MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 plasmid pTHTHE1601

Total Repeats: 1638

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017273	CCA	2	6	222921	222926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1002	NC_017273	CGG	2	6	222937	222942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_017273	GCC	2	6	223019	223024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1004	NC_017273	TGA	2	6	223036	223041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017273	GCG	2	6	224176	224181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_017273	GTT	2	6	224193	224198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_017273	GAG	2	6	224202	224207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_017273	CCAC	2	8	224222	224229	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1009	NC_017273	GCC	2	6	224275	224280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1010	NC_017273	TCT	2	6	224294	224299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_017273	TTG	2	6	224374	224379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_017273	GCC	2	6	224427	224432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1013	NC_017273	GTA	2	6	224439	224444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_017273	GTC	2	6	224466	224471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_017273	TCC	2	6	224503	224508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1016	NC_017273	GGC	2	6	224575	224580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_017273	GGCG	2	8	224588	224595	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1018	NC_017273	CCA	2	6	224684	224689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1019	NC_017273	GCC	2	6	224708	224713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1020	NC_017273	CGC	2	6	224714	224719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1021	NC_017273	AAG	2	6	224775	224780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017273	CCTT	2	8	224814	224821	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1023	NC_017273	CCT	2	6	224836	224841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_017273	CCG	2	6	224846	224851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_017273	TAGGGC	2	12	224910	224921	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1026	NC_017273	CCT	2	6	224943	224948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1027	NC_017273	CTTT	2	8	230017	230024	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1028	NC_017273	CCG	2	6	230214	230219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1029	NC_017273	GCCCC	2	10	230230	230239	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1030	NC_017273	CG	3	6	230253	230258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_017273	GCC	2	6	230259	230264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1032	NC_017273	CCT	2	6	242701	242706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1033	NC_017273	C	6	6	242748	242753	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1034	NC_017273	CGG	2	6	245296	245301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_017273	CCAGGC	2	12	245313	245324	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1036	NC_017273	CACCTC	2	12	245601	245612	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1037	NC_017273	CGC	2	6	246362	246367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1038	NC_017273	C	6	6	246815	246820	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1039	NC_017273	TGG	2	6	246847	246852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_017273	TGG	2	6	246900	246905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_017273	CCG	2	6	246980	246985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1042	NC_017273	TTC	2	6	247667	247672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_017273	CTC	2	6	247773	247778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_017273	AGA	2	6	247794	247799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_017273	C	6	6	248477	248482	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1046	NC_017273	C	6	6	248659	248664	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1047	NC_017273	GAA	2	6	248665	248670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_017273	G	6	6	248866	248871	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_017273	C	7	7	248880	248886	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1050	NC_017273	ACC	2	6	248905	248910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1051	NC_017273	TCC	2	6	248935	248940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_017273	ACC	2	6	248953	248958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1053	NC_017273	GTG	2	6	249014	249019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_017273	GT	3	6	249026	249031	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017273	GAG	2	6	249081	249086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_017273	GGCGC	2	10	249117	249126	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1057	NC_017273	GAG	2	6	249169	249174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_017273	C	6	6	249211	249216	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1059	NC_017273	GCA	2	6	249244	249249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_017273	CGAG	2	8	249292	249299	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1061	NC_017273	CGT	2	6	249350	249355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_017273	GCGA	2	8	249357	249364	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1063	NC_017273	CAA	2	6	249380	249385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_017273	GA	4	8	249388	249395	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_017273	GGT	2	6	249479	249484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_017273	C	6	6	249485	249490	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1067	NC_017273	GAA	2	6	249496	249501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_017273	GGC	2	6	249690	249695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_017273	GC	3	6	249694	249699	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1070	NC_017273	CTC	2	6	249700	249705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1071	NC_017273	CTC	2	6	250393	250398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_017273	CT	3	6	250403	250408	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1073	NC_017273	C	6	6	250484	250489	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1074	NC_017273	ACA	2	6	250514	250519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_017273	CCT	2	6	250530	250535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1076	NC_017273	GGA	2	6	250545	250550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_017273	AGA	2	6	250551	250556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_017273	GGCG	2	8	250645	250652	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1079	NC_017273	AGT	2	6	250654	250659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_017273	GGT	2	6	250663	250668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_017273	CGG	2	6	250675	250680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_017273	GGT	2	6	250688	250693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_017273	TGG	2	6	250708	250713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_017273	G	6	6	250732	250737	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_017273	CTC	2	6	250775	250780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1086	NC_017273	CTCG	2	8	250838	250845	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1087	NC_017273	GAA	2	6	250862	250867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_017273	AGG	2	6	250875	250880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_017273	CGG	2	6	250882	250887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_017273	CTC	2	6	250894	250899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1091	NC_017273	CCT	2	6	250902	250907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1092	NC_017273	CTC	2	6	250936	250941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1093	NC_017273	CCT	4	12	250986	250997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1094	NC_017273	GTG	2	6	251017	251022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_017273	GCC	2	6	251029	251034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1096	NC_017273	CTC	2	6	251035	251040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1097	NC_017273	CGC	2	6	251073	251078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1098	NC_017273	CTC	2	6	251095	251100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1099	NC_017273	GGA	2	6	251223	251228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_017273	CCT	3	9	251238	251246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1101	NC_017273	CTC	2	6	251260	251265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1102	NC_017273	CCT	2	6	251267	251272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NC_017273	TGA	2	6	251288	251293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_017273	GCC	2	6	251318	251323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1105	NC_017273	GCG	2	6	251328	251333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_017273	GAA	2	6	251335	251340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_017273	CTC	2	6	251356	251361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1108	NC_017273	CGCCT	2	10	251389	251398	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1109	NC_017273	TCC	2	6	252993	252998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_017273	GGAC	2	8	253043	253050	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1111	NC_017273	CCT	2	6	254685	254690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1112	NC_017273	A	6	6	254749	254754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_017273	TCCC	2	8	257235	257242	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1114	NC_017273	CCCCT	2	10	258674	258683	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
1115	NC_017273	C	7	7	260300	260306	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1116	NC_017273	AGG	2	6	260329	260334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_017273	CGG	2	6	260431	260436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_017273	GCCC	2	8	260466	260473	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1119	NC_017273	GC	4	8	260487	260494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1120	NC_017273	TCC	2	6	260518	260523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1121	NC_017273	GCC	2	6	260563	260568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1122	NC_017273	AAG	2	6	260595	260600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_017273	C	6	6	260627	260632	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1124	NC_017273	G	6	6	265622	265627	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_017273	GCGG	3	12	265697	265708	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1126	NC_017273	CCCCT	2	10	265733	265742	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
1127	NC_017273	G	6	6	265786	265791	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_017273	CCCCT	2	10	265846	265855	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
1129	NC_017273	CGCCCT	2	12	265963	265974	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
1130	NC_017273	GTT	2	6	265975	265980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_017273	ATT	2	6	265985	265990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_017273	TGA	2	6	266022	266027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_017273	TCA	2	6	266030	266035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_017273	G	6	6	266071	266076	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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1136	NC_017273	ACC	2	6	268354	268359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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