MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thalassolituus oleivorans MIL-1 complete genome

Total Repeats: 7385

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020888	TGGC	2	8	11	18	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_020888	AATT	2	8	3908	3915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020888	TGT	2	6	6364	6369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020888	T	6	6	6393	6398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020888	AATCA	2	10	6437	6446	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_020888	TGG	2	6	6455	6460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020888	TTA	2	6	7214	7219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020888	A	6	6	7219	7224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020888	TGT	2	6	7971	7976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020888	ATG	2	6	7980	7985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020888	AAT	2	6	8003	8008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020888	AGG	2	6	10260	10265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020888	TGA	2	6	10674	10679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020888	TTA	2	6	10694	10699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020888	A	6	6	10782	10787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020888	TCA	2	6	11458	11463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_020888	ATA	2	6	11486	11491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020888	CTA	2	6	12633	12638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020888	CA	3	6	12748	12753	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_020888	ACTGC	2	10	12772	12781	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_020888	T	6	6	14349	14354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020888	TGTA	2	8	15472	15479	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020888	TAA	2	6	15505	15510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020888	GCG	2	6	15512	15517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_020888	AAG	2	6	15523	15528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020888	AAAG	2	8	16127	16134	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020888	TAAA	2	8	16199	16206	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020888	A	6	6	16204	16209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020888	CAG	2	6	16240	16245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_020888	TGCG	2	8	19366	19373	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_020888	TGG	2	6	19439	19444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020888	CGC	2	6	19458	19463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_020888	A	6	6	19574	19579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020888	CTCC	2	8	19590	19597	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
35	NC_020888	AGG	2	6	20510	20515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020888	AGG	2	6	20553	20558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020888	A	7	7	21706	21712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020888	T	6	6	21742	21747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020888	CT	3	6	23251	23256	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_020888	GCCT	2	8	23327	23334	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_020888	GTC	2	6	23360	23365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_020888	A	6	6	24285	24290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020888	T	7	7	24317	24323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020888	TAT	2	6	26638	26643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020888	CAGC	2	8	30496	30503	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_020888	TCC	2	6	32073	32078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_020888	TCG	2	6	32097	32102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_020888	TGT	2	6	32663	32668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020888	TTGTT	2	10	32676	32685	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020888	GGT	2	6	32689	32694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020888	AGC	2	6	32697	32702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_020888	GAAT	2	8	32735	32742	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020888	TAAG	2	8	32748	32755	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020888	TTG	2	6	32799	32804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020888	ACCT	2	8	33429	33436	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_020888	T	6	6	33522	33527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020888	A	8	8	34943	34950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020888	T	7	7	34968	34974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020888	A	6	6	39727	39732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020888	T	6	6	39750	39755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020888	TAT	2	6	41224	41229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020888	A	6	6	44420	44425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020888	TAA	2	6	44433	44438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020888	TTTA	2	8	44466	44473	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020888	TTA	2	6	45319	45324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020888	A	8	8	45363	45370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020888	TCC	2	6	45376	45381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_020888	CAAA	2	8	45384	45391	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_020888	GCC	2	6	45442	45447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_020888	TAA	3	9	45491	45499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020888	AAC	2	6	45707	45712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_020888	TTCAT	2	10	45715	45724	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_020888	T	7	7	50577	50583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020888	ATAA	2	8	50584	50591	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020888	A	6	6	50590	50595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020888	AAGC	2	8	54381	54388	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_020888	T	6	6	54524	54529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020888	TTA	2	6	54567	54572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020888	TAA	2	6	56160	56165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020888	TTTGTT	2	12	56219	56230	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020888	T	7	7	57206	57212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020888	AATTA	2	10	59024	59033	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020888	A	6	6	59085	59090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020888	TGC	2	6	59122	59127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_020888	AG	4	8	59196	59203	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020888	A	6	6	61254	61259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020888	T	6	6	61278	61283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020888	CTAA	2	8	63637	63644	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_020888	TTAT	2	8	63723	63730	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020888	TTA	2	6	63843	63848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020888	GCA	2	6	65905	65910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_020888	TGC	2	6	65915	65920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_020888	CGC	2	6	65966	65971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_020888	GCC	2	6	66063	66068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_020888	AAG	2	6	68793	68798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020888	GAAT	2	8	69641	69648	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020888	CGTC	2	8	69759	69766	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_020888	TAA	2	6	71208	71213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020888	AG	3	6	71223	71228	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020888	TTC	2	6	77796	77801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_020888	AAT	2	6	77827	77832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020888	TAT	2	6	77850	