MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermus thermophilus JL-18 plasmid pTTJL1801

Total Repeats: 779

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017588	AGG	2	6	88	93	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017588	CGG	2	6	185	190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017588	AGG	2	6	195	200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017588	G	6	6	1545	1550	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017588	C	6	6	1567	1572	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6	NC_017588	AGG	2	6	6793	6798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017588	GGA	2	6	6806	6811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017588	CGG	2	6	6821	6826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017588	AGG	2	6	6859	6864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017588	GGC	2	6	7007	7012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017588	GTGG	2	8	7078	7085	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017588	TCC	2	6	7086	7091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_017588	TCT	2	6	7113	7118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017588	CCT	2	6	7134	7139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_017588	GGC	2	6	7158	7163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017588	GGC	2	6	7166	7171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017588	CGC	2	6	7176	7181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_017588	GCG	2	6	7188	7193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017588	CCT	2	6	7236	7241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_017588	GCC	2	6	7271	7276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_017588	CGC	2	6	7287	7292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_017588	AGG	2	6	7321	7326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017588	CGTC	2	8	8339	8346	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017588	GCAAG	2	10	8359	8368	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017588	GTG	2	6	8380	8385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017588	CCG	2	6	8439	8444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_017588	G	6	6	8536	8541	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017588	GGA	2	6	8583	8588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017588	TGGG	2	8	8597	8604	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017588	CAA	2	6	8622	8627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017588	GGC	2	6	8635	8640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017588	GAG	2	6	8710	8715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017588	C	6	6	8723	8728	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
34	NC_017588	CTC	2	6	8857	8862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_017588	G	6	6	8885	8890	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017588	AGG	2	6	8903	8908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017588	GAG	2	6	8938	8943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017588	GTG	2	6	9046	9051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017588	ATG	2	6	9070	9075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017588	CGG	2	6	9101	9106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017588	C	6	6	9113	9118	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
42	NC_017588	GGA	2	6	9144	9149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017588	CGC	3	9	9183	9191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_017588	G	6	6	9220	9225	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017588	CAA	2	6	9234	9239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017588	GTG	2	6	9253	9258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017588	ACC	2	6	9350	9355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_017588	GAC	2	6	9376	9381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017588	CTT	2	6	9393	9398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017588	GAG	2	6	9403	9408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017588	C	6	6	9415	9420	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
52	NC_017588	CCGC	2	8	9431	9438	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
53	NC_017588	CCA	2	6	9477	9482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_017588	GCC	2	6	13694	13699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_017588	GAGGCG	2	12	13759	13770	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017588	GCACC	2	10	13776	13785	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
57	NC_017588	AGG	2	6	21710	21715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017588	G	6	6	21725	21730	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017588	GGGA	2	8	21757	21764	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017588	CCT	2	6	24991	24996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_017588	CTC	2	6	26197	26202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_017588	TACCC	2	10	27005	27014	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
63	NC_017588	CCT	2	6	29787	29792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_017588	G	6	6	35452	35457	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017588	C	6	6	35471	35476	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
66	NC_017588	CCT	2	6	36721	36726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_017588	GCC	2	6	36765	36770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_017588	ACGTTT	2	12	37769	37780	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017588	CCCG	2	8	37819	37826	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
70	NC_017588	CGGA	2	8	40843	40850	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017588	GCC	2	6	40857	40862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_017588	GTCCG	2	10	40869	40878	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
73	NC_017588	TCC	2	6	40954	40959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_017588	CG	3	6	40991	40996	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017588	ACC	2	6	41053	41058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_017588	GGA	2	6	41109	41114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017588	CCCG	2	8	41149	41156	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
78	NC_017588	GGC	2	6	41177	41182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017588	TCC	2	6	41225	41230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_017588	CCG	2	6	41231	41236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_017588	GGGTTG	2	12	41293	41304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017588	ACT	2	6	41330	41335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017588	GGA	2	6	41458	41463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017588	ACT	2	6	41513	41518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017588	CCA	2	6	41532	41537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_017588	ACT	2	6	41573	41578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017588	TCC	2	6	41603	41608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_017588	CG	3	6	41644	41649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017588	AGG	2	6	41655	41660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017588	GTA	2	6	41709	41714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017588	CGG	2	6	41822	41827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017588	ACT	2	6	41878	41883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017588	CCCTC	2	10	41887	41896	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
94	NC_017588	CGC	2	6	41965	41970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_017588	ACT	2	6	42000	42005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017588	CAT	2	6	42074	42079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017588	ATACG	2	10	42090	42099	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_017588	GGTC	2	8	42156	42163	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017588	CAG	2	6	42191	42196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017588	GCC	3	9	42265	42273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_017588	TGG	2	6	42275	42280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017588	G	6	6	42279	42284	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017588	AGG	2	6	42318	42323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017588	C	6	6	42404	42409	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
105	NC_017588	GGGGA	2	10	42471	42480	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017588	GCTT	2	8	42544	42551	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017588	CGA	2	6	52161	52166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017588	GTG	2	6	52178	52183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017588	GTG	2	6	52190	52195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017588	GCG	2	6	52298	52303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017588	AGT	2	6	52316	52321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017588	CTCCG	2	10	52370	52379	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
113	NC_017588	TAG	2	6	52438	52443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017588	ACC	3	9	52603	52611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_017588	CGTAT	2	10	52711	52720	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_017588	ATG	2	6	52731	52736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017588	CCGCCC	2	12	52796	52807	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
118	NC_017588	GGACC	2	10	52831	52840	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
119	NC_017588	ACC	2	6	53079	53084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_017588	CTT	2	6	53093	53098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017588	GTC	2	6	53144	53149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017588	GCG	2	6	53169	53174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017588	AGT	2	6	53177	53182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017588	CCT	2	6	53355	53360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_017588	AGTC	2	8	53399	53406	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017588	TCA	2	6	53408	53413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017588	AGT	2	6	53545	53550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017588	CACG	2	8	53554	53561	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_017588	CCT	2	6	54876	54881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_017588	CTC	2	6	54886	54891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_017588	TCC	2	6	54902	54907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_017588	GGC	2	6	54908	54913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017588	CCT	2	6	59085	59090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_017588	GTA	2	6	61637	61642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017588	GAG	2	6	61673	61678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017588	CGG	2	6	61711	61716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017588	TCC	2	6	61767	61772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_017588	GTG	2	6	61784	61789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017588	CCA	2	6	61816	61821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_017588	CGG	2	6	61851	61856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017588	GGA	2	6	61879	61884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017588	TCC	2	6	61908	61913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_017588	CCT	2	6	62748	62753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_017588	TCC	2	6	62823	62828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_017588	CCCG	2	8	62873	62880	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
146	NC_017588	CCA	2	6	62915	62920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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