MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermococcus litoralis DSM 5473

Total Repeats: 4586

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022084	CAT	2	6	415275	415280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_022084	AGA	2	6	416241	416246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_022084	AAG	2	6	417781	417786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_022084	GA	3	6	417838	417843	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_022084	CAAA	2	8	417882	417889	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1006	NC_022084	GAT	2	6	418471	418476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_022084	TAA	2	6	418642	418647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_022084	GAAA	2	8	420794	420801	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_022084	ATT	2	6	420802	420807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_022084	GAA	2	6	420815	420820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_022084	TTA	2	6	420849	420854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_022084	ACC	2	6	421209	421214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1013	NC_022084	AAT	2	6	421225	421230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_022084	AT	4	8	421708	421715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_022084	TAC	2	6	423073	423078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_022084	TTA	2	6	423089	423094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_022084	AGT	2	6	423105	423110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_022084	T	7	7	423917	423923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_022084	A	6	6	423940	423945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_022084	TCGG	2	8	423970	423977	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1021	NC_022084	TCA	2	6	430952	430957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_022084	AACA	2	8	431332	431339	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1023	NC_022084	AT	3	6	431346	431351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_022084	A	6	6	431363	431368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_022084	TCC	3	9	433466	433474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1026	NC_022084	TTTAAC	2	12	439791	439802	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1027	NC_022084	T	6	6	441938	441943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_022084	ATA	2	6	441949	441954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_022084	TA	3	6	441981	441986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_022084	T	6	6	441989	441994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_022084	ACAT	2	8	442102	442109	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1032	NC_022084	TCA	3	9	442204	442212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_022084	AGGG	2	8	442612	442619	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_022084	TTTCT	2	10	444025	444034	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1035	NC_022084	T	6	6	444034	444039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_022084	A	6	6	444059	444064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_022084	TCA	2	6	444966	444971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_022084	TGCT	2	8	444985	444992	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1039	NC_022084	TTCC	2	8	445003	445010	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1040	NC_022084	TGC	2	6	449719	449724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_022084	CTTT	2	8	449851	449858	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1042	NC_022084	AGA	2	6	449893	449898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_022084	AG	3	6	449913	449918	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_022084	A	6	6	449925	449930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_022084	TA	3	6	449933	449938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_022084	AAC	2	6	449944	449949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_022084	TGGG	2	8	449960	449967	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_022084	TC	3	6	451317	451322	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1049	NC_022084	AAT	2	6	451365	451370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_022084	A	6	6	455231	455236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_022084	TTC	2	6	456881	456886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_022084	CGT	2	6	456943	456948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_022084	TGAG	2	8	456958	456965	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_022084	AG	3	6	458888	458893	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_022084	CCT	2	6	460534	460539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1056	NC_022084	CCCT	2	8	460768	460775	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1057	NC_022084	ACC	2	6	462069	462074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1058	NC_022084	GAA	2	6	462077	462082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_022084	CCG	2	6	462194	462199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1060	NC_022084	AAT	2	6	462229	462234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_022084	CGC	2	6	462295	462300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1062	NC_022084	AGT	2	6	462321	462326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_022084	GGT	2	6	462335	462340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_022084	G	7	7	462495	462501	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_022084	TC	3	6	464546	464551	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1066	NC_022084	ATAA	2	8	464569	464576	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_022084	CTTTTG	2	12	464926	464937	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1068	NC_022084	TA	3	6	464981	464986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_022084	ATA	2	6	465009	465014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_022084	T	6	6	465582	465587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_022084	CAC	2	6	465717	465722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_022084	TTC	2	6	465771	465776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_022084	CAA	2	6	465777	465782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_022084	AT	3	6	466665	466670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_022084	CCG	2	6	467795	467800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1076	NC_022084	GAA	2	6	467833	467838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_022084	CGG	2	6	467854	467859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_022084	AGGCT	2	10	467915	467924	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1079	NC_022084	GATA	2	8	467993	468000	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_022084	CT	3	6	468013	468018	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1081	NC_022084	AACC	2	8	469267	469274	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1082	NC_022084	TA	3	6	470465	470470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_022084	GCC	2	6	470505	470510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1084	NC_022084	CTTTT	2	10	470566	470575	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1085	NC_022084	ATAA	2	8	470595	470602	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_022084	ATA	2	6	470612	470617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_022084	ATC	2	6	472290	472295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_022084	TA	3	6	480659	480664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_022084	ATT	2	6	480767	480772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_022084	TGG	2	6	480774	480779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_022084	GCC	2	6	480781	480786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1092	NC_022084	CGGG	2	8	480867	480874	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1093	NC_022084	CCG	2	6	480905	480910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1094	NC_022084	AGGCT	2	10	480918	480927	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1095	NC_022084	GAA	2	6	480943	480948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_022084	TA	3	6	480962	480967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_022084	TTA	2	6	481005	481010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_022084	GGT	2	6	481033	481038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_022084	ACC	2	6	481861	481866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1100	NC_022084	GCC	2	6	481911	481916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1101	NC_022084	GGT	2	6	481952	481957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_022084	CGG	2	6	481976	481981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_022084	GC	3	6	482020	482025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1104	NC_022084	C	6	6	482057	482062	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1105	NC_022084	CAC	2	6	482068	482073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_022084	TC	4	8	482075	482082	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1107	NC_022084	AAT	2	6	482083	482088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_022084	TTC	2	6	482095	482100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_022084	CAG	2	6	482116	482121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_022084	GGA	2	6	482205	482210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_022084	AATA	2	8	482273	482280	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_022084	GTA	2	6	482302	482307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_022084	CTA	2	6	482315	482320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_022084	CAG	2	6	482328	482333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_022084	AAT	2	6	482388	482393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_022084	ATGA	2	8	482422	482429	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_022084	TAT	2	6	482438	482443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_022084	ATT	2	6	482496	482501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_022084	CCG	2	6	482510	482515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_022084	ATGC	2	8	482592	482599	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1121	NC_022084	CTT	2	6	483098	483103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_022084	CAA	2	6	483119	483124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_022084	T	6	6	483505	483510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_022084	CCT	2	6	485210	485215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1125	NC_022084	T	7	7	485218	485224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_022084	GGAA	2	8	485234	485241	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_022084	GA	3	6	485262	485267	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_022084	TTTA	2	8	486527	486534	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_022084	T	6	6	487737	487742	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_022084	AT	3	6	487755	487760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_022084	CTT	2	6	487825	487830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_022084	TC	4	8	488766	488773	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1133	NC_022084	TAAA	2	8	488792	488799	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_022084	AAT	2	6	488833	488838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_022084	TA	3	6	488885	488890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_022084	ACAAA	2	10	488904	488913	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1137	NC_022084	ATT	2	6	488932	488937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_022084	A	6	6	488947	488952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1139	NC_022084	ACC	2	6	493036	493041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1267	NC_022084	ATGA	2	8	556042	556049	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1269	NC_022084	ATT	2	6	557467	557472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1270	NC_022084	A	7	7	557480	557486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1271	NC_022084	TC	3	6	561131	561136	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1272	NC_022084	TC	3	6	563393	563398	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1273	NC_022084	TACC	2	8	566021	566028	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1274	NC_022084	ACC	2	6	566435	566440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1417	NC_022084	TA	3	6	672128	672133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1420	NC_022084	T	9	9	672179	672187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1421	NC_022084	AATA	2	8	672234	672241	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1451	NC_022084	AG	3	6	700671	700676	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1454	NC_022084	TCC	3	9	704735	704743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1455	NC_022084	CCT	2	6	705360	705365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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