MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermus thermophilus JL-18 chromosome

Total Repeats: 2046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017587	GCTT	2	8	1338348	1338355	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1502	NC_017587	CTC	2	6	1339737	1339742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1503	NC_017587	CGGG	2	8	1346511	1346518	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1504	NC_017587	C	6	6	1348055	1348060	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1505	NC_017587	G	6	6	1349879	1349884	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_017587	C	6	6	1349888	1349893	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1507	NC_017587	CCA	2	6	1349898	1349903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1508	NC_017587	G	6	6	1351153	1351158	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_017587	GAG	2	6	1351174	1351179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_017587	C	7	7	1351263	1351269	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1511	NC_017587	ACC	2	6	1351278	1351283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1512	NC_017587	GGC	2	6	1351295	1351300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_017587	C	6	6	1354925	1354930	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1514	NC_017587	GAG	2	6	1356152	1356157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_017587	CGCGC	2	10	1358457	1358466	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1516	NC_017587	GCGG	2	8	1359763	1359770	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1517	NC_017587	ACCG	2	8	1359786	1359793	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1518	NC_017587	GGAG	2	8	1361996	1362003	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_017587	CG	3	6	1370925	1370930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1520	NC_017587	CGC	2	6	1370938	1370943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1521	NC_017587	GGC	2	6	1370948	1370953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_017587	C	7	7	1372619	1372625	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1523	NC_017587	G	6	6	1372645	1372650	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_017587	G	6	6	1372660	1372665	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_017587	ACC	2	6	1375700	1375705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1526	NC_017587	GGT	2	6	1376499	1376504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_017587	CCT	2	6	1377495	1377500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1528	NC_017587	CCA	2	6	1377539	1377544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1529	NC_017587	GCA	2	6	1377576	1377581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_017587	C	6	6	1377600	1377605	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1531	NC_017587	AGG	2	6	1377619	1377624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_017587	G	6	6	1377623	1377628	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_017587	AGG	2	6	1377660	1377665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_017587	GGA	2	6	1378875	1378880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_017587	CCTT	2	8	1384836	1384843	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1536	NC_017587	CGGGGG	2	12	1388633	1388644	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
1537	NC_017587	C	6	6	1388648	1388653	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1538	NC_017587	TCC	2	6	1397572	1397577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1539	NC_017587	TCCG	2	8	1397602	1397609	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1540	NC_017587	AGGG	2	8	1406698	1406705	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_017587	CGC	2	6	1406724	1406729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1542	NC_017587	GGT	2	6	1406753	1406758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_017587	CG	3	6	1410353	1410358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1544	NC_017587	CAT	2	6	1415252	1415257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_017587	CCT	2	6	1416743	1416748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1546	NC_017587	CCT	2	6	1420818	1420823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1547	NC_017587	C	7	7	1420873	1420879	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1548	NC_017587	ATA	2	6	1424744	1424749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_017587	TCC	2	6	1426849	1426854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1550	NC_017587	TCC	2	6	1428384	1428389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1551	NC_017587	C	7	7	1428432	1428438	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1552	NC_017587	GCC	2	6	1428466	1428471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1553	NC_017587	TA	3	6	1434073	1434078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_017587	AGGT	2	8	1434109	1434116	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_017587	AGG	2	6	1436120	1436125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_017587	GGCC	2	8	1437118	1437125	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1557	NC_017587	ACC	2	6	1437163	1437168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1558	NC_017587	CCT	2	6	1438948	1438953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1559	NC_017587	C	7	7	1438960	1438966	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1560	NC_017587	GGA	2	6	1439026	1439031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_017587	C	7	7	1441467	1441473	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1562	NC_017587	TAT	2	6	1444211	1444216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_017587	ACC	2	6	1454763	1454768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1564	NC_017587	GGT	2	6	1454778	1454783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_017587	CTTT	2	8	1454785	1454792	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1567	NC_017587	GCCCCC	2	12	1460026	1460037	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
1568	NC_017587	CCCA	2	8	1460049	1460056	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1569	NC_017587	AGG	2	6	1460063	1460068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_017587	ACCCC	2	10	1461661	1461670	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
1571	NC_017587	CGG	2	6	1461671	1461676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_017587	GCTC	2	8	1463003	1463010	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1573	NC_017587	G	6	6	1463043	1463048	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_017587	CTC	2	6	1463764	1463769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1578	NC_017587	CCCGC	2	10	1464622	1464631	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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1581	NC_017587	G	6	6	1466235	1466240	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_017587	AGG	2	6	1466275	1466280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1587	NC_017587	GCCG	2	8	1474277	1474284	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1589	NC_017587	G	7	7	1479449	1479455	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_017587	TTA	2	6	1479473	1479478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1593	NC_017587	TGG	2	6	1481902	1481907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1597	NC_017587	GCCCC	2	10	1488500	1488509	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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1601	NC_017587	TCC	2	6	1489604	1489609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1602	NC_017587	GAG	2	6	1489611	1489616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_017587	T	6	6	1489647	1489652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_017587	GAG	2	6	1489740	1489745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_017587	CG	3	6	1494704	1494709	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1608	NC_017587	GAAA	2	8	1499854	1499861	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1611	NC_017587	AGG	2	6	1504114	1504119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1615	NC_017587	C	6	6	1511909	1511914	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1616	NC_017587	TTCCG	2	10	1511920	1511929	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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1619	NC_017587	G	6	6	1517263	1517268	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_017587	CCT	2	6	1521925	1521930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1622	NC_017587	A	6	6	1522001	1522006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_017587	G	6	6	1522054	1522059	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_017587	AGGG	2	8	1522070	1522077	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_017587	CG	3	6	1530412	1530417	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1630	NC_017587	AGG	2	6	1533224	1533229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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