MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermus thermophilus JL-18 plasmid pTTJL1801

Total Repeats: 779

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017588	CCGCC	2	10	113906	113915	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
502	NC_017588	GAG	2	6	113924	113929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017588	CGC	2	6	113996	114001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
504	NC_017588	ACT	2	6	114044	114049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_017588	GAAG	2	8	114063	114070	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017588	ACG	2	6	114224	114229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_017588	GGCT	2	8	114421	114428	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
508	NC_017588	AGGA	2	8	114473	114480	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017588	GGA	2	6	114511	114516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017588	TA	3	6	115130	115135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017588	GGGA	2	8	115149	115156	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017588	CCG	2	6	115164	115169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_017588	CCT	2	6	115204	115209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_017588	ACCCC	2	10	115248	115257	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
515	NC_017588	CCG	2	6	115274	115279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_017588	AGG	2	6	115298	115303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017588	AG	3	6	115429	115434	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017588	GGA	2	6	115438	115443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017588	GAG	2	6	116132	116137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017588	GC	3	6	116138	116143	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
521	NC_017588	TCCCC	2	10	116451	116460	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
522	NC_017588	CA	3	6	116506	116511	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
523	NC_017588	CCA	2	6	116537	116542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_017588	G	6	6	116594	116599	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017588	TCC	2	6	116629	116634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
526	NC_017588	GGC	2	6	116640	116645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_017588	G	6	6	116677	116682	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017588	AAG	2	6	116714	116719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017588	TGC	2	6	116742	116747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_017588	GCC	2	6	116794	116799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
531	NC_017588	CAT	2	6	116808	116813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_017588	TCT	2	6	116828	116833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_017588	AGG	2	6	116863	116868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017588	TCC	3	9	116875	116883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_017588	C	6	6	116882	116887	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
536	NC_017588	TGG	2	6	116919	116924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_017588	C	6	6	117136	117141	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
538	NC_017588	TCC	2	6	117159	117164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
539	NC_017588	CCT	2	6	117178	117183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_017588	CCT	2	6	122709	122714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
541	NC_017588	TCCC	2	8	123566	123573	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
542	NC_017588	CCT	2	6	125573	125578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
543	NC_017588	ACCG	2	8	131633	131640	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
544	NC_017588	TTTCTC	2	12	131665	131676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_017588	AGG	2	6	131687	131692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017588	GAG	2	6	131698	131703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017588	GAG	2	6	131715	131720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017588	G	6	6	131771	131776	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017588	AACC	2	8	131778	131785	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
550	NC_017588	GAT	2	6	138284	138289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017588	CCT	2	6	138324	138329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
552	NC_017588	CGG	2	6	138357	138362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_017588	CCGCC	2	10	138363	138372	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
554	NC_017588	GAG	2	6	138381	138386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017588	CGC	2	6	138453	138458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_017588	ACT	2	6	138501	138506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_017588	GAAG	2	8	138520	138527	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017588	ACG	2	6	138681	138686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_017588	CTT	2	6	138780	138785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_017588	GGT	2	6	138805	138810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017588	GGTG	2	8	138909	138916	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017588	CGG	2	6	138950	138955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_017588	TTG	2	6	139043	139048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017588	GGCT	2	8	139056	139063	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
565	NC_017588	GCC	2	6	139067	139072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_017588	GGA	2	6	139084	139089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017588	CGC	2	6	139178	139183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
568	NC_017588	C	6	6	140477	140482	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
569	NC_017588	GC	3	6	140568	140573	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
570	NC_017588	CTT	3	9	140682	140690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_017588	CGG	2	6	140721	140726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_017588	TGA	2	6	140751	140756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017588	CCTGG	2	10	140853	140862	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
574	NC_017588	ACGG	2	8	140863	140870	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
575	NC_017588	GCG	2	6	140874	140879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_017588	GAA	2	6	140911	140916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_017588	CCTGGC	2	12	140931	140942	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
578	NC_017588	CTG	2	6	140944	140949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_017588	AGG	2	6	140960	140965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017588	CGCGG	2	10	141006	141015	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
581	NC_017588	G	6	6	141075	141080	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
582	NC_017588	GGAC	2	8	141091	141098	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
583	NC_017588	GTG	2	6	141107	141112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017588	GCA	2	6	141176	141181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_017588	TGG	2	6	141250	141255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
586	NC_017588	CCG	2	6	142430	142435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
587	NC_017588	TACCC	2	10	144189	144198	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
588	NC_017588	GCA	2	6	144229	144234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_017588	AC	3	6	144265	144270	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
590	NC_017588	G	7	7	144279	144285	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
591	NC_017588	CTC	2	6	144290	144295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
592	NC_017588	CT	3	6	144355	144360	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
593	NC_017588	CACG	2	8	144376	144383	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
594	NC_017588	AAT	2	6	145241	145246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_017588	CGC	2	6	145283	145288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
596	NC_017588	CCCGG	2	10	145329	145338	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
597	NC_017588	GCA	2	6	145350	145355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_017588	AGCG	2	8	146083	146090	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
599	NC_017588	ACC	2	6	146148	146153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_017588	CGC	2	6	146182	146187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
601	NC_017588	CCT	2	6	146194	146199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_017588	CTC	2	6	146220	146225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
603	NC_017588	ACC	2	6	146245	146250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_017588	AGG	2	6	146295	146300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
605	NC_017588	C	6	6	148403	148408	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
606	NC_017588	AAG	2	6	148441	148446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_017588	CGGGA	2	10	148495	148504	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
608	NC_017588	CCGGG	2	10	148550	148559	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
609	NC_017588	GGGGC	2	10	148637	148646	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
610	NC_017588	GGC	2	6	148706	148711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_017588	TCC	2	6	151391	151396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
612	NC_017588	C	6	6	151423	151428	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
613	NC_017588	GACG	2	8	151725	151732	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
614	NC_017588	GC	3	6	162029	162034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
615	NC_017588	AGG	2	6	162061	162066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
616	NC_017588	TCC	2	6	162111	162116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_017588	AAGG	2	8	162123	162130	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
618	NC_017588	C	6	6	171591	171596	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
619	NC_017588	CCA	2	6	171640	171645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
620	NC_017588	CAT	2	6	171646	171651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_017588	GTG	2	6	171674	171679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017588	GGTGG	2	10	171727	171736	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017588	CCT	2	6	171742	171747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_017588	CCG	2	6	171782	171787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
625	NC_017588	GGA	2	6	171838	171843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
626	NC_017588	CGC	2	6	171887	171892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
627	NC_017588	CAG	2	6	171896	171901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_017588	AAG	2	6	178625	178630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017588	C	6	6	179763	179768	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
630	NC_017588	CCA	2	6	179771	179776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
631	NC_017588	CTG	2	6	179781	179786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_017588	GA	3	6	179810	179815	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
633	NC_017588	GGA	2	6	179816	179821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
634	NC_017588	CCG	2	6	179834	179839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
635	NC_017588	CCT	2	6	179840	179845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
636	NC_017588	CCG	2	6	179876	179881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
637	NC_017588	TCC	3	9	179899	179907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
638	NC_017588	TCCG	2	8	179939	179946	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
639	NC_017588	ACC	3	9	179958	179966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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778	NC_017588	GCGGGT	2	12	260826	260837	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
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