MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermus sp. CCB_US3_UF1 chromosome

Total Repeats: 2672

< Previous123456Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_017278	T	7	7	2089126	2089132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_017278	GCC	2	6	2089184	2089189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2503	NC_017278	G	6	6	2089206	2089211	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_017278	CCT	2	6	2089222	2089227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2505	NC_017278	TGA	2	6	2089248	2089253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_017278	C	8	8	2089272	2089279	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2507	NC_017278	C	6	6	2089282	2089287	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2508	NC_017278	GGCCAC	2	12	2089396	2089407	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2509	NC_017278	CCT	3	9	2089411	2089419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2510	NC_017278	ACC	2	6	2089445	2089450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2511	NC_017278	GGT	2	6	2089480	2089485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_017278	GGA	3	9	2089534	2089542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_017278	GGGAGG	2	12	2089620	2089631	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_017278	TCC	2	6	2089680	2089685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2515	NC_017278	GAG	2	6	2089688	2089693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_017278	GAG	2	6	2089697	2089702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_017278	GGC	2	6	2091050	2091055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2518	NC_017278	GAGG	2	8	2097178	2097185	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_017278	CTCCG	2	10	2097329	2097338	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2520	NC_017278	CCT	2	6	2099422	2099427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2521	NC_017278	C	6	6	2100630	2100635	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2522	NC_017278	GGC	2	6	2100636	2100641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2523	NC_017278	T	6	6	2100646	2100651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_017278	GGC	2	6	2102681	2102686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2525	NC_017278	A	6	6	2102687	2102692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_017278	C	7	7	2103298	2103304	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2527	NC_017278	G	6	6	2103377	2103382	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_017278	TCC	2	6	2104316	2104321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2529	NC_017278	CGG	2	6	2104390	2104395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2530	NC_017278	C	6	6	2104413	2104418	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2531	NC_017278	AGGCC	2	10	2104492	2104501	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2532	NC_017278	GC	3	6	2104507	2104512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2533	NC_017278	CCT	2	6	2105648	2105653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2534	NC_017278	C	6	6	2105659	2105664	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2535	NC_017278	CCTCA	2	10	2106585	2106594	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
2536	NC_017278	G	6	6	2106599	2106604	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_017278	C	6	6	2106615	2106620	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2538	NC_017278	TCC	2	6	2107850	2107855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2539	NC_017278	CTTG	2	8	2107858	2107865	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2540	NC_017278	GCC	2	6	2107875	2107880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2541	NC_017278	CTG	2	6	2107972	2107977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2542	NC_017278	TGG	2	6	2108091	2108096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_017278	CAC	2	6	2108180	2108185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2544	NC_017278	C	6	6	2108223	2108228	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2545	NC_017278	AC	3	6	2108307	2108312	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2546	NC_017278	CCT	2	6	2113113	2113118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2547	NC_017278	AGG	2	6	2119367	2119372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_017278	C	6	6	2123531	2123536	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2549	NC_017278	G	6	6	2123548	2123553	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_017278	GGT	2	6	2123734	2123739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_017278	CGC	2	6	2123744	2123749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2552	NC_017278	GGT	2	6	2123922	2123927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_017278	TCCC	2	8	2124009	2124016	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2554	NC_017278	C	6	6	2124103	2124108	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2555	NC_017278	CCT	2	6	2124114	2124119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2556	NC_017278	ACG	2	6	2124152	2124157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2557	NC_017278	CTT	2	6	2124213	2124218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2558	NC_017278	CGA	2	6	2124232	2124237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2559	NC_017278	CGC	2	6	2124264	2124269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2560	NC_017278	ACC	2	6	2124347	2124352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2561	NC_017278	CGG	2	6	2124430	2124435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2562	NC_017278	AGG	2	6	2124483	2124488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_017278	GGT	2	6	2124560	2124565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_017278	GGC	2	6	2124597	2124602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2565	NC_017278	GCC	2	6	2124830	2124835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2566	NC_017278	CCCCT	2	10	2124866	2124875	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
2567	NC_017278	CCT	2	6	2124912	2124917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2568	NC_017278	AG	3	6	2124931	2124936	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_017278	CG	3	6	2125071	2125076	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2570	NC_017278	CAC	2	6	2125197	2125202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2571	NC_017278	CCTAG	2	10	2125279	2125288	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2572	NC_017278	C	6	6	2125294	2125299	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2573	NC_017278	GAC	2	6	2125390	2125395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2574	NC_017278	GCC	2	6	2125487	2125492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2575	NC_017278	CATCGG	2	12	2125509	2125520	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2576	NC_017278	C	6	6	2125548	2125553	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2577	NC_017278	GCT	2	6	2125646	2125651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2578	NC_017278	CCT	2	6	2125662	2125667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2579	NC_017278	GTT	2	6	2125736	2125741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2580	NC_017278	TCGC	2	8	2125765	2125772	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2581	NC_017278	TGG	2	6	2125830	2125835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2582	NC_017278	CGCCTC	2	12	2126117	2126128	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
2583	NC_017278	CGC	2	6	2126183	2126188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2584	NC_017278	CTCCC	2	10	2126244	2126253	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
