MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 3342

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017268	G	9	9	156836	156844	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017268	TG	3	6	156861	156866	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017268	A	6	6	156900	156905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017268	GGGT	2	8	156970	156977	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017268	AGG	2	6	157003	157008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017268	CCG	2	6	157036	157041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_017268	CGGGG	2	10	157042	157051	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
508	NC_017268	CG	4	8	157055	157062	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
509	NC_017268	CCGC	2	8	157111	157118	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
510	NC_017268	GC	3	6	157233	157238	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
511	NC_017268	ACT	2	6	157386	157391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_017268	TAC	2	6	157403	157408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_017268	TGC	2	6	157477	157482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_017268	GCG	2	6	157488	157493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_017268	GAA	2	6	157520	157525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017268	GA	4	8	157526	157533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017268	CCG	2	6	157566	157571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_017268	CG	3	6	157598	157603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
519	NC_017268	CCG	2	6	157607	157612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
520	NC_017268	GCC	2	6	157625	157630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_017268	GC	3	6	157650	157655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
522	NC_017268	GC	3	6	157705	157710	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
523	NC_017268	GC	3	6	157768	157773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
524	NC_017268	CG	4	8	157782	157789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
525	NC_017268	GAC	2	6	157918	157923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_017268	CCT	2	6	157951	157956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
527	NC_017268	GT	3	6	157974	157979	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017268	TG	4	8	158004	158011	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017268	GAG	2	6	158014	158019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017268	GGT	2	6	158059	158064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017268	GC	3	6	158065	158070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
532	NC_017268	GGT	2	6	158071	158076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017268	GT	3	6	158075	158080	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017268	TCTT	2	8	159507	159514	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
535	NC_017268	CTG	2	6	159553	159558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_017268	GCAAG	2	10	159656	159665	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
537	NC_017268	AGA	2	6	159694	159699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017268	GGTG	2	8	159739	159746	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
539	NC_017268	AC	3	6	160431	160436	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
540	NC_017268	GCG	2	6	160475	160480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_017268	GC	3	6	165930	165935	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
542	NC_017268	AG	3	6	165956	165961	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017268	GCG	2	6	165978	165983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_017268	CCG	2	6	167021	167026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
545	NC_017268	TGC	2	6	167075	167080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_017268	TGG	2	6	169101	169106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017268	CGC	2	6	169125	169130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_017268	GCG	2	6	169167	169172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_017268	CCA	2	6	169235	169240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_017268	CCG	2	6	169241	169246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_017268	TC	3	6	169305	169310	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
552	NC_017268	AGG	2	6	169327	169332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017268	GTT	2	6	169377	169382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017268	TGG	3	9	169416	169424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017268	GTGG	2	8	169473	169480	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017268	ATT	2	6	169531	169536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017268	GC	3	6	169586	169591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
558	NC_017268	CAC	2	6	169596	169601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_017268	ATC	2	6	169630	169635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_017268	A	6	6	169753	169758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017268	GAT	2	6	169806	169811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017268	TCCC	2	8	169827	169834	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
563	NC_017268	CGTA	2	8	169881	169888	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
564	NC_017268	ATGT	2	8	169938	169945	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017268	TG	3	6	170135	170140	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017268	ATT	2	6	170172	170177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017268	T	8	8	170176	170183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017268	GC	3	6	170198	170203	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
569	NC_017268	T	6	6	170322	170327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017268	ACC	2	6	170354	170359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
571	NC_017268	TTC	2	6	170415	170420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_017268	GC	3	6	170455	170460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
573	NC_017268	AC	3	6	176506	176511	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
574	NC_017268	GA	3	6	176512	176517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017268	TG	3	6	176543	176548	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017268	CCG	2	6	176556	176561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
577	NC_017268	TGCA	2	8	176565	176572	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
578	NC_017268	CT	3	6	177098	177103	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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580	NC_017268	CG	3	6	184511	184516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
581	NC_017268	GCT	2	6	185671	185676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_017268	CTT	2	6	185697	185702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_017268	TTTTC	2	10	185740	185749	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
584	NC_017268	AGA	2	6	186780	186785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_017268	TTG	2	6	190210	190215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_017268	AGAGG	2	10	190216	190225	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
587	NC_017268	GTAT	2	8	191013	191020	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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589	NC_017268	T	6	6	191246	191251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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591	NC_017268	GAG	2	6	191333	191338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
592	NC_017268	GC	3	6	191342	191347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
593	NC_017268	TGT	2	6	191401	191406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_017268	GGTG	2	8	191410	191417	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
595	NC_017268	GGT	2	6	191425	191430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
596	NC_017268	TG	3	6	191434	191439	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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599	NC_017268	TG	3	6	191550	191555	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
600	NC_017268	TGCAG	2	10	191581	191590	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
601	NC_017268	ATG	2	6	191592	191597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_017268	CT	3	6	191747	191752	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
603	NC_017268	TTA	2	6	191934	191939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017268	GCG	2	6	192011	192016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_017268	GTG	2	6	192104	192109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
606	NC_017268	G	6	6	192157	192162	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
607	NC_017268	GTT	2	6	192183	192188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_017268	TGG	2	6	192691	192696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
609	NC_017268	G	6	6	192695	192700	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017268	GAT	2	6	192711	192716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017268	TCT	2	6	192730	192735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_017268	CCT	2	6	192761	192766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_017268	TAGT	2	8	192785	192792	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
614	NC_017268	AGC	2	6	192920	192925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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617	NC_017268	T	7	7	193153	193159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_017268	AGC	2	6	193171	193176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_017268	GGAAGA	2	12	193200	193211	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
620	NC_017268	C	7	7	193223	193229	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
621	NC_017268	A	6	6	193262	193267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017268	CTC	2	6	193269	193274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
623	NC_017268	GACACT	2	12	193361	193372	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_017268	GC	3	6	193416	193421	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
625	NC_017268	CAG	2	6	193436	193441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_017268	GC	3	6	193449	193454	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
627	NC_017268	GGTGAG	2	12	193524	193535	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017268	A	6	6	193563	193568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017268	GAGT	2	8	193580	193587	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
630	NC_017268	ACA	2	6	193607	193612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_017268	AG	3	6	193666	193671	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
632	NC_017268	CCA	2	6	193699	193704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
633	NC_017268	GTC	2	6	193719	193724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_017268	AAC	2	6	193738	193743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_017268	A	6	6	193757	193762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_017268	TCA	2	6	193783	193788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_017268	CG	3	6	193850	193855	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
638	NC_017268	GCT	2	6	193886	193891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_017268	GC	3	6	193987	193992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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