MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermobacillus composti KWC4 plasmid pTHECO01

Total Repeats: 598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019898	GAA	2	6	18	23	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019898	ATT	2	6	59	64	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019898	TAA	2	6	112	117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019898	CCTATT	2	12	2500	2511	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019898	CTC	2	6	2567	2572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_019898	A	7	7	2627	2633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019898	GAG	2	6	2726	2731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019898	A	6	6	2754	2759	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019898	A	7	7	2891	2897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019898	GACC	2	8	2930	2937	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_019898	CA	3	6	2941	2946	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_019898	CTC	2	6	3068	3073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_019898	CGG	2	6	3083	3088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_019898	CGC	2	6	3089	3094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_019898	TGA	2	6	3166	3171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019898	GGA	2	6	3188	3193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019898	CTC	2	6	3196	3201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_019898	CAG	2	6	3211	3216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019898	A	7	7	3251	3257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019898	CTAC	2	8	3296	3303	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_019898	A	7	7	3326	3332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019898	CGT	2	6	3372	3377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_019898	AACC	2	8	3394	3401	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_019898	TTA	2	6	3434	3439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019898	TTC	2	6	3440	3445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019898	A	7	7	3457	3463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019898	GCC	2	6	3483	3488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_019898	AAAT	2	8	3513	3520	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019898	CTC	2	6	3558	3563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_019898	GACT	2	8	3575	3582	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_019898	T	7	7	3607	3613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019898	CTC	2	6	3625	3630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_019898	TA	4	8	3704	3711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019898	ATT	2	6	3738	3743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019898	TA	3	6	3776	3781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019898	AAAC	2	8	3782	3789	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_019898	AAT	2	6	3808	3813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019898	GTAATA	2	12	3847	3858	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019898	AT	5	10	3864	3873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019898	A	6	6	3896	3901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019898	C	6	6	3907	3912	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
42	NC_019898	GCC	2	6	3940	3945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_019898	TGA	2	6	4007	4012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019898	T	7	7	5051	5057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019898	ATCG	2	8	5062	5069	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_019898	TGAC	2	8	5307	5314	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_019898	CT	3	6	5316	5321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_019898	AAT	2	6	5337	5342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019898	AAC	2	6	5386	5391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_019898	TAT	3	9	5403	5411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019898	A	7	7	5412	5418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019898	C	6	6	7320	7325	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
53	NC_019898	G	9	9	7336	7344	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019898	TCT	2	6	7718	7723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_019898	TCC	2	6	9846	9851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_019898	A	7	7	9863	9869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019898	A	6	6	9879	9884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019898	TTTA	2	8	9929	9936	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019898	GCT	2	6	9938	9943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_019898	CTT	2	6	9959	9964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_019898	TAT	2	6	10015	10020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019898	AATAA	2	10	10035	10044	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019898	ATGAT	2	10	10093	10102	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019898	AATA	2	8	10122	10129	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019898	CTTC	2	8	10157	10164	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_019898	GCCG	2	8	10173	10180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_019898	TGGG	2	8	10195	10202	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019898	ATT	2	6	10219	10224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019898	GAG	2	6	10230	10235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019898	CCT	2	6	10371	10376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_019898	TGA	2	6	10380	10385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019898	GA	3	6	10425	10430	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019898	ACC	2	6	10447	10452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_019898	TAT	2	6	10497	10502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019898	CTCC	2	8	11115	11122	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
76	NC_019898	ACAA	2	8	11155	11162	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_019898	GT	3	6	11163	11168	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019898	A	6	6	11204	11209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019898	GGC	2	6	11211	11216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_019898	CCT	2	6	11226	11231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_019898	C	7	7	12704	12710	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
82	NC_019898	CCT	2	6	12727	12732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_019898	TCT	2	6	13535	13540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_019898	ACA	2	6	13552	13557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_019898	TCC	2	6	13617	13622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_019898	TGC	2	6	13671	13676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_019898	CTT	2	6	13687	13692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_019898	TGC	2	6	13694	13699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_019898	CCT	2	6	13966	13971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_019898	AATG	2	8	14001	14008	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019898	TCAG	2	8	14020	14027	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_019898	GCG	2	6	14071	14076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_019898	CGT	2	6	14078	14083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_019898	TTC	2	6	14100	14105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_019898	ACCGTA	2	12	14155	14166	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_019898	CTTT	2	8	14190	14197	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_019898	CAA	2	6	14198	14203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_019898	T	6	6	14245	14250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019898	GC	3	6	14261	14266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_019898	TC	3	6	14281	14286	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_019898	CCT	2	6	15435	15440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_019898	A	7	7	15452	15458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019898	A	9	9	15467	15475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019898	TTAT	2	8	15521	15528	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019898	AGC	2	6	15539	15544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_019898	TAT	2	6	15603	15608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019898	CAA	2	6	15647	