2585	NC_017278	GGT	2	6	2126323	2126328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2586	NC_017278	GCT	2	6	2126428	2126433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2587	NC_017278	CAG	2	6	2126437	2126442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2588	NC_017278	CCCG	2	8	2126485	2126492	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2589	NC_017278	TCGC	2	8	2126524	2126531	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2590	NC_017278	TCGCTT	2	12	2126546	2126557	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2591	NC_017278	TCCTC	2	10	2126558	2126567	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
2592	NC_017278	C	6	6	2126599	2126604	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2593	NC_017278	CGG	2	6	2126611	2126616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2594	NC_017278	CGC	2	6	2126832	2126837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2595	NC_017278	A	6	6	2126856	2126861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2596	NC_017278	G	6	6	2126888	2126893	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2597	NC_017278	GCC	3	9	2129319	2129327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2598	NC_017278	AGG	2	6	2129333	2129338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_017278	CCT	2	6	2129349	2129354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2600	NC_017278	AAG	2	6	2129418	2129423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_017278	CCT	2	6	2131507	2131512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2602	NC_017278	TCA	2	6	2131519	2131524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2603	NC_017278	CTG	2	6	2134486	2134491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2604	NC_017278	TGG	2	6	2134502	2134507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_017278	ACC	2	6	2136292	2136297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2606	NC_017278	ACC	2	6	2136312	2136317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2607	NC_017278	AGG	2	6	2136431	2136436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_017278	ACC	2	6	2137564	2137569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2609	NC_017278	GGT	2	6	2137618	2137623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_017278	AGG	2	6	2142968	2142973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_017278	C	6	6	2145238	2145243	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2612	NC_017278	CTC	3	9	2149037	2149045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2613	NC_017278	TGG	2	6	2149114	2149119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_017278	CCT	2	6	2149121	2149126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2615	NC_017278	AGGG	2	8	2149202	2149209	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2616	NC_017278	GAGG	2	8	2154272	2154279	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_017278	GAA	2	6	2154280	2154285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_017278	ACCCG	2	10	2154387	2154396	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2619	NC_017278	GCT	2	6	2154408	2154413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2620	NC_017278	CCG	2	6	2154446	2154451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2621	NC_017278	GTA	2	6	2154471	2154476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_017278	CGA	2	6	2163412	2163417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2623	NC_017278	GCC	2	6	2163482	2163487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2624	NC_017278	GCCC	2	8	2163496	2163503	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2625	NC_017278	CGCC	2	8	2163504	2163511	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2626	NC_017278	AGG	2	6	2163540	2163545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2627	NC_017278	AGGGC	2	10	2163556	2163565	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2628	NC_017278	CCT	2	6	2169215	2169220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2629	NC_017278	TACC	2	8	2169242	2169249	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2630	NC_017278	CCCA	2	8	2169262	2169269	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2631	NC_017278	GCC	3	9	2169281	2169289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2632	NC_017278	CGC	3	9	2169449	2169457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2633	NC_017278	CGG	2	6	2169533	2169538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2634	NC_017278	GAC	2	6	2169565	2169570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2635	NC_017278	GCG	2	6	2169577	2169582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2636	NC_017278	CG	3	6	2177372	2177377	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2637	NC_017278	AGA	2	6	2177400	2177405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2638	NC_017278	C	6	6	2177453	2177458	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2639	NC_017278	C	6	6	2177476	2177481	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2640	NC_017278	C	6	6	2177784	2177789	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2641	NC_017278	GCC	2	6	2177829	2177834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2642	NC_017278	CCTC	2	8	2183022	2183029	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2643	NC_017278	CAC	2	6	2183170	2183175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2644	NC_017278	CCA	2	6	2183224	2183229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2645	NC_017278	CCG	2	6	2183238	2183243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2646	NC_017278	GCC	2	6	2183365	2183370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2647	NC_017278	C	6	6	2183380	2183385	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2648	NC_017278	TCT	2	6	2183403	2183408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2649	NC_017278	TTA	2	6	2183487	2183492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2650	NC_017278	CCT	2	6	2185906	2185911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2651	NC_017278	TAC	2	6	2186227	2186232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2652	NC_017278	AGT	2	6	2186249	2186254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2653	NC_017278	TGA	2	6	2186268	2186273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2654	NC_017278	TGGG	2	8	2186294	2186301	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2655	NC_017278	C	6	6	2191713	2191718	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2656	NC_017278	G	6	6	2191724	2191729	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2657	NC_017278	CAT	2	6	2197114	2197119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2658	NC_017278	G	6	6	2199773	2199778	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2659	NC_017278	GGGT	2	8	2199951	2199958	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2660	NC_017278	G	6	6	2203434	2203439	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2661	NC_017278	TTCC	2	8	2205669	2205676	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2662	NC_017278	GCT	2	6	2212398	2212403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2663	NC_017278	ATT	2	6	2215978	2215983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2664	NC_017278	AGG	2	6	2215988	2215993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2665	NC_017278	CAG	2	6	2216064	2216069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2666	NC_017278	GTT	2	6	2216126	2216131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2667	NC_017278	AGG	2	6	2218955	2218960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2668	NC_017278	GGC	2	6	2219839	2219844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2669	NC_017278	GCC	2	6	2229322	2229327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2670	NC_017278	CTC	2	6	2235481	2235486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2671	NC_017278	C	7	7	2236043	2236049	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2672	NC_017278	C	6	6	2241971	2241976	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding

< Previous123456Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.