MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermus oshimai JL-2 plasmid pTHEOS01

Total Repeats: 550

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019387	TCA	2	6	44	49	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019387	CCTCCC	2	12	91	102	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
3	NC_019387	GCCTTG	2	12	114	125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019387	AGG	2	6	145	150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019387	AGC	2	6	1536	1541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_019387	AGG	2	6	1549	1554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019387	TGG	2	6	7303	7308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019387	GGA	2	6	7321	7326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019387	AGG	2	6	11780	11785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019387	GGA	2	6	13639	13644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019387	TCC	2	6	15520	15525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_019387	AAGC	2	8	15530	15537	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_019387	GCCA	2	8	15599	15606	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_019387	CCT	2	6	20295	20300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_019387	CAA	2	6	20333	20338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_019387	GCC	2	6	20355	20360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_019387	CGG	2	6	20401	20406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019387	AGG	2	6	20452	20457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019387	GGAT	2	8	20462	20469	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019387	CTC	2	6	20479	20484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_019387	TGG	2	6	20487	20492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019387	GGC	2	6	20498	20503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_019387	AGGG	2	8	20514	20521	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019387	C	6	6	30905	30910	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
25	NC_019387	CCT	2	6	31496	31501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_019387	GAG	2	6	31623	31628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019387	TGC	2	6	31680	31685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_019387	TCC	2	6	31996	32001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_019387	GCAA	2	8	32021	32028	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_019387	CAG	2	6	32098	32103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_019387	C	6	6	32141	32146	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
32	NC_019387	CTC	2	6	33792	33797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_019387	TCC	2	6	33819	33824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_019387	G	6	6	33892	33897	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019387	C	7	7	33912	33918	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
36	NC_019387	CCTA	2	8	36582	36589	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_019387	GAG	2	6	36617	36622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019387	CCT	2	6	37665	37670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_019387	CCTTGG	2	12	37683	37694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_019387	ATA	2	6	37752	37757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019387	CT	3	6	37765	37770	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_019387	CCT	2	6	37908	37913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_019387	TCC	2	6	41993	41998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_019387	AGG	2	6	42530	42535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019387	GTC	2	6	42548	42553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_019387	CTT	2	6	42556	42561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_019387	CCTCG	2	10	42567	42576	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
48	NC_019387	AGG	2	6	43597	43602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019387	GGC	2	6	44961	44966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_019387	GTC	2	6	45000	45005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019387	CCTGGC	2	12	45012	45023	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
52	NC_019387	TCC	2	6	45040	45045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_019387	CCT	2	6	45066	45071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_019387	GCT	2	6	45595	45600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_019387	AGA	2	6	45725	45730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019387	TGT	2	6	45826	45831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019387	AGGGCC	2	12	45887	45898	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_019387	TCC	2	6	46520	46525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_019387	C	6	6	47784	47789	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
60	NC_019387	CCA	2	6	47851	47856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_019387	GA	3	6	47869	47874	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019387	C	6	6	49042	49047	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
63	NC_019387	GCC	2	6	49115	49120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_019387	GCG	2	6	49123	49128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_019387	CAT	2	6	49133	49138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019387	CAT	2	6	49191	49196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_019387	T	6	6	49449	49454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019387	TCCC	2	8	49458	49465	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
69	NC_019387	TGGG	2	8	49485	49492	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019387	GGTG	2	8	49509	49516	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019387	CCT	2	6	49568	49573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_019387	GAG	2	6	49584	49589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019387	AAG	2	6	49594	49599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019387	AGGA	2	8	50704	50711	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019387	TTA	2	6	50726	50731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019387	GGT	2	6	50755	50760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019387	CCCAC	2	10	50814	50823	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
78	NC_019387	G	6	6	50861	50866	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019387	GGC	2	6	50887	50892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_019387	AGG	2	6	50944	50949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019387	TCC	2	6	50953	50958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_019387	ACT	2	6	50980	50985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_019387	AGG	2	6	50999	51004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019387	AGG	2	6	51040	51045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019387	GGT	2	6	51053	51058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019387	C	7	7	51102	51108	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
87	NC_019387	TGG	3	9	51109	51117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019387	CCT	2	6	51152	51157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_019387	G	6	6	51165	51170	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019387	GGTGCG	2	12	51239	51250	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_019387	GGT	2	6	51356	51361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019387	TGGTG	2	10	51408	51417	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019387	TCCC	2	8	52871	52878	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
94	NC_019387	AGG	2	6	52927	52932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019387	GGA	2	6	52942	52947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019387	CTT	2	6	52983	52988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_019387	GCG	3	9	53014	53022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_019387	GCG	2	6	53041	53046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_019387	CCT	2	6	53299	53304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_019387	GGC	2	6	54021	54026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_019387	CTC	3	9	54055	54063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_019387	GGGGA	2	10	54070	54079	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019387	CTC	2	6	54155	54160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_019387	CCGCC	2	10	54202	54211	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
