MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 plasmid pTHTHE1601

Total Repeats: 1638

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017273	TAC	2	6	12	17	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017273	AGA	2	6	33	38	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017273	GTA	2	6	46	51	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017273	AGG	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017273	AGG	2	6	6409	6414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017273	TTC	2	6	7636	7641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017273	CCT	2	6	7658	7663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_017273	TAA	2	6	7673	7678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017273	AGG	2	6	7688	7693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017273	TCCTGT	2	12	7716	7727	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017273	GGC	2	6	7772	7777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017273	TCCT	2	8	7842	7849	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017273	GCG	2	6	7857	7862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017273	TGGGGG	2	12	8620	8631	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017273	CGG	2	6	8689	8694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017273	TGG	3	9	8748	8756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017273	C	6	6	8804	8809	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18	NC_017273	GAAGG	2	10	8837	8846	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017273	C	6	6	10770	10775	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
20	NC_017273	TCC	2	6	10879	10884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_017273	CGCC	2	8	10976	10983	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
22	NC_017273	CTTCC	2	10	10994	11003	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
23	NC_017273	CTC	2	6	11034	11039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_017273	TC	4	8	11038	11045	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017273	C	6	6	11068	11073	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
26	NC_017273	CGGAGG	2	12	11081	11092	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017273	GCCAGG	2	12	11103	11114	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017273	AGG	2	6	11123	11128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017273	G	6	6	11164	11169	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017273	GCC	2	6	11194	11199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_017273	GA	4	8	11225	11232	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017273	CT	3	6	11240	11245	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017273	GTCC	2	8	11264	11271	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017273	GTCCG	2	10	11376	11385	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
35	NC_017273	G	6	6	11392	11397	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017273	CT	3	6	11476	11481	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017273	GCC	2	6	11667	11672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_017273	TGG	2	6	11703	11708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017273	CTTC	2	8	11724	11731	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017273	GAA	2	6	11737	11742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017273	GCG	2	6	11803	11808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017273	AGGA	2	8	11855	11862	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017273	AGGA	2	8	11903	11910	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017273	GAGC	2	8	11923	11930	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017273	AGGG	2	8	11968	11975	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017273	TGG	2	6	12093	12098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017273	GGGCC	2	10	12144	12153	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
48	NC_017273	GCGG	2	8	12162	12169	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017273	G	6	6	12232	12237	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017273	GAG	2	6	12259	12264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017273	TGC	2	6	12296	12301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017273	ACT	2	6	12428	12433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017273	ACC	2	6	12437	12442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_017273	G	7	7	12462	12468	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017273	AGG	2	6	12500	12505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017273	ACAGCC	2	12	13102	13113	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017273	CTC	2	6	13134	13139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_017273	GGGCGT	2	12	13187	13198	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017273	GGA	2	6	13206	13211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017273	CCCT	2	8	13241	13248	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
61	NC_017273	ACC	2	6	13280	13285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_017273	C	6	6	13355	13360	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
63	NC_017273	CCG	2	6	13414	13419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_017273	A	6	6	13460	13465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017273	TGG	2	6	13509	13514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017273	GTG	2	6	13520	13525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017273	AGG	2	6	16171	16176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017273	TCC	2	6	16192	16197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_017273	CTAGA	2	10	16271	16280	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017273	GAT	2	6	16282	16287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017273	GAC	2	6	16298	16303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017273	CATTT	2	10	18044	18053	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_017273	CGT	2	6	18067	18072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017273	TTAG	2	8	18092	18099	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017273	CT	3	6	18181	18186	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017273	GGA	2	6	18192	18197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017273	G	6	6	19910	19915	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017273	C	6	6	19951	19956	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
79	NC_017273	C	7	7	20017	20023	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
80	NC_017273	CCGG	2	8	20204	20211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017273	GGT	2	6	20267	20272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017273	AGG	2	6	20367	20372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017273	AGG	3	9	21734	21742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017273	CAAG	2	8	23437	23444	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017273	GGGAA	2	10	23451	23460	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017273	CTC	2	6	23498	23503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_017273	CCG	2	6	23524	23529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_017273	C	6	6	23530	23535	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
89	NC_017273	G	7	7	23914	23920	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017273	C	7	7	23927	23933	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
91	NC_017273	CCT	2	6	24138	24143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_017273	TC	3	6	24329	24334	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017273	GCC	2	6	24359	24364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_017273	GGGA	2	8	24406	24413	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017273	CTC	2	6	24440	24445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_017273	C	6	6	24793	24798	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
97	NC_017273	C	6	6	24813	24818	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
98	NC_017273	G	6	6	24825	24830	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017273	CCT	2	6	26458	26463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_017273	G	6	6	27371	27376	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017273	C	7	7	27385	27391	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
102	NC_017273	CCT	2	6	27646	27651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_017273	C	7	7	27926	27932	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
104	NC_017273	ACC	2	6	27951	27956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_017273	CCT	2	6	27979	27984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_017273	ACC	2	6	28017	28022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_017273	GTG	2	6	28078	28083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017273	GT	3	6	28090	28095	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017273	CCA	2	6	28153	28158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_017273	C	6	6	28206	28211	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
111	NC_017273	CAC	2	6	28221	28226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_017273	C	6	6	28239	28244	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
113	NC_017273	CAC	2	6	28255	28260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_017273	C	7	7	28273	28279	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
115	NC_017273	G	6	6	28312	28317	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017273	C	6	6	28341	28346	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
117	NC_017273	G	6	6	28347	28352	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017273	CAA	2	6	28359	28364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017273	AG	3	6	28418	28423	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017273	GGT	2	6	28458	28463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017273	C	6	6	28464	28469	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
122	NC_017273	AAG	2	6	28476	28481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017273	AGA	2	6	29527	29532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017273	C	6	6	29555	29560	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
125	NC_017273	AAGC	2	8	30385	30392	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017273	GCG	2	6	30410	30415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017273	GCC	2	6	30449	30454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_017273	CCG	2	6	30505	30510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_017273	CAAA	2	8	30818	30825	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017273	AAG	2	6	30860	30865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017273	CAG	2	6	31099	31104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017273	CTGGT	2	10	31124	31133	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_017273	TGG	2	6	31533	31538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017273	G	6	6	31567	31572	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017273	CT	3	6	37823	37828	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017273	AAG	2	6	49244	49249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017273	AAG	2	6	49253	49258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017273	CG	3	6	49312	49317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_017273	ACCCT	2	10	49361	49370	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
140	NC_017273	AT	3	6	54035	54040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017273	TTG	2	6	54060	54065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017273	TCC	2	6	57043	57048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_017273	TTC	2	6	57100	57105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017273	GC	3	6	57192	57197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_017273	AGG	2	6	57901	57906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017273	CCA	2	6	57908	57913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_017273	TGG	2	6	57967	57972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017273	CTG	2	6	57981	57986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_017273	GCCT	2	8	57991	57998	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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458	NC_017273	GCG	2	6	135930	135935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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