MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thioflavicoccus mobilis 8321 plasmid pTHIMO01

Total Repeats: 230

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019941	CGC	2	6	242	247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_019941	GAC	2	6	278	283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019941	CAT	2	6	315	320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019941	CAA	2	6	402	407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019941	GGC	3	9	427	435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_019941	TTC	2	6	461	466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019941	CGT	2	6	509	514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019941	CCCCG	2	10	622	631	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
9	NC_019941	TTA	2	6	682	687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019941	CCG	2	6	715	720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_019941	CA	3	6	1648	1653	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_019941	GGC	2	6	1663	1668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019941	CAA	2	6	2918	2923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_019941	ACT	2	6	2927	2932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_019941	TCC	2	6	2946	2951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_019941	CGCGGC	2	12	2973	2984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_019941	GGCCC	2	10	3010	3019	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
18	NC_019941	CGGC	2	8	3100	3107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_019941	GAG	2	6	3113	3118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019941	GCA	2	6	3183	3188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_019941	CTC	2	6	3430	3435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_019941	CTG	2	6	3488	3493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_019941	GC	3	6	3512	3517	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_019941	GC	3	6	3622	3627	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_019941	GCC	2	6	3635	3640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_019941	GAC	2	6	3641	3646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_019941	CTA	2	6	3691	3696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_019941	CCTG	2	8	3720	3727	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_019941	CGG	2	6	3732	3737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_019941	CCA	2	6	3742	3747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_019941	GCT	2	6	3751	3756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_019941	TGG	2	6	3785	3790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019941	CGC	2	6	3820	3825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_019941	CGA	2	6	3838	3843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_019941	ACG	2	6	3879	3884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_019941	TCC	2	6	3918	3923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_019941	GCC	2	6	3926	3931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_019941	GTG	2	6	3936	3941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019941	CCG	2	6	3952	3957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_019941	CCGGG	2	10	3976	3985	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
41	NC_019941	AAG	3	9	4013	4021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019941	CGA	2	6	4051	4056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_019941	GAG	2	6	4079	4084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019941	CTG	2	6	4118	4123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_019941	CTG	2	6	4172	4177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_019941	ACC	2	6	4191	4196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_019941	ACCG	2	8	4466	4473	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_019941	GAT	2	6	4482	4487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019941	AAC	2	6	4525	4530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_019941	TAG	2	6	7811	7816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019941	AAATC	2	10	10913	10922	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_019941	AGTT	2	8	12295	12302	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019941	TCA	2	6	12335	12340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_019941	CAAT	2	8	12370	12377	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_019941	GAC	2	6	12415	12420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_019941	GC	3	6	12421	12426	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_019941	GCG	2	6	12436	12441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_019941	CGC	2	6	12503	12508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_019941	TCC	2	6	12581	12586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_019941	GGC	2	6	12616	12621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_019941	TCG	2	6	12653	12658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_019941	ATC	2	6	12662	12667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_019941	GC	3	6	12683	12688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_019941	CTC	2	6	12691	12696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_019941	GGC	2	6	12744	12749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019941	TTC	2	6	12780	12785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_019941	CCGC	2	8	12787	12794	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
68	NC_019941	GC	3	6	12793	12798	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_019941	GCT	2	6	12812	12817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_019941	ACC	2	6	12838	12843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_019941	CGC	2	6	15108	15113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_019941	CGTAG	2	10	15165	15174	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_019941	CGG	2	6	15204	15209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_019941	GGCGG	2	10	15228	15237	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
75	NC_019941	CGG	2	6	15380	15385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_019941	AGA	2	6	15386	15391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019941	CGC	2	6	15521	15526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_019941	CTG	2	6	15555	15560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_019941	C	6	6	15581	15586	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
80	NC_019941	C	6	6	15617	15622	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
81	NC_019941	GATG	2	8	15656	15663	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019941	TGG	2	6	15724	15729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019941	CGG	2	6	15794	15799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_019941	CCTC	2	8	15832	15839	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
85	NC_019941	GCA	2	6	15853	15858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_019941	CTCCGG	3	18	15890	15907	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
