MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 3855

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018015	TGG	2	6	478868	478873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_018015	TCA	2	6	480755	480760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_018015	TCCGAC	2	12	480782	480793	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1004	NC_018015	CAA	2	6	480952	480957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_018015	TCC	2	6	480977	480982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1006	NC_018015	TCACC	2	10	482071	482080	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1007	NC_018015	CTT	2	6	482092	482097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_018015	ACC	2	6	483695	483700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_018015	AGC	2	6	483716	483721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_018015	CCT	2	6	484711	484716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1011	NC_018015	AAAAG	2	10	486810	486819	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_018015	AGC	2	6	487764	487769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_018015	AGG	2	6	488442	488447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_018015	GAA	2	6	488472	488477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_018015	GAA	2	6	488482	488487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_018015	AG	3	6	488526	488531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_018015	GAC	2	6	488546	488551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_018015	TCC	2	6	488617	488622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1019	NC_018015	GAA	2	6	488681	488686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_018015	A	7	7	488699	488705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_018015	ATA	2	6	488762	488767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_018015	GAG	2	6	488777	488782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_018015	A	8	8	488794	488801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_018015	CCT	2	6	488821	488826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_018015	CCA	2	6	490980	490985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1026	NC_018015	AAG	2	6	490995	491000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_018015	CTAT	2	8	491029	491036	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1028	NC_018015	TC	3	6	491067	491072	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1029	NC_018015	TTGG	2	8	491092	491099	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_018015	GTTGT	2	10	491112	491121	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_018015	TCT	2	6	491122	491127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_018015	GTT	2	6	491132	491137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_018015	T	6	6	491136	491141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_018015	TCG	2	6	491149	491154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_018015	GCC	2	6	491175	491180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1036	NC_018015	ACC	2	6	491190	491195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1037	NC_018015	TAG	2	6	491205	491210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_018015	TCC	2	6	491220	491225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_018015	ACC	2	6	491266	491271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1040	NC_018015	TTC	2	6	491291	491296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_018015	ATC	2	6	491297	491302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_018015	TGC	2	6	491310	491315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_018015	CGGGTT	2	12	492098	492109	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1044	NC_018015	TTC	2	6	492143	492148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_018015	TTC	2	6	492153	492158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_018015	GT	3	6	492236	492241	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_018015	GAGC	2	8	492268	492275	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1048	NC_018015	AGCGGA	2	12	492281	492292	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1049	NC_018015	GAG	2	6	492433	492438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_018015	GCG	2	6	492467	492472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_018015	TGG	2	6	492476	492481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_018015	CCCCGC	2	12	492571	492582	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
1053	NC_018015	G	6	6	492641	492646	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_018015	GA	3	6	492697	492702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_018015	TCA	2	6	492726	492731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_018015	TCA	2	6	492894	492899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_018015	A	6	6	492926	492931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_018015	ATTC	2	8	492976	492983	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1059	NC_018015	AGG	2	6	492986	492991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_018015	ACC	2	6	493009	493014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1061	NC_018015	AAAG	2	8	493029	493036	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_018015	CTT	2	6	494097	494102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_018015	ACC	2	6	497436	497441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1064	NC_018015	ACA	2	6	498056	498061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_018015	CTG	2	6	498065	498070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_018015	TAGAA	2	10	498080	498089	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_018015	CAA	2	6	499679	499684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_018015	ACC	2	6	500969	500974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_018015	AT	3	6	501015	501020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_018015	AGG	2	6	501035	501040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_018015	CAAA	2	8	501059	501066	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1072	NC_018015	GAAAA	2	10	501091	501100	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_018015	A	6	6	501123	501128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_018015	GAA	2	6	501159	501164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_018015	GGC	2	6	501202	501207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_018015	TCA	2	6	501227	501232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_018015	ATC	2	6	501257	501262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_018015	GTC	2	6	501354	501359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_018015	GTTAC	2	10	501377	501386	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1080	NC_018015	ACG	2	6	501404	501409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_018015	TCG	2	6	501452	501457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_018015	A	6	6	501458	501463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_018015	T	6	6	501476	501481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_018015	TGCCT	2	10	501488	501497	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1085	NC_018015	TGT	2	6	501563	501568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_018015	CAG	2	6	501573	501578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_018015	CTA	2	6	501592	501597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_018015	GGT	2	6	503154	503159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_018015	CTT	2	6	503278	503283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_018015	CCA	2	6	509328	509333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1091	NC_018015	CGG	2	6	509401	509406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_018015	TAA	2	6	510897	510902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_018015	AG	3	6	510957	510962	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_018015	A	6	6	511028	511033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_018015	GCT	2	6	511034	511039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_018015	CG	3	6	511752	511757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1097	NC_018015	CCG	2	6	512284	512289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1098	NC_018015	CG	4	8	512288	512295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1099	NC_018015	TGG	2	6	512297	512302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_018015	TAAA	2	8	512311	512318	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_018015	TGG	2	6	512337	512342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_018015	CCT	2	6	513549	513554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NC_018015	GCCC	2	8	513600	513607	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1104	NC_018015	GTCG	2	8	513609	513616	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1105	NC_018015	TTC	2	6	514743	514748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_018015	GTT	2	6	514777	514782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_018015	CCGATG	2	12	514824	514835	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_018015	G	6	6	514837	514842	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_018015	TCT	2	6	514847	514852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_018015	C	6	6	514890	514895	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1111	NC_018015	AGG	2	6	514927	514932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_018015	TTTC	2	8	517850	517857	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1113	NC_018015	TCA	2	6	517887	517892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_018015	CCT	2	6	517912	517917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1115	NC_018015	GTT	2	6	519147	519152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_018015	CTTTTA	2	12	519193	519204	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1117	NC_018015	TTC	2	6	519212	519217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_018015	T	7	7	519219	519225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_018015	AAG	2	6	519275	519280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_018015	ACA	2	6	519314	519319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_018015	AAGA	2	8	519487	519494	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_018015	TC	3	6	519498	519503	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1123	NC_018015	TCG	2	6	519668	519673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_018015	GTT	2	6	519688	519693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_018015	CTT	2	6	519717	519722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_018015	GAG	2	6	519724	519729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_018015	GGCT	2	8	519741	519748	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1128	NC_018015	TCT	2	6	519875	519880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_018015	CAA	2	6	519937	519942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_018015	GAC	2	6	520013	520018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_018015	AAG	3	9	520159	520167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_018015	GAA	2	6	520212	520217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_018015	GGCT	2	8	520240	520247	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1134	NC_018015	GGA	2	6	521831	521836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_018015	ACG	2	6	521881	521886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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