MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 3342

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017268	AC	3	6	1003055	1003060	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3002	NC_017268	GTG	2	6	1003096	1003101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_017268	TTTTG	2	10	1003136	1003145	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_017268	T	6	6	1003186	1003191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_017268	GGT	2	6	1003263	1003268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_017268	GCT	2	6	1003311	1003316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_017268	GTT	2	6	1003320	1003325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_017268	GCTAAC	2	12	1003416	1003427	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_017268	TTA	2	6	1003441	1003446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_017268	C	6	6	1003462	1003467	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3011	NC_017268	AACT	2	8	1003485	1003492	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3012	NC_017268	CTC	2	6	1003500	1003505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3013	NC_017268	CAC	2	6	1003509	1003514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3014	NC_017268	TACCGT	2	12	1003533	1003544	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_017268	CCG	2	6	1003595	1003600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3016	NC_017268	CCA	2	6	1003676	1003681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3017	NC_017268	CCT	2	6	1003859	1003864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3018	NC_017268	AC	3	6	1003885	1003890	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3019	NC_017268	GCA	2	6	1003899	1003904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_017268	GC	4	8	1003907	1003914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3021	NC_017268	ACA	2	6	1003947	1003952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_017268	C	6	6	1003953	1003958	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3023	NC_017268	CGC	2	6	1003982	1003987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3024	NC_017268	CAG	2	6	1004076	1004081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_017268	GC	3	6	1004324	1004329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3026	NC_017268	CTC	2	6	1004372	1004377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3027	NC_017268	AAG	2	6	1004379	1004384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_017268	GC	3	6	1004405	1004410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3029	NC_017268	GGAA	2	8	1004415	1004422	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_017268	CACC	2	8	1004476	1004483	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3031	NC_017268	AAG	2	6	1004529	1004534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_017268	GCA	2	6	1004585	1004590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_017268	A	8	8	1004615	1004622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_017268	GCAG	2	8	1004701	1004708	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3035	NC_017268	GC	3	6	1004716	1004721	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3036	NC_017268	TCG	2	6	1004733	1004738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_017268	CTG	2	6	1004742	1004747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_017268	CGT	2	6	1004875	1004880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_017268	CGTC	2	8	1004919	1004926	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3040	NC_017268	G	6	6	1004997	1005002	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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3042	NC_017268	CAA	2	6	1005082	1005087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_017268	ATC	2	6	1005093	1005098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_017268	GTG	2	6	1005119	1005124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_017268	CG	3	6	1005252	1005257	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3046	NC_017268	AT	3	6	1005341	1005346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3048	NC_017268	TGCAG	2	10	1005442	1005451	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3049	NC_017268	AC	3	6	1005479	1005484	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3050	NC_017268	CAG	2	6	1005534	1005539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3052	NC_017268	GTG	2	6	1005585	1005590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_017268	A	7	7	1005690	1005696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_017268	GAG	2	6	1005704	1005709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_017268	GTA	2	6	1005719	1005724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3058	NC_017268	CAGT	2	8	1005876	1005883	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3061	NC_017268	AGCGC	2	10	1006031	1006040	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3062	NC_017268	CAGT	2	8	1006068	1006075	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3063	NC_017268	CG	3	6	1006128	1006133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3064	NC_017268	TGC	2	6	1006152	1006157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3066	NC_017268	GTG	2	6	1006223	1006228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_017268	A	6	6	1006319	1006324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_017268	AGGT	2	8	1006329	1006336	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_017268	CAT	2	6	1006354	1006359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3072	NC_017268	GC	3	6	1006492	1006497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3073	NC_017268	CG	3	6	1006537	1006542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3074	NC_017268	TTC	2	6	1006562	1006567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3081	NC_017268	GC	3	6	1007500	1007505	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3082	NC_017268	TC	3	6	1007533	1007538	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3089	NC_017268	GC	3	6	1018659	1018664	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3090	NC_017268	GC	3	6	1019968	1019973	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3091	NC_017268	CTAC	2	8	1020103	1020110	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3092	NC_017268	GA	3	6	1021499	1021504	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_017268	AC	3	6	1021511	1021516	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3094	NC_017268	CG	3	6	1021527	1021532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3095	NC_017268	TTCA	2	8	1021572	1021579	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3097	NC_017268	GC	3	6	1021628	1021633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3098	NC_017268	A	7	7	1025373	1025379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_017268	CA	3	6	1025919	1025924	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3103	NC_017268	CAC	2	6	1028183	1028188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3104	NC_017268	GCA	2	6	1028189	1028194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3108	NC_017268	CAG	2	6	1029780	1029785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_017268	AG	3	6	1029784	1029789	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_017268	CG	4	8	1033362	1033369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3111	NC_017268	CA	3	6	1033372	1033377	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3112	NC_017268	CAG	2	6	1033385	1033390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_017268	CGC	2	6	1033400	1033405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3114	NC_017268	GA	3	6	1033457	1033462	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_017268	CGT	2	6	1033497	1033502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_017268	GC	3	6	1033511	1033516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3117	NC_017268	CG	3	6	1033595	1033600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3118	NC_017268	GCAC	2	8	1033635	1033642	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3119	NC_017268	GAA	2	6	1033704	1033709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_017268	TCC	2	6	1033895	1033900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3121	NC_017268	CTC	2	6	1033979	1033984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3122	NC_017268	GAG	2	6	1033987	1033992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_017268	CA	3	6	1035015	1035020	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3124	NC_017268	CGC	3	9	1035045	1035053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3125	NC_017268	TGC	2	6	1035101	1035106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3127	NC_017268	AC	3	6	1036379	1036384	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3128	NC_017268	CG	3	6	1037872	1037877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3129	NC_017268	TCTT	2	8	1037895	1037902	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3130	NC_017268	TTTA	2	8	1037910	1037917	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_017268	GTG	2	6	1039266	1039271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_017268	CG	3	6	1039294	1039299	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3133	NC_017268	A	6	6	1039309	1039314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_017268	CGC	2	6	1042341	1042346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3137	NC_017268	TCT	2	6	1043607	1043612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3174	NC_017268	GC	3	6	1053373	1053378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3262	NC_017268	GC	3	6	1083476	1083481	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3263	NC_017268	CTG	2	6	1083544	1083549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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