105	NC_019387	TGG	2	6	54258	54263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019387	GCG	2	6	54269	54274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_019387	GGGAAG	2	12	54276	54287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019387	CTC	2	6	54320	54325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_019387	CCT	2	6	54745	54750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_019387	T	6	6	54832	54837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019387	C	8	8	54872	54879	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
112	NC_019387	C	6	6	54881	54886	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
113	NC_019387	GAGGG	2	10	54892	54901	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019387	GGA	2	6	55415	55420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019387	C	7	7	55483	55489	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
116	NC_019387	G	8	8	55557	55564	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019387	G	8	8	55568	55575	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019387	G	6	6	55590	55595	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019387	T	6	6	55596	55601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019387	GGGGGT	2	12	55622	55633	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019387	TCAA	2	8	55743	55750	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_019387	AGC	2	6	55773	55778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_019387	AGG	2	6	55847	55852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019387	GCC	2	6	55865	55870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_019387	GGA	2	6	55887	55892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019387	TCC	2	6	55929	55934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_019387	CCG	2	6	55981	55986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_019387	GAG	2	6	56003	56008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019387	GAA	2	6	56070	56075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019387	AGGC	2	8	56109	56116	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_019387	AGG	2	6	56236	56241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019387	GGT	2	6	56273	56278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019387	TGG	2	6	56314	56319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019387	TGTT	2	8	56338	56345	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019387	G	6	6	56405	56410	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019387	CGC	3	9	56584	56592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_019387	G	6	6	56624	56629	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019387	GCAAA	2	10	56703	56712	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_019387	TGGGTA	2	12	56724	56735	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019387	GAC	2	6	56779	56784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_019387	AGG	2	6	56807	56812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019387	GGT	2	6	56893	56898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019387	CTA	2	6	56938	56943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_019387	AAG	2	6	56981	56986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019387	TGGT	2	8	57060	57067	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019387	CCTAGC	2	12	57195	57206	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
147	NC_019387	TCC	2	6	57230	57235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_019387	CCT	2	6	57264	57269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_019387	CTCC	2	8	57318	57325	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
150	NC_019387	CTC	2	6	57343	57348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_019387	GA	3	6	57464	57469	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_019387	C	6	6	57472	57477	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
153	NC_019387	GGGA	2	8	57505	57512	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
154	NC_019387	GCCTT	2	10	57556	57565	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
155	NC_019387	AGT	2	6	57574	57579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_019387	C	6	6	57610	57615	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
157	NC_019387	CCCA	2	8	57638	57645	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
158	NC_019387	TCCC	2	8	57653	57660	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
159	NC_019387	C	6	6	57684	57689	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
160	NC_019387	G	6	6	57737	57742	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
161	NC_019387	G	6	6	57756	57761	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
162	NC_019387	GA	3	6	58728	58733	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
163	NC_019387	C	6	6	58772	58777	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
164	NC_019387	G	6	6	58787	58792	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
165	NC_019387	C	7	7	58803	58809	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
166	NC_019387	TGA	2	6	58887	58892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
167	NC_019387	CTG	2	6	58897	58902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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171	NC_019387	CCTT	2	8	59242	59249	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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173	NC_019387	TGG	2	6	59321	59326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
174	NC_019387	GGA	2	6	59449	59454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
175	NC_019387	GAT	2	6	59455	59460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
176	NC_019387	GTG	2	6	59465	59470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
177	NC_019387	GAG	2	6	59492	59497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
178	NC_019387	TGG	2	6	59534	59539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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180	NC_019387	CCT	2	6	68041	68046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
181	NC_019387	ACA	2	6	68490	68495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
182	NC_019387	TCC	2	6	68501	68506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
183	NC_019387	CGC	2	6	68520	68525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
184	NC_019387	G	6	6	68581	68586	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
185	NC_019387	CGTC	2	8	68608	68615	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
186	NC_019387	CGGGG	2	10	68641	68650	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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189	NC_019387	TCC	2	6	88947	88952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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193	NC_019387	CGGGG	2	10	89087	89096	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
194	NC_019387	CGC	2	6	89157	89162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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197	NC_019387	TCC	2	6	89322	89327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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251	NC_019387	GC	3	6	134224	134229	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
252	NC_019387	CGG	2	6	134244	134249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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255	NC_019387	C	6	6	136846	136851	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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270	NC_019387	GGT	2	6	148669	148674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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272	NC_019387	GGAG	2	8	148765	148772	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
273	NC_019387	CGC	2	6	151848	151853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
274	NC_019387	AAGG	2	8	151856	151863	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
275	NC_019387	GGC	2	6	151873	151878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
276	NC_019387	GGA	2	6	151900	151905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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278	NC_019387	GAG	2	6	152341	152346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
279	NC_019387	C	7	7	153245	153251	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
280	NC_019387	GCC	2	6	153275	153280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
281	NC_019387	G	6	6	154570	154575	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
282	NC_019387	CAT	2	6	154616	154621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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284	NC_019387	GCC	2	6	154747	154752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
285	NC_019387	C	6	6	154756	154761	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
286	NC_019387	GCG	2	6	154768	154773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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