MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermoanaerobacterium phage THSA-485A

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018264	TAT	2	6	34	39	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018264	A	7	7	70	76	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018264	CCT	2	6	440	445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_018264	TCC	2	6	871	876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_018264	TTTAT	2	10	877	886	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018264	TA	3	6	894	899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018264	T	6	6	910	915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018264	TAT	2	6	917	922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018264	GAA	2	6	929	934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018264	TCC	2	6	1346	1351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_018264	TC	3	6	2046	2051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_018264	TTATT	2	10	2057	2066	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018264	TCC	2	6	2393	2398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_018264	T	6	6	2882	2887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018264	TCA	2	6	3420	3425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018264	T	6	6	3432	3437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018264	ATTT	2	8	3441	3448	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018264	CTG	2	6	3483	3488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018264	TCC	2	6	4037	4042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_018264	ATTAT	2	10	4048	4057	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018264	TCT	2	6	4064	4069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018264	T	7	7	4107	4113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018264	AT	3	6	4114	4119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018264	T	6	6	4166	4171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018264	A	6	6	4172	4177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018264	CTTT	2	8	4267	4274	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_018264	T	7	7	4272	4278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018264	GTTT	2	8	4295	4302	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018264	AT	3	6	4336	4341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018264	A	7	7	4359	4365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018264	CTT	2	6	6675	6680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018264	AT	3	6	6730	6735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018264	TCC	2	6	8437	8442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_018264	CCT	2	6	15565	15570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_018264	AT	3	6	15623	15628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018264	TCC	2	6	16091	16096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_018264	ATA	3	9	16111	16119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018264	T	7	7	16987	16993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018264	TAT	2	6	17025	17030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018264	CCT	2	6	18147	18152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_018264	ATC	2	6	20286	20291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018264	AGG	2	6	20308	20313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018264	TAT	2	6	20319	20324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018264	CTT	2	6	23754	23759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018264	TTG	2	6	23801	23806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018264	CCT	2	6	27914	27919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_018264	A	6	6	27948	27953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018264	CT	3	6	27968	27973	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_018264	ATA	2	6	28228	28233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018264	CTT	2	6	28256	28261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_018264	T	6	6	28303	28308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018264	T	7	7	28348	28354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018264	ACCT	2	8	29340	29347	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_018264	AAT	2	6	29430	29435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018264	AAG	2	6	29446	29451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018264	T	6	6	29482	29487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018264	CT	3	6	29488	29493	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_018264	T	6	6	30842	30847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018264	TGAGGT	2	12	30908	30919	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018264	T	6	6	30935	30940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018264	ATTTTT	2	12	30980	30991	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018264	A	6	6	31004	31009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018264	TA	3	6	31018	31023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018264	T	6	6	31024	31029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018264	T	6	6	31051	31056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018264	TA	3	6	31061	31066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018264	GGT	2	6	31091	31096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018264	T	6	6	31110	31115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018264	AAT	2	6	31158	31163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018264	CTT	2	6	33908	33913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_018264	TAA	3	9	33945	33953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018264	T	6	6	33961	33966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018264	AGG	2	6	33967	33972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018264	CCT	2	6	33985	33990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_018264	TCC	2	6	34744	34749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_018264	TCA	2	6	36279	36284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018264	T	7	7	36434	36440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018264	TCC	2	6	38111	38116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_018264	ATTTT	2	10	38160	38169	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018264	T	6	6	38166	38171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018264	AAT	2	6	39322	39327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018264	AT	3	6	39407	39412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018264	ACAT	2	8	39416	39423	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_018264	TAA	2	6	39426	39431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018264	ATT	2	6	39895	39900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.