87	NC_019941	CGA	2	6	15955	15960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_019941	GAA	2	6	16015	16020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019941	CGA	2	6	16048	16053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_019941	GCT	2	6	16123	16128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_019941	GCAC	2	8	16143	16150	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_019941	CGG	2	6	16195	16200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_019941	CG	3	6	16210	16215	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_019941	TTC	2	6	16254	16259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_019941	GGC	2	6	16271	16276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_019941	GGC	2	6	16291	16296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_019941	AGC	2	6	16299	16304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_019941	TCG	2	6	16314	16319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_019941	GAT	2	6	16334	16339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019941	CTC	2	6	16430	16435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_019941	CGG	2	6	16459	16464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_019941	GTC	2	6	16700	16705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_019941	G	6	6	20655	20660	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019941	TCTG	2	8	20680	20687	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_019941	TGC	2	6	23517	23522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_019941	GC	3	6	23543	23548	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_019941	TGC	2	6	23549	23554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_019941	CGCCC	2	10	24227	24236	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
109	NC_019941	CATC	2	8	24279	24286	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_019941	AGC	2	6	24299	24304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_019941	CAT	2	6	25685	25690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_019941	CTT	2	6	26331	26336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_019941	GCC	2	6	26472	26477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_019941	GGC	2	6	26485	26490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_019941	GCG	2	6	26525	26530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_019941	CAG	2	6	28820	28825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_019941	CG	4	8	28839	28846	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_019941	GAA	2	6	28853	28858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019941	GCG	2	6	29420	29425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_019941	GC	3	6	29472	29477	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_019941	ACA	2	6	29482	29487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_019941	GCAGCC	2	12	29493	29504	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
123	NC_019941	GAAGG	2	10	29505	29514	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019941	GGCGC	2	10	29527	29536	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
125	NC_019941	GCA	2	6	29579	29584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_019941	CGGA	2	8	29651	29658	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_019941	CGCTA	2	10	29710	29719	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_019941	GCCT	2	8	29738	29745	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_019941	CT	3	6	29744	29749	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_019941	CGC	2	6	29778	29783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_019941	CCA	2	6	29831	29836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_019941	AAGA	2	8	29849	29856	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019941	GGC	2	6	29891	29896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_019941	GAAG	2	8	29931	29938	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019941	CG	3	6	33288	33293	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_019941	TCT	2	6	33365	33370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_019941	CGT	2	6	33398	33403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_019941	TGGAC	2	10	33518	33527	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_019941	GAAAA	2	10	33672	33681	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019941	CCGG	2	8	33754	33761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_019941	ACG	2	6	33909	33914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_019941	GCG	2	6	36117	36122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_019941	CCCTG	2	10	36128	36137	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
144	NC_019941	CCG	2	6	36284	36289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_019941	CG	3	6	36293	36298	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_019941	CT	3	6	38105	38110	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_019941	GC	3	6	38503	38508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_019941	CT	3	6	38947	38952	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_019941	TCC	2	6	38997	39002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
150	NC_019941	CT	3	6	39199	39204	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_019941	GCG	3	9	39283	39291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_019941	CGC	2	6	39297	39302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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154	NC_019941	TGT	2	6	39853	39858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_019941	GA	3	6	39958	39963	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
158	NC_019941	GA	3	6	39968	39973	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
159	NC_019941	TC	3	6	39981	39986	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
160	NC_019941	CG	3	6	39999	40004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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167	NC_019941	CGA	2	6	41602	41607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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169	NC_019941	GCCG	2	8	41718	41725	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
170	NC_019941	A	6	6	41768	41773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_019941	GCG	2	6	41778	41783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_019941	CCT	2	6	42155	42160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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181	NC_019941	TTGT	2	8	44359	44366	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
182	NC_019941	TGC	2	6	44430	44435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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184	NC_019941	TCC	2	6	44623	44628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
185	NC_019941	CGT	2	6	44665	44670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
186	NC_019941	GGGCA	2	10	45505	45514	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
187	NC_019941	CCT	2	6	46534	46539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
188	NC_019941	CAG	2	6	46646	46651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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193	NC_019941	CG	3	6	59522	59527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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195	NC_019941	CCGG	2	8	59632	59639	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
196	NC_019941	GAG	2	6	59673	59678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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230	NC_019941	GC	3	6	76051	76056	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.