MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 3855

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018015	TTCC	2	8	247077	247084	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
502	NC_018015	TC	3	6	247093	247098	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
503	NC_018015	AATC	2	8	249673	249680	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
504	NC_018015	TAA	2	6	249712	249717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_018015	TCC	2	6	251503	251508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
506	NC_018015	CTC	2	6	251634	251639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_018015	CTT	2	6	251658	251663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_018015	TC	3	6	251708	251713	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
509	NC_018015	AAAGG	2	10	251760	251769	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
510	NC_018015	GAT	2	6	253783	253788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_018015	ATA	2	6	253805	253810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_018015	GGA	2	6	253819	253824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
513	NC_018015	ATT	2	6	253830	253835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_018015	G	6	6	253875	253880	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
515	NC_018015	AGG	2	6	253883	253888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
516	NC_018015	CAT	2	6	253891	253896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_018015	AGA	2	6	253897	253902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_018015	TCA	2	6	253950	253955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_018015	TCCC	2	8	254008	254015	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
520	NC_018015	AGTG	2	8	254033	254040	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
521	NC_018015	GAG	2	6	254045	254050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
522	NC_018015	GGAG	2	8	254171	254178	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
523	NC_018015	GAA	2	6	257439	257444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_018015	AGG	2	6	257465	257470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
525	NC_018015	CTC	2	6	257494	257499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
526	NC_018015	TCA	2	6	257527	257532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_018015	TCA	2	6	257549	257554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_018015	GAGAA	2	10	257594	257603	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
529	NC_018015	TC	3	6	258708	258713	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
530	NC_018015	CCT	2	6	263969	263974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
531	NC_018015	TAA	2	6	264041	264046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_018015	TAGCC	2	10	264102	264111	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
533	NC_018015	AG	3	6	264295	264300	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
534	NC_018015	ACC	2	6	265195	265200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_018015	GAA	2	6	269402	269407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_018015	GA	3	6	269420	269425	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
537	NC_018015	CCT	2	6	270481	270486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_018015	TAA	2	6	270519	270524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_018015	CGAAA	2	10	270531	270540	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
540	NC_018015	GAG	2	6	272535	272540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
541	NC_018015	CTC	2	6	273905	273910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
542	NC_018015	TTA	2	6	273946	273951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_018015	GGT	2	6	273974	273979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
544	NC_018015	ACC	2	6	277301	277306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
545	NC_018015	ATT	2	6	277328	277333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_018015	TGT	2	6	277347	277352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_018015	TAG	2	6	277379	277384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_018015	CTA	2	6	277386	277391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_018015	ATG	2	6	277831	277836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_018015	AAC	2	6	277838	277843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_018015	A	6	6	277897	277902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_018015	TTC	2	6	279440	279445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_018015	TTG	2	6	279449	279454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_018015	TTC	2	6	279462	279467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_018015	TCC	2	6	279476	279481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_018015	TTC	2	6	279515	279520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_018015	CGA	2	6	279545	279550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_018015	CCGA	2	8	281271	281278	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
559	NC_018015	TTCG	2	8	281810	281817	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
560	NC_018015	TC	3	6	281889	281894	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
561	NC_018015	ATG	2	6	281968	281973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_018015	A	7	7	282022	282028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_018015	TAC	2	6	282083	282088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_018015	TA	3	6	282098	282103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_018015	AGG	2	6	282108	282113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
566	NC_018015	CAT	2	6	282180	282185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_018015	ATC	2	6	282196	282201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_018015	CCG	2	6	282236	282241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_018015	TC	3	6	282253	282258	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
570	NC_018015	TTC	2	6	282268	282273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_018015	T	6	6	282274	282279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_018015	TTG	2	6	282299	282304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_018015	CCT	2	6	282865	282870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_018015	CTTCA	2	10	284026	284035	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
575	NC_018015	AAGTCG	2	12	284974	284985	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
576	NC_018015	CGC	2	6	285007	285012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
577	NC_018015	TCC	2	6	285021	285026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
578	NC_018015	TCC	2	6	285052	285057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
579	NC_018015	T	6	6	285101	285106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_018015	ACA	2	6	285107	285112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_018015	TCA	2	6	285183	285188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_018015	CGT	2	6	285190	285195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_018015	GAG	2	6	285287	285292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
584	NC_018015	GAG	2	6	285367	285372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
585	NC_018015	GC	3	6	285520	285525	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
586	NC_018015	TCC	2	6	285538	285543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
587	NC_018015	TAAT	2	8	285593	285600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_018015	CCT	2	6	285612	285617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
589	NC_018015	TGAT	2	8	285646	285653	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
590	NC_018015	A	6	6	285700	285705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_018015	ATTC	2	8	286598	286605	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
592	NC_018015	CTT	2	6	286688	286693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_018015	TGT	2	6	286740	286745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_018015	CGA	2	6	287150	287155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_018015	GA	3	6	287154	287159	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
596	NC_018015	TCC	2	6	287187	287192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
597	NC_018015	CAG	2	6	290914	290919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_018015	CTC	2	6	290948	290953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
599	NC_018015	ACTA	2	8	290973	290980	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
600	NC_018015	CAC	2	6	291020	291025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
601	NC_018015	A	6	6	291040	291045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_018015	GAG	2	6	292977	292982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
603	NC_018015	GTG	2	6	295550	295555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
604	NC_018015	GTG	2	6	295629	295634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
605	NC_018015	C	6	6	297404	297409	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
606	NC_018015	G	6	6	297498	297503	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
607	NC_018015	TGT	2	6	297544	297549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_018015	G	6	6	297562	297567	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
609	NC_018015	TGG	2	6	299432	299437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
610	NC_018015	G	6	6	303515	303520	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
611	NC_018015	TCC	2	6	303545	303550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
612	NC_018015	GGAA	2	8	303582	303589	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
613	NC_018015	A	7	7	303594	303600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_018015	AG	3	6	303624	303629	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
615	NC_018015	ATC	2	6	308706	308711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_018015	GGTTT	2	10	308773	308782	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
617	NC_018015	CTTT	2	8	310846	310853	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
618	NC_018015	GAG	2	6	310927	310932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
619	NC_018015	GAG	2	6	310960	310965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
620	NC_018015	AGT	2	6	310991	310996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_018015	CCT	2	6	311035	311040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_018015	CCG	2	6	311043	311048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
623	NC_018015	A	6	6	311763	311768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_018015	GTG	2	6	311800	311805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
625	NC_018015	TTGA	2	8	314317	314324	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
626	NC_018015	CA	3	6	314374	314379	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
627	NC_018015	AAG	3	9	314517	314525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_018015	TTC	2	6	315336	315341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_018015	GAA	2	6	315488	315493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_018015	TGA	2	6	315505	315510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_018015	TGG	2	6	315536	315541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
632	NC_018015	GCCCA	2	10	315610	315619	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
633	NC_018015	TGG	2	6	315625	315630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
634	NC_018015	CCGG	2	8	315632	315639	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
635	NC_018015	GGC	2	6	315670	315675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_018015	G	7	7	315732	315738	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
637	NC_018015	TC	3	6	318509	318514	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
638	NC_018015	GAAG	2	8	318527	318534	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
639	NC_018015	AGT	2	6	322307	322312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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965	NC_018015	CTTT	2	8	445061	445068	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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