MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermococcus litoralis DSM 5473

Total Repeats: 4586

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022084	CTC	2	6	208577	208582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
502	NC_022084	TC	3	6	208599	208604	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
503	NC_022084	T	7	7	208620	208626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_022084	ATG	2	6	208634	208639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_022084	GAAA	2	8	208709	208716	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
506	NC_022084	AGT	2	6	208717	208722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_022084	GAGT	2	8	208733	208740	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
508	NC_022084	T	6	6	208910	208915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_022084	TTC	2	6	208926	208931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_022084	AGG	2	6	208966	208971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
511	NC_022084	CTAA	2	8	209062	209069	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
512	NC_022084	ATG	2	6	209194	209199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_022084	TCA	2	6	209200	209205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_022084	GAC	2	6	209254	209259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_022084	CTT	2	6	209305	209310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_022084	TAC	2	6	209320	209325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_022084	TCT	2	6	209329	209334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_022084	TTC	2	6	209336	209341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_022084	G	6	6	209377	209382	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
520	NC_022084	TATTTC	2	12	209459	209470	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
521	NC_022084	A	6	6	209515	209520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_022084	ACG	2	6	209527	209532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_022084	GAAA	2	8	209568	209575	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
524	NC_022084	ATT	2	6	209580	209585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_022084	GAAA	2	8	209634	209641	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
526	NC_022084	GAAA	2	8	209701	209708	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
527	NC_022084	AAATGA	2	12	209725	209736	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
528	NC_022084	AGCT	2	8	209835	209842	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
529	NC_022084	GAAA	2	8	209900	209907	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
530	NC_022084	AGA	2	6	209997	210002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_022084	CGA	2	6	210042	210047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_022084	CCCCG	2	10	210179	210188	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
533	NC_022084	TAC	3	9	210253	210261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_022084	AACG	2	8	210265	210272	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
535	NC_022084	AAT	2	6	210477	210482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_022084	TC	3	6	210601	210606	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
537	NC_022084	TC	3	6	210609	210614	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
538	NC_022084	T	6	6	210617	210622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_022084	CCA	2	6	210692	210697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_022084	TCC	2	6	210940	210945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
541	NC_022084	CTG	2	6	211092	211097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_022084	CTT	2	6	211155	211160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_022084	GTA	2	6	211355	211360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_022084	AAG	2	6	211401	211406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_022084	ATG	2	6	211608	211613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_022084	AGTG	2	8	211940	211947	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
547	NC_022084	TC	4	8	212156	212163	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
548	NC_022084	AGA	2	6	212193	212198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_022084	TGT	2	6	212241	212246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_022084	AGA	2	6	212261	212266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_022084	CCA	2	6	214976	214981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
552	NC_022084	T	6	6	214985	214990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_022084	GGA	2	6	215014	215019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
554	NC_022084	AT	3	6	216780	216785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_022084	AAG	2	6	216819	216824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_022084	GAGG	2	8	216835	216842	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
557	NC_022084	A	6	6	219142	219147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_022084	A	6	6	219181	219186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_022084	A	6	6	220151	220156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_022084	CCT	2	6	220595	220600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_022084	TCAC	2	8	220666	220673	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
562	NC_022084	AGA	2	6	220723	220728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_022084	T	6	6	224145	224150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_022084	A	6	6	224154	224159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_022084	GTT	2	6	224174	224179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_022084	AGT	2	6	224191	224196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_022084	CAAAG	2	10	226967	226976	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
568	NC_022084	ACA	2	6	226986	226991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_022084	TGGG	2	8	227683	227690	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
570	NC_022084	GA	3	6	227691	227696	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
571	NC_022084	TA	3	6	228002	228007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_022084	CTT	2	6	228008	228013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_022084	CTT	2	6	228016	228021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_022084	TTCC	2	8	230666	230673	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
575	NC_022084	TA	3	6	230710	230715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_022084	ATT	2	6	230766	230771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_022084	TTA	2	6	230778	230783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_022084	TGA	2	6	230838	230843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_022084	TA	3	6	230853	230858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_022084	ATTTT	2	10	233360	233369	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_022084	ATG	2	6	239457	239462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_022084	ATC	2	6	239494	239499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_022084	TA	3	6	239505	239510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_022084	GTG	2	6	239531	239536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
585	NC_022084	ACC	2	6	241670	241675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_022084	T	6	6	243844	243849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_022084	TAAA	2	8	243882	243889	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_022084	A	6	6	246106	246111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_022084	ACC	2	6	247407	247412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
590	NC_022084	T	6	6	247459	247464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_022084	TA	3	6	249772	249777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_022084	GAA	2	6	249995	250000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_022084	ATC	2	6	251775	251780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_022084	TCT	2	6	251796	251801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_022084	A	6	6	251815	251820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_022084	TAA	2	6	251911	251916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_022084	TGAT	2	8	251923	251930	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
598	NC_022084	AT	3	6	251929	251934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_022084	A	6	6	251992	251997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_022084	A	6	6	253286	253291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_022084	C	6	6	254821	254826	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
602	NC_022084	AAG	2	6	254829	254834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_022084	ACTT	2	8	254844	254851	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
604	NC_022084	GGT	2	6	254861	254866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
605	NC_022084	AGA	2	6	254882	254887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_022084	T	6	6	255960	255965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_022084	C	6	6	256415	256420	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
608	NC_022084	AGT	2	6	256456	256461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_022084	GAT	2	6	256476	256481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_022084	GATT	2	8	256507	256514	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
611	NC_022084	TAGA	2	8	263097	263104	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
612	NC_022084	TAT	2	6	263420	263425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_022084	TCT	2	6	263432	263437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_022084	TCA	2	6	263440	263445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_022084	GTT	2	6	264748	264753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_022084	TGAT	2	8	264780	264787	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
617	NC_022084	TCT	2	6	265458	265463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_022084	G	6	6	265513	265518	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
619	NC_022084	AAC	2	6	267506	267511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_022084	ATTTT	2	10	267518	267527	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_022084	CA	3	6	267613	267618	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
622	NC_022084	CGA	2	6	267647	267652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_022084	A	6	6	267716	267721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_022084	T	6	6	267741	267746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_022084	AAAAC	2	10	267804	267813	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
626	NC_022084	TA	3	6	267862	267867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_022084	AC	3	6	267880	267885	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
628	NC_022084	CGG	2	6	267970	267975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_022084	GGT	2	6	268004	268009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
630	NC_022084	CTT	2	6	268096	268101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_022084	AG	3	6	268236	268241	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
632	NC_022084	AGG	2	6	268264	268269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
633	NC_022084	TTCT	2	8	268273	268280	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
634	NC_022084	AGA	2	6	268309	268314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
635	NC_022084	AGT	2	6	268483	268488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_022084	CGT	2	6	268606	268611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_022084	CAA	2	6	268654	268659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_022084	GGA	2	6	268675	268680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
639	NC_022084	TGAA	2	8	268704	268711	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
640	NC_022084	AAG	2	6	268793	268798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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