77855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020888	TAA	2	6	80580	80585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020888	GTTTC	2	10	80587	80596	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_020888	AAT	2	6	80614	80619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020888	A	6	6	82314	82319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020888	TAT	2	6	82327	82332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020888	GAC	2	6	82368	82373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_020888	AGT	2	6	83108	83113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020888	ATT	2	6	83838	83843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020888	TGC	2	6	83873	83878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_020888	CCG	2	6	83882	83887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_020888	TCGG	2	8	83925	83932	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_020888	A	7	7	83952	83958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020888	GGC	2	6	83959	83964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_020888	TCA	2	6	83979	83984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_020888	CAG	2	6	84631	84636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_020888	TC	4	8	84966	84973	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_020888	TA	3	6	85061	85066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020888	A	6	6	85797	85802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020888	T	6	6	85819	85824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020888	T	8	8	87710	87717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020888	GATA	2	8	87763	87770	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020888	TAA	2	6	87838	87843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020888	ATT	2	6	87845	87850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020888	TGA	2	6	87882	87887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020888	TTA	2	6	87895	87900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020888	AAT	2	6	87971	87976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020888	GTT	2	6	88035	88040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020888	TTC	2	6	88091	88096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_020888	T	7	7	88156	88162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020888	TTG	2	6	88169	88174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020888	T	7	7	88450	88456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020888	T	7	7	88550	88556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020888	T	7	7	88601	88607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020888	CT	3	6	88677	88682	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_020888	AC	3	6	88746	88751	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_020888	ATT	2	6	90367	90372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020888	ATT	2	6	93232	93237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020888	AT	3	6	94595	94600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020888	AAT	2	6	94615	94620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020888	ATT	2	6	96255	96260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020888	GGCC	2	8	96261	96268	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_020888	ACAA	2	8	96310	96317	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_020888	ATGG	2	8	98560	98567	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020888	TGC	2	6	98594	98599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_020888	TAAAAG	2	12	98632	98643	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020888	CTC	2	6	98917	98922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_020888	TAA	2	6	101082	101087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020888	GCGG	2	8	101117	101124	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
151	NC_020888	AGC	2	6	101143	101148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_020888	CAA	2	6	101154	101159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_020888	AAGC	2	8	101173	101180	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
154	NC_020888	CCA	2	6	101265	101270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
155	NC_020888	TCA	2	6	101327	101332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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157	NC_020888	ACC	2	6	101374	101379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
158	NC_020888	CAT	2	6	101388	101393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_020888	T	6	6	102374	102379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_020888	ATT	2	6	102381	102386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_020888	TCA	2	6	102466	102471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_020888	ATA	2	6	105328	105333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_020888	TTG	2	6	105464	105469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
167	NC_020888	GTG	2	6	105482	105487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_020888	ATT	2	6	110326	110331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_020888	CAA	2	6	110334	110339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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175	NC_020888	ATAG	2	8	113565	113572	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
176	NC_020888	A	6	6	114213	114218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_020888	TTG	2	6	115820	115825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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180	NC_020888	GTG	2	6	115998	116003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
181	NC_020888	T	6	6	116008	116013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_020888	TGC	2	6	116069	116074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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185	NC_020888	GAC	2	6	119633	119638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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193	NC_020888	TAT	2	6	124371	124376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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261	NC_020888	A	7	7	174506	174512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_020888	GAT	2	6	174516	174521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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264	NC_020888	AGTTA	2	10	175973	175982	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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271	NC_020888	T	6	6	180123	180128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_020888	TGGCC	2	10	180134	180143	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
273	NC_020888	ATA	2	6	180184	180189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_020888	CTTA	2	8	180199	180206	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
275	NC_020888	AGC	2	6	180207	180212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
276	NC_020888	A	6	6	180622	180627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_020888	T	6	6	180643	180648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_020888	TGATCG	2	12	180651	180662	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
279	NC_020888	GCTC	2	8	183186	183193	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
280	NC_020888	CGCTG	2	10	184155	184164	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
281	NC_020888	CAA	2	6	185078	185083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_020888	CCA	2	6	185121	185126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
283	NC_020888	CAC	2	6	185134	185139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
284	NC_020888	TGC	2	6	185199	185204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
285	NC_020888	T	6	6	185250	185255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_020888	AAAC	2	8	186982	186989	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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427	NC_020888	CCTT	2	8	283472	283479	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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489	NC_020888	CGT	2	6	341325	341330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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