MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermoanaerobacterium saccharolyticum JW/SL-YS485 chromosome

Total Repeats: 8710

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017992	T	92	92	1	92	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017992	TTA	2	6	98	103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017992	TAA	2	6	788	793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017992	TATAAA	2	12	831	842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017992	GGA	2	6	862	867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017992	TCC	2	6	2081	2086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_017992	T	6	6	2087	2092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017992	AGA	2	6	2135	2140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017992	CT	3	6	2238	2243	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017992	ATA	2	6	2275	2280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017992	TAA	2	6	2293	2298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017992	A	6	6	2313	2318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017992	AT	3	6	2351	2356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017992	TCC	2	6	2894	2899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_017992	TAA	2	6	3474	3479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017992	TAT	3	9	3498	3506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017992	CAT	2	6	3508	3513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017992	T	6	6	3517	3522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017992	T	7	7	3543	3549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017992	A	8	8	3599	3606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017992	TGG	2	6	3628	3633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017992	ATT	2	6	3717	3722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017992	A	6	6	3737	3742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017992	TGG	2	6	3759	3764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017992	TAT	2	6	3968	3973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017992	T	6	6	4011	4016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017992	AAT	3	9	4074	4082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017992	TTTTTA	2	12	4088	4099	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017992	TGC	2	6	4153	4158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017992	TGA	2	6	4159	4164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017992	AGG	2	6	4196	4201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017992	A	6	6	7267	7272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017992	TAT	2	6	7292	7297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017992	GGA	2	6	7329	7334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017992	CCT	2	6	9355	9360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_017992	TTA	2	6	9381	9386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017992	TAA	2	6	9414	9419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017992	TA	3	6	11556	11561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017992	ACC	2	6	13777	13782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_017992	T	6	6	13822	13827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017992	A	6	6	13854	13859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017992	CAA	2	6	13882	13887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017992	A	7	7	13886	13892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017992	ACC	2	6	14039	14044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_017992	TAT	2	6	14955	14960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017992	CATTTT	2	12	15025	15036	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017992	T	6	6	15033	15038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017992	AT	3	6	15086	15091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017992	CCT	2	6	17396	17401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_017992	TTGT	2	8	17406	17413	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017992	ATT	2	6	18088	18093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017992	CAAT	2	8	19088	19095	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017992	TAT	2	6	19104	19109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017992	TCAA	2	8	19142	19149	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017992	TAT	2	6	19185	19190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017992	ATG	2	6	19216	19221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017992	CGGGA	2	10	19263	19272	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017992	T	7	7	19308	19314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017992	GTT	2	6	19340	19345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017992	AGT	2	6	22225	22230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017992	CT	3	6	22248	22253	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017992	TA	3	6	23365	23370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017992	TAA	2	6	23387	23392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017992	TAA	2	6	23394	23399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017992	A	7	7	23414	23420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017992	CCT	2	6	24675	24680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_017992	AT	3	6	25321	25326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017992	TAT	2	6	25330	25335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017992	A	7	7	25353	25359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017992	GCA	2	6	25367	25372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017992	CTT	2	6	28486	28491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017992	TA	3	6	28510	28515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017992	T	6	6	28556	28561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017992	CCCTC	2	10	29434	29443	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
75	NC_017992	AAT	2	6	29965	29970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017992	ATA	3	9	29983	29991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017992	TA	3	6	29990	29995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017992	AT	3	6	30015	30020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017992	CCT	2	6	31446	31451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_017992	T	7	7	31456	31462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017992	A	6	6	31468	31473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017992	ATC	2	6	31534	31539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017992	TACAA	2	10	31551	31560	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_017992	A	6	6	32564	32569	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017992	TAA	2	6	32585	32590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017992	CAA	2	6	32611	32616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017992	ACT	2	6	34348	34353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017992	A	9	9	34389	34397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017992	TCC	2	6	35717	35722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_017992	AAT	2	6	36911	36916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017992	CAA	2	6	36922	36927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017992	ATA	2	6	36928	36933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017992	AAAT	2	8	36936	36943	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017992	CCT	2	6	41607	41612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_017992	TCC	2	6	42717	42722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_017992	TGT	2	6	42769	42774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017992	AAC	2	6	42784	42789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017992	ACA	2	6	42815	42820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017992	TC	4	8	42869	42876	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017992	TACATT	2	12	42892	42903	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_017992	CCT	2	6	43560	43565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_017992	TAA	2	6	44531	44536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017992	AAT	2	6	44560	44565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017992	T	6	6	44573	44578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017992	AAT	2	6	44580	44585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017992	A	7	7	44592	44598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017992	AGA	2	6	44607	44612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017992	ATA	2	6	46532	46537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017992	CTAT	3	12	46588	46599	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017992	A	6	6	46683	46688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017992	ATTT	2	8	46697	46704	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017992	ATA	2	6	46807	46812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017992	A	7	7	46849	46855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017992	TA	3	6	46902	46907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017992	TA	5	10	46919	46928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017992	TA	3	6	46948	46953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017992	TGT	2	6	46967	46972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017992	TAT	2	6	46999	47004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017992	TA	3	6	47016	47021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017992	AG	3	6	47049	47054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017992	CAC	2	6	50596	50601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_017992	T	6	6	50634	50639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017992	CCT	2	6	50652	50657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_017992	TA	3	6	50693	50698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017992	GAT	2	6	50729	50734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017992	CCT	2	6	53559	53564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_017992	TAAA	2	8	53589	53596	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017992	CCT	2	6	53604	53609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_017992	TAT	2	6	53621	53626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017992	AAT	2	6	53706	53711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017992	ATC	2	6	53712	53717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017992	GAA	2	6	53723	53728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017992	AAAT	2	8	53729	53736	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017992	AGG	2	6	53753	53758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017992	T	6	6	54281	54286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017992	ATG	2	6	54289	54294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017992	ATA	2	6	54314	54319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017992	AT	3	6	54329	54334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017992	GAG	3	9	54337	54345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017992	A	8	8	57461	57468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017992	ATTTT	2	10	57477	57486	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017992	TCC	2	6	58028	58033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_017992	ATC	3	9	58688	58696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017992	ATA	2	6	58709	58714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017992	T	6	6	58721	58726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017992	GAT	2	6	58738	58743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017992	ATT	2	6	58759	58764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017992	TC	3	6	60145	60150	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_017992	TC	3	6	69025	69030	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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435	NC_017992	TA	3	6	135423	135428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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442	NC_017992	TAA	2	6	136108	136113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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447	NC_017992	TAT	2	6	136231	136236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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491	NC_017992	T	6	6	151114	151119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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