865	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022084	TA	3	6	29329	29334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022084	AAT	2	6	29380	29385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022084	A	7	7	29420	29426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022084	A	6	6	29433	29438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022084	CCA	2	6	32249	32254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_022084	AT	3	6	32277	32282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022084	GAA	2	6	32301	32306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022084	TCACC	2	10	33567	33576	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
109	NC_022084	CCTT	2	8	33577	33584	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_022084	CGG	3	9	34050	34058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_022084	CTC	2	6	34080	34085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_022084	GCT	2	6	34150	34155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_022084	CGG	2	6	34178	34183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_022084	C	6	6	34346	34351	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
115	NC_022084	CCG	2	6	34360	34365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_022084	TA	3	6	34390	34395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022084	ATC	2	6	34407	34412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_022084	CA	3	6	35440	35445	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_022084	G	6	6	35499	35504	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022084	ACC	2	6	36381	36386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_022084	AAGTG	2	10	36481	36490	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022084	TTAT	3	12	39424	39435	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022084	TC	3	6	41460	41465	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_022084	A	6	6	41494	41499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022084	TAAA	2	8	41524	41531	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022084	TTAC	2	8	41540	41547	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_022084	TTG	2	6	41558	41563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022084	GAT	2	6	44035	44040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022084	AG	3	6	44858	44863	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022084	TG	3	6	44878	44883	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022084	TCA	2	6	44933	44938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_022084	GTT	2	6	46044	46049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022084	AT	3	6	46056	46061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022084	T	6	6	46061	46066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022084	TC	4	8	48130	48137	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_022084	CAC	2	6	51857	51862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_022084	GCTT	2	8	51879	51886	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_022084	AAT	2	6	51891	51896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022084	CAC	2	6	51931	51936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_022084	GAA	2	6	51991	51996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022084	TAA	2	6	52717	52722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022084	A	7	7	52730	52736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022084	TTA	2	6	55066	55071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022084	AAT	3	9	55132	55140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022084	TTAT	2	8	55169	55176	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022084	CGT	2	6	55214	55219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_022084	TACCCC	2	12	58695	58706	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_022084	CTCAT	2	10	58831	58840	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
149	NC_022084	TAC	2	6	58872	58877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_022084	GGTTTT	2	12	58895	58906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_022084	TCA	2	6	59568	59573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_022084	CT	3	6	59601	59606	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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168	NC_022084	TAA	2	6	71797	71802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_022084	T	6	6	72277	72282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_022084	TGG	2	6	77050	77055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_022084	GAA	2	6	110584	110589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
292	NC_022084	ATAG	2	8	112597	112604	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
293	NC_022084	CTG	2	6	112628	112633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
294	NC_022084	A	7	7	113559	113565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_022084	TCA	2	6	113652	113657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
296	NC_022084	ATT	2	6	113704	113709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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298	NC_022084	ATAA	2	8	118624	118631	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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301	NC_022084	A	9	9	118700	118708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
302	NC_022084	TAA	2	6	118739	118744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
303	NC_022084	GTG	2	6	118748	118753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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305	NC_022084	TCA	2	6	121645	121650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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307	NC_022084	ATAA	2	8	121660	121667	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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309	NC_022084	A	6	6	123130	123135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
310	NC_022084	TAG	2	6	123144	123149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
311	NC_022084	TAA	2	6	123151	123156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
312	NC_022084	CTG	2	6	123174	123179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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321	NC_022084	TAA	2	6	123529	123534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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329	NC_022084	A	7	7	130382	130388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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337	NC_022084	TAA	2	6	132641	132646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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352	NC_022084	A	6	6	139148	139153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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432	NC_022084	ACA	2	6	178177	178182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
433	NC_022084	GGT	2	6	178214	178219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
434	NC_022084	CCA	2	6	181581	181586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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441	NC_022084	AGA	2	6	184935	184940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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444	NC_022084	AAAG	2	8	185044	185051	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_022084	ACT	2	6	185812	185817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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453	NC_022084	ACC	2	6	185837	185842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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456	NC_022084	TC	3	6	187663	187668	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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469	NC_022084	A	6	6	193667	193672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
470	NC_022084	AT	3	6	194933	194938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_022084	CAA	2	6	194960	194965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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