MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermus thermophilus JL-18 chromosome

Total Repeats: 2046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017587	G	6	6	1450	1455	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017587	GGCCGG	2	12	1501	1512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017587	CTA	3	9	1591	1599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017587	TTTAAA	2	12	1622	1633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017587	AG	3	6	1635	1640	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017587	AGG	2	6	1657	1662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017587	GTA	2	6	2802	2807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017587	CCT	2	6	10321	10326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_017587	G	6	6	10357	10362	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017587	CTTGC	2	10	10370	10379	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_017587	AGG	2	6	10387	10392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017587	TC	4	8	10404	10411	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017587	CGGC	2	8	11640	11647	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017587	G	6	6	11677	11682	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017587	AGAGG	2	10	11713	11722	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017587	GCG	2	6	11747	11752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017587	CGGG	2	8	11789	11796	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017587	AGC	2	6	11848	11853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017587	AG	3	6	11857	11862	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017587	G	6	6	11888	11893	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017587	ACC	2	6	11952	11957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_017587	GGGAG	2	10	12027	12036	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017587	GAGGCG	2	12	12152	12163	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017587	CCA	2	6	12445	12450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_017587	GCGA	2	8	12508	12515	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017587	CGTCCG	2	12	12519	12530	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017587	AAC	2	6	12539	12544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017587	AGG	2	6	12613	12618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017587	AGC	2	6	12629	12634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017587	GCGCC	2	10	12674	12683	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
31	NC_017587	CCGATG	2	12	12759	12770	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017587	GGC	2	6	12787	12792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017587	GTC	2	6	12884	12889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017587	G	6	6	12980	12985	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017587	CTAGG	2	10	12991	13000	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017587	GTG	2	6	13077	13082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017587	C	6	6	13105	13110	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
38	NC_017587	GC	3	6	13202	13207	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017587	TGA	2	6	13277	13282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017587	CT	3	6	13336	13341	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017587	AGG	2	6	13355	13360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017587	AGGGG	2	10	13397	13406	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017587	CCGAA	2	10	13415	13424	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_017587	CGG	2	6	13436	13441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017587	G	7	7	13685	13691	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017587	ACC	2	6	13707	13712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_017587	G	6	6	13743	13748	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017587	CCT	2	6	13784	13789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_017587	CCG	2	6	13837	13842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_017587	GGT	2	6	13920	13925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017587	GCG	2	6	14003	14008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017587	TCG	2	6	14035	14040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017587	GAA	2	6	14053	14058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017587	CGT	2	6	14115	14120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017587	AGG	2	6	14153	14158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017587	G	6	6	14164	14169	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017587	GCCC	2	8	14291	14298	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
58	NC_017587	CATCC	2	10	14438	14447	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
59	NC_017587	C	7	7	14466	14472	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
60	NC_017587	GCG	2	6	14523	14528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017587	ACC	2	6	14533	14538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_017587	GGGC	2	8	14588	14595	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017587	C	6	6	14724	14729	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
64	NC_017587	G	6	6	14743	14748	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017587	TCC	2	6	18897	18902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_017587	CGC	2	6	22083	22088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_017587	C	6	6	23593	23598	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
68	NC_017587	G	6	6	23603	23608	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017587	TTA	2	6	23886	23891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017587	GA	3	6	23972	23977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017587	C	6	6	24055	24060	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
72	NC_017587	C	6	6	24079	24084	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
73	NC_017587	CCA	2	6	24096	24101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_017587	CCT	2	6	24156	24161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_017587	CGCCCC	2	12	24171	24182	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