15652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_019898	AGAA	2	8	15659	15666	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019898	CCG	2	6	15673	15678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_019898	GGC	2	6	15694	15699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_019898	CTC	2	6	15729	15734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_019898	CAC	2	6	15774	15779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_019898	TTC	2	6	15801	15806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_019898	TTGAC	2	10	15812	15821	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_019898	TC	3	6	15833	15838	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_019898	AGC	2	6	15965	15970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_019898	ATT	2	6	15971	15976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019898	CTA	2	6	16030	16035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_019898	CTC	2	6	18653	18658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_019898	TCC	2	6	18674	18679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_019898	GGA	2	6	19817	19822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019898	TCC	2	6	19848	19853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_019898	GCA	2	6	22282	22287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_019898	CGT	2	6	25162	25167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_019898	AAC	2	6	25222	25227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_019898	TCA	2	6	25320	25325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_019898	ATT	2	6	25412	25417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019898	CTT	2	6	25432	25437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_019898	AAT	2	6	26372	26377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019898	CCT	2	6	26647	26652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_019898	A	7	7	26663	26669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019898	TCCT	2	8	26814	26821	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_019898	TTC	2	6	26822	26827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_019898	CCT	2	6	27074	27079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_019898	CCT	2	6	27765	27770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_019898	CCT	2	6	28195	28200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_019898	A	7	7	28219	28225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019898	A	6	6	28238	28243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019898	TTG	2	6	28296	28301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019898	CAA	2	6	28437	28442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_019898	A	6	6	28441	28446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019898	CCT	2	6	35967	35972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_019898	ATA	2	6	38275	38280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019898	ATTA	2	8	38293	38300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019898	AT	3	6	38301	38306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019898	AAAC	2	8	39513	39520	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_019898	TGA	2	6	39533	39538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019898	ACTC	2	8	39599	39606	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_019898	ATGA	2	8	39616	39623	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_019898	A	7	7	39635	39641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_019898	GAA	2	6	41371	41376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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175	NC_019898	CCGT	2	8	42550	42557	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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189	NC_019898	TAAG	2	8	43222	43229	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
190	NC_019898	AT	3	6	43304	43309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_019898	AT	3	6	43324	43329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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276	NC_019898	TAAT	2	8	71829	71836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_019898	GGA	2	6	71844	71849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_019898	AGG	2	6	79072	79077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
280	NC_019898	AAG	3	9	79188	79196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
281	NC_019898	AG	3	6	79195	79200	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
282	NC_019898	TAATA	2	10	79527	79536	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_019898	AT	3	6	79548	79553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_019898	CAA	2	6	87112	87117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_019898	A	6	6	87136	87141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_019898	GCCA	2	8	87279	87286	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
292	NC_019898	TGAG	2	8	87294	87301	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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438	NC_019898	C	6	6	119987	119992	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
439	NC_019898	ACA	2	6	119998	120003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
440	NC_019898	TAAT	3	12	120015	120026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
441	NC_019898	AT	3	6	120025	120030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_019898	ACCA	2	8	120083	120090	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
443	NC_019898	CCT	2	6	121113	121118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
444	NC_019898	CAT	2	6	121128	121133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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446	NC_019898	TGA	2	6	121263	121268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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448	NC_019898	TCA	2	6	121418	121423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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450	NC_019898	ATG	2	6	121435	121440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
451	NC_019898	CAG	2	6	121445	121450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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453	NC_019898	ATCC	2	8	121511	121518	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
454	NC_019898	TCA	2	6	121561	121566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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456	NC_019898	CTCTT	2	10	122699	122708	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
457	NC_019898	CCA	2	6	123586	123591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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459	NC_019898	ACC	2	6	124706	124711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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461	NC_019898	TCC	2	6	125494	125499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
462	NC_019898	TCCA	2	8	125527	125534	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
463	NC_019898	CAG	2	6	125603	125608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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465	NC_019898	GAT	2	6	125663	125668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
466	NC_019898	TATC	2	8	125753	125760	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
467	NC_019898	TCT	2	6	125784	125789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
468	NC_019898	TCG	2	6	125868	125873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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470	NC_019898	G	7	7	125926	125932	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
471	NC_019898	CCG	2	6	125933	125938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
472	NC_019898	CG	4	8	125937	125944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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474	NC_019898	GC	3	6	126025	126030	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
475	NC_019898	AAG	2	6	126034	126039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_019898	TGA	2	6	126309	126314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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483	NC_019898	GCC	2	6	126352	126357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
484	NC_019898	C	7	7	126356	126362	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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500	NC_019898	GCG	2	6	128344	128349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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