MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 3855

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_018015	GGAGGT	2	12	684323	684334	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_018015	GAA	2	6	684996	685001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_018015	CTT	2	6	685011	685016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_018015	TA	3	6	685081	685086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_018015	GGT	2	6	685137	685142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_018015	GA	3	6	685146	685151	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_018015	AGG	2	6	685168	685173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_018015	TTC	2	6	686402	686407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_018015	CTCC	2	8	690382	690389	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1510	NC_018015	T	7	7	690393	690399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_018015	CAA	2	6	690413	690418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_018015	GGT	2	6	690471	690476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_018015	AGG	2	6	691042	691047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_018015	GGT	2	6	692617	692622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_018015	TTTCT	2	10	692795	692804	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1516	NC_018015	CTT	2	6	692833	692838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_018015	AAAGA	2	10	692852	692861	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_018015	ACT	2	6	694194	694199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_018015	TGT	2	6	694250	694255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_018015	A	6	6	694285	694290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_018015	AGA	2	6	694301	694306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_018015	CAA	2	6	694307	694312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_018015	A	6	6	694358	694363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_018015	GA	3	6	694364	694369	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_018015	TCC	2	6	695021	695026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1526	NC_018015	A	6	6	695029	695034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_018015	CGA	2	6	695145	695150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_018015	AG	4	8	695210	695217	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_018015	CTT	2	6	696236	696241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_018015	GCC	2	6	696253	696258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1531	NC_018015	TTTA	2	8	696271	696278	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_018015	AGG	2	6	701787	701792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_018015	GGA	2	6	709728	709733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_018015	GTA	2	6	709834	709839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_018015	CGC	2	6	709940	709945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1536	NC_018015	GAG	2	6	709996	710001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_018015	ATAA	2	8	711258	711265	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_018015	CAC	2	6	712199	712204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1539	NC_018015	ACC	2	6	716323	716328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1540	NC_018015	ACC	2	6	717476	717481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1541	NC_018015	TTTC	2	8	718887	718894	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1542	NC_018015	CAC	2	6	720767	720772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1543	NC_018015	CGG	2	6	720867	720872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_018015	T	6	6	721900	721905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_018015	GGT	2	6	721907	721912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_018015	GTT	2	6	726156	726161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_018015	TTAA	2	8	726236	726243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_018015	CGG	2	6	726263	726268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_018015	ACC	2	6	729590	729595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1550	NC_018015	A	6	6	729613	729618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_018015	CGA	2	6	729641	729646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_018015	A	7	7	731381	731387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_018015	CTC	2	6	731388	731393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1554	NC_018015	A	6	6	731395	731400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_018015	TCCC	2	8	733590	733597	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1556	NC_018015	AGA	2	6	734568	734573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_018015	CAC	2	6	736006	736011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1558	NC_018015	GCC	2	6	737461	737466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1559	NC_018015	A	6	6	737474	737479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_018015	CAA	2	6	737510	737515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_018015	A	7	7	737523	737529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_018015	CCA	2	6	738783	738788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1563	NC_018015	AAT	2	6	738813	738818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_018015	T	6	6	740417	740422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_018015	GGT	2	6	740447	740452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_018015	GCT	3	9	740496	740504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_018015	TGA	2	6	740525	740530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_018015	CGAAG	2	10	740675	740684	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1569	NC_018015	G	6	6	740695	740700	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_018015	AGGTC	2	10	740720	740729	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1571	NC_018015	GAG	2	6	740737	740742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_018015	AGG	2	6	741769	741774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_018015	GAA	2	6	741792	741797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_018015	CAA	2	6	744798	744803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_018015	ACC	2	6	745922	745927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1576	NC_018015	T	6	6	745933	745938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_018015	A	6	6	746783	746788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_018015	CTG	2	6	746853	746858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_018015	CAG	2	6	746934	746939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_018015	TCC	2	6	746947	746952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1581	NC_018015	CAC	2	6	746979	746984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1582	NC_018015	C	6	6	747016	747021	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1583	NC_018015	CTC	2	6	747045	747050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1584	NC_018015	ACT	2	6	747052	747057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_018015	CTG	2	6	747060	747065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_018015	CCA	2	6	747866	747871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1587	NC_018015	T	6	6	747916	747921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_018015	ACG	2	6	747953	747958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_018015	AC	3	6	750021	750026	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1590	NC_018015	T	7	7	750091	750097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_018015	AAG	2	6	750129	750134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_018015	AAG	2	6	750147	750152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_018015	AAC	2	6	750205	750210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_018015	CCAA	2	8	750258	750265	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1595	NC_018015	CTC	2	6	752636	752641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1596	NC_018015	GAAAA	2	10	752820	752829	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_018015	ACC	2	6	754843	754848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1598	NC_018015	AATA	2	8	754854	754861	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_018015	GTC	2	6	754872	754877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_018015	ATG	2	6	754889	754894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_018015	C	6	6	754918	754923	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1602	NC_018015	CCT	2	6	756016	756021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1603	NC_018015	TA	3	6	756032	756037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_018015	C	6	6	756233	756238	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1605	NC_018015	GAT	2	6	756244	756249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1607	NC_018015	CAA	2	6	756377	756382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_018015	GGT	2	6	756428	756433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_018015	CTT	2	6	756439	756444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_018015	TCT	2	6	756551	756556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_018015	CCT	2	6	756891	756896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1612	NC_018015	GGT	2	6	757099	757104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_018015	TGG	2	6	757115	757120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_018015	TA	3	6	757197	757202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_018015	TCA	2	6	757208	757213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_018015	T	6	6	757330	757335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_018015	G	6	6	757345	757350	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_018015	C	6	6	757364	757369	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1619	NC_018015	CTC	2	6	757515	757520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1620	NC_018015	GAC	2	6	757627	757632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_018015	CAC	2	6	757635	757640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1622	NC_018015	TTC	2	6	757688	757693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_018015	CCCT	2	8	757749	757756	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1624	NC_018015	TGG	2	6	757861	757866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_018015	TCA	2	6	757970	757975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1627	NC_018015	CCA	2	6	759302	759307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1628	NC_018015	GTA	2	6	759342	759347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_018015	TGA	2	6	759590	759595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_018015	TGG	2	6	759621	759626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_018015	GGCG	2	8	759665	759672	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1632	NC_018015	CCGG	2	8	759719	759726	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1633	NC_018015	ACC	2	6	759779	759784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1634	NC_018015	GAG	2	6	759805	759810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_018015	TCGG	2	8	759829	759836	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1770	NC_018015	ACC	2	6	865975	865980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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