76	NC_017587	CCT	2	6	24229	24234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_017587	AGG	2	6	24275	24280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017587	CAC	2	6	24333	24338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_017587	GCC	2	6	24359	24364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_017587	CG	3	6	24397	24402	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017587	CGC	2	6	24415	24420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_017587	CCT	2	6	24422	24427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_017587	CGA	2	6	24433	24438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017587	GTG	2	6	24478	24483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017587	G	7	7	24497	24503	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017587	GCC	2	6	24509	24514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_017587	AGG	2	6	24605	24610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017587	TGG	2	6	24662	24667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017587	GAAGG	2	10	24668	24677	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017587	AGGTG	2	10	24720	24729	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017587	GAA	2	6	24730	24735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017587	AGG	2	6	24749	24754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017587	GGC	2	6	24786	24791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017587	GCAG	2	8	24837	24844	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017587	CCT	2	6	24855	24860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_017587	GAAG	2	8	24879	24886	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017587	GA	4	8	24904	24911	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017587	TCC	2	6	24922	24927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_017587	GCAAG	2	10	24936	24945	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017587	AGG	2	6	25010	25015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017587	CCT	2	6	31548	31553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_017587	GC	3	6	31653	31658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_017587	T	6	6	31667	31672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017587	CGAG	2	8	31693	31700	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017587	G	6	6	33707	33712	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017587	GGA	2	6	33739	33744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017587	CAT	2	6	35453	35458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017587	AGG	2	6	35520	35525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017587	AGCA	2	8	35526	35533	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017587	AGGGC	2	10	36016	36025	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
111	NC_017587	GTA	2	6	36048	36053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017587	GGT	2	6	36057	36062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017587	C	7	7	36985	36991	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
114	NC_017587	ACC	2	6	40999	41004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_017587	CGC	2	6	43250	43255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_017587	G	6	6	45620	45625	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017587	GCC	2	6	48401	48406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_017587	GAG	2	6	48418	48423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017587	G	6	6	48423	48428	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017587	CGC	2	6	49342	49347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_017587	CT	3	6	49356	49361	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017587	CG	3	6	49381	49386	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017587	CCTTAG	2	12	49432	49443	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017587	AGG	2	6	54860	54865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017587	C	6	6	58011	58016	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
126	NC_017587	AGG	2	6	58083	58088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017587	GGT	2	6	58140	58145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017587	TCC	2	6	59145	59150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_017587	GGCT	2	8	59156	59163	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017587	GAA	2	6	60358	60363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017587	CGGGG	2	10	60387	60396	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017587	AAAG	2	8	60397	60404	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017587	GCCC	2	8	60419	60426	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
134	NC_017587	TGG	2	6	60431	60436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017587	GCC	2	6	60501	60506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_017587	GTG	2	6	60508	60513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017587	CTTGG	2	10	60583	60592	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_017587	C	6	6	61439	61444	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
139	NC_017587	G	6	6	61453	61458	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017587	CTT	2	6	61468	61473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017587	GTGG	2	8	66767	66774	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017587	CCCA	2	8	66803	66810	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
143	NC_017587	C	6	6	66841	66846	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
144	NC_017587	CCA	2	6	69227	69232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_017587	GTG	2	6	69278	69283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017587	G	6	6	71687	71692	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017587	G	6	6	72480	72485	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017587	GGC	2	6	73271	73276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_017587	TCC	2	6	73717	73722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
150	NC_017587	CGGG	2	8	73732	73739	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
151	NC_017587	TTCCT	2	10	74940	74949	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
152	NC_017587	CCT	2	6	80293	80298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
153	NC_017587	G	7	7	80351	80357	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017587	AGGG	2	8	80390	80397	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_017587	CCT	2	6	97733	97738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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164	NC_017587	GGGA	2	8	97873	97880	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
165	NC_017587	T	6	6	102639	102644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_017587	CCT	2	6	128823	128828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
183	NC_017587	GCC	2	6	130251	130256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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185	NC_017587	C	6	6	130309	130314	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
186	NC_017587	AACGC	2	10	130823	130832	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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287	NC_017587	C	7	7	206722	206728	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
288	NC_017587	CCCG	2	8	206759	206766	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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423	NC_017587	GGGA	2	8	282894	282901	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
424	NC_017587	GGA	2	6	282911	282916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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426	NC_017587	G	6	6	284854	284859	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
427	NC_017587	TCCACC	2	12	285817	285828	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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