MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum M0795 plasmid pTHETHE01

Total Repeats: 557

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019956	T	7	7	8	14	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019956	TAAAA	2	10	16	25	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019956	GAG	2	6	26	31	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019956	TA	3	6	1604	1609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019956	CTTT	2	8	1967	1974	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_019956	ATC	2	6	2224	2229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019956	CTAT	2	8	2256	2263	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_019956	AATA	2	8	2272	2279	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019956	TAA	3	9	2287	2295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019956	ATA	2	6	2296	2301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019956	A	7	7	2301	2307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019956	CT	3	6	5255	5260	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_019956	AAC	2	6	5322	5327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_019956	TAC	2	6	5879	5884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_019956	CCT	2	6	6990	6995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_019956	CTC	2	6	8675	8680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_019956	TTAT	2	8	8683	8690	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019956	AT	3	6	8698	8703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019956	A	6	6	8704	8709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019956	T	6	6	8711	8716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019956	TAA	2	6	8771	8776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019956	CAG	2	6	8962	8967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_019956	A	6	6	9078	9083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019956	AAT	2	6	9091	9096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019956	TAT	2	6	9949	9954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019956	ATC	2	6	10433	10438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_019956	AAT	2	6	10666	10671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019956	TCC	2	6	12449	12454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_019956	A	7	7	12461	12467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019956	TA	3	6	12478	12483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019956	TA	3	6	12488	12493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019956	AT	3	6	12501	12506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019956	ATA	2	6	12528	12533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019956	TTA	2	6	12539	12544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019956	A	9	9	12555	12563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019956	ATT	2	6	12578	12583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019956	TTAT	2	8	12592	12599	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019956	T	6	6	12599	12604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019956	AGA	2	6	13893	13898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019956	ATCTC	2	10	15104	15113	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_019956	AAC	3	9	16361	16369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_019956	T	6	6	17271	17276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019956	TAC	2	6	17282	17287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_019956	A	8	8	17291	17298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019956	CTT	2	6	17324	17329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_019956	TTG	2	6	17345	17350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019956	AAT	2	6	17371	17376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019956	TAA	3	9	17423	17431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019956	AT	3	6	17433	17438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019956	ATC	2	6	17451	17456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019956	CAA	2	6	17510	17515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_019956	ATA	2	6	17540	17545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019956	CAA	2	6	17573	17578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_019956	AAT	2	6	17588	17593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019956	ATTA	2	8	17607	17614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019956	GAC	2	6	17620	17625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_019956	T	6	6	17679	17684	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019956	TGTAA	2	10	17691	17700	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019956	ATA	2	6	17705	17710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019956	ATT	2	6	17715	17720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019956	ATC	2	6	17760	17765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_019956	A	6	6	17790	17795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019956	AATA	2	8	17829	17836	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019956	GTT	2	6	17893	17898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019956	TTA	2	6	17927	17932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019956	ATT	2	6	17949	17954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019956	T	8	8	17963	17970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019956	TTA	2	6	17986	17991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019956	AAC	2	6	17995	18000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_019956	CCT	2	6	18652	18657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_019956	CAA	2	6	18691	18696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_019956	TATAA	2	10	18697	18706	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019956	A	6	6	18735	18740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019956	TAT	2	6	18741	18746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019956	A	7	7	18756	18762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019956	AT	3	6	18778	18783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019956	A	6	6	18814	18819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019956	AAG	2	6	18869	18874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019956	A	6	6	18883	18888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019956	ATA	2	6	18899	18904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019956	T	6	6	18975	18980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019956	ATT	2	6	18981	18986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019956	TTG	2	6	19018	19023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019956	GAT	2	6	19041	19046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019956	CAA	2	6	19064	19069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_019956	GTG	2	6	19147	19152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019956	ATT	2	6	19195	19200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019956	ACA	2	6	19206	19211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_019956	A	6	6	19211	19216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019956	CTG	2	6	19226	19231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_019956	ACC	2	6	21954	21959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_019956	CCT	2	6	23791	23796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_019956	T	6	6	24728	24733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019956	TA	3	6	24829	24834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019956	TATAAA	2	12	24836	24847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019956	CAA	2	6	24853	24858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_019956	A	7	7	24865	24871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019956	TAAA	2	8	24872	24879	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019956	A	7	7	24906	24912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019956	TA	3	6	24924	24929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019956	ATC	2	6	24931	24936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_019956	TTAT	2	8	24977	24984	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019956	TGAC	2	8	25016	25023	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_019956	TA	3	6	25032	25037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019956	CAA	2	6	25068	25073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_019956	CCATC	2	10	25136	25145	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
107	NC_019956	TGA	2	6	25151	25156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019956	TAT	2	6	25171	25176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019956	ATC	2	6	25177	25182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_019956	CGG	2	6	25209	25214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_019956	T	7	7	25266	25272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019956	ATC	3	9	25282	25290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_019956	CGT	2	6	25308	25313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_019956	GAA	2	6	25314	25319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019956	TCTTTT	2	12	25418	25429	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_019956	TGT	2	6	25450	25455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019956	ATC	2	6	25456	25461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_019956	AAT	2	6	25475	25480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019956	TA	3	6	25489	25494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019956	ATC	2	6	25496	25501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_019956	CT	3	6	25910	25915	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_019956	TCC	2	6	26159	26164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_019956	TCA	2	6	32739	32744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_019956	AATTA	2	10	32748	32757	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019956	TAT	2	6	32794	32799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019956	TTA	2	6	32801	32806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019956	TAT	2	6	32816	32821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019956	A	6	6	32824	32829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019956	ATA	2	6	32850	32855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019956	AGG	2	6	32883	32888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019956	TCC	2	6	33790	33795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_019956	TCA	2	6	34542	34547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_019956	TCC	2	6	35566	35571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_019956	AGAT	2	8	36016	36023	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019956	CTTT	2	8	36031	36038	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_019956	A	6	6	36039	36044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019956	AAT	2	6	36048	36053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019956	T	6	6	36053	36058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019956	A	8	8	36104	36111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019956	GAA	2	6	36143	36148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019956	T	7	7	36150	36156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019956	G	6	6	36157	36162	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019956	ATG	2	6	36174	36179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019956	TAT	2	6	36200	36205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019956	TA	3	6	36211	36216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019956	AAT	2	6	36218	36223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019956	CCT	2	6	38582	38587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_019956	TAA	2	6	38599	38604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019956	ATATG	2	10	38608	38617	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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