MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 1724

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016844	AGA	2	6	1002595	1002600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_016844	ACA	2	6	1004637	1004642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_016844	C	6	6	1004643	1004648	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1504	NC_016844	CGC	2	6	1004672	1004677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1505	NC_016844	CAG	2	6	1004766	1004771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_016844	C	9	9	1007323	1007331	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1507	NC_016844	TGC	2	6	1007430	1007435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_016844	GC	3	6	1007457	1007462	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1509	NC_016844	CTG	2	6	1007528	1007533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_016844	GAG	3	9	1007639	1007647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_016844	TTG	2	6	1008142	1008147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_016844	CTGC	2	8	1008180	1008187	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1513	NC_016844	GC	3	6	1008189	1008194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1514	NC_016844	TC	3	6	1008222	1008227	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1515	NC_016844	GCA	2	6	1013874	1013879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_016844	CA	3	6	1015351	1015356	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1517	NC_016844	CTC	2	6	1019553	1019558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1518	NC_016844	GC	3	6	1020657	1020662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1519	NC_016844	AGC	2	6	1020695	1020700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_016844	CAAC	2	8	1020765	1020772	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1521	NC_016844	CTAC	2	8	1020792	1020799	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1522	NC_016844	CTC	2	6	1022293	1022298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1523	NC_016844	GC	3	6	1022317	1022322	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1524	NC_016844	CT	4	8	1025894	1025901	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1525	NC_016844	TAG	2	6	1025974	1025979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_016844	T	7	7	1026024	1026030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_016844	A	6	6	1026032	1026037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_016844	A	7	7	1026062	1026068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_016844	CA	3	6	1026608	1026613	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1530	NC_016844	CCT	2	6	1026642	1026647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1531	NC_016844	AAC	2	6	1028850	1028855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_016844	CAC	2	6	1028872	1028877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1533	NC_016844	GCA	2	6	1028878	1028883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_016844	AAG	2	6	1028906	1028911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_016844	CAAA	2	8	1029652	1029659	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1536	NC_016844	AAC	2	6	1029691	1029696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_016844	CAG	2	6	1030469	1030474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_016844	AG	3	6	1030473	1030478	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_016844	TGC	2	6	1035790	1035795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_016844	TCCC	2	8	1037060	1037067	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1541	NC_016844	AC	3	6	1037068	1037073	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1542	NC_016844	CG	3	6	1038561	1038566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1543	NC_016844	TCTT	2	8	1038584	1038591	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1544	NC_016844	TTTA	2	8	1038599	1038606	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_016844	GTG	2	6	1039955	1039960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_016844	CG	3	6	1039983	1039988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1547	NC_016844	A	6	6	1039998	1040003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_016844	CGC	2	6	1043030	1043035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1549	NC_016844	TGC	2	6	1043041	1043046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_016844	CCTC	2	8	1044258	1044265	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1551	NC_016844	TCT	2	6	1044296	1044301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_016844	ACT	2	6	1045213	1045218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_016844	T	6	6	1045218	1045223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_016844	CG	4	8	1046490	1046497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1555	NC_016844	CCT	2	6	1046505	1046510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1556	NC_016844	CA	4	8	1046560	1046567	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1557	NC_016844	CTTC	2	8	1049465	1049472	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1558	NC_016844	C	6	6	1051124	1051129	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1559	NC_016844	GCA	2	6	1051138	1051143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_016844	AGA	2	6	1055929	1055934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_016844	A	7	7	1055953	1055959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_016844	AGC	2	6	1056002	1056007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_016844	GCACT	2	10	1056013	1056022	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1564	NC_016844	GC	4	8	1056058	1056065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1565	NC_016844	ATG	2	6	1058293	1058298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_016844	ACA	2	6	1059957	1059962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_016844	GCCT	2	8	1059992	1059999	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1568	NC_016844	ACC	3	9	1061175	1061183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1569	NC_016844	CAA	2	6	1061196	1061201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_016844	GC	3	6	1064038	1064043	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1571	NC_016844	CG	3	6	1064114	1064119	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1572	NC_016844	TG	3	6	1064120	1064125	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_016844	CG	3	6	1064127	1064132	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1574	NC_016844	CG	3	6	1064160	1064165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1575	NC_016844	CAG	2	6	1064971	1064976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_016844	GGC	2	6	1067232	1067237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_016844	CTCG	2	8	1072477	1072484	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1578	NC_016844	TACC	2	8	1072496	1072503	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1579	NC_016844	G	8	8	1072505	1072512	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_016844	GCAC	2	8	1073414	1073421	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1581	NC_016844	TTC	2	6	1073900	1073905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_016844	AAG	2	6	1074526	1074531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_016844	GAG	2	6	1078631	1078636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_016844	TCC	2	6	1079128	1079133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1585	NC_016844	GAGAC	2	10	1080339	1080348	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1586	NC_016844	GAT	2	6	1081420	1081425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_016844	T	6	6	1082913	1082918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_016844	ATA	2	6	1083067	1083072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_016844	TCCA	2	8	1083092	1083099	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1590	NC_016844	CCG	2	6	1083141	1083146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1591	NC_016844	TAA	2	6	1083153	1083158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_016844	CATA	2	8	1083180	1083187	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1593	NC_016844	CAA	2	6	1083242	1083247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_016844	AAG	2	6	1083264	1083269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_016844	CAC	2	6	1083277	1083282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1596	NC_016844	CTG	2	6	1083304	1083309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1597	NC_016844	CT	3	6	1083415	1083420	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1598	NC_016844	CTG	2	6	1083501	1083506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_016844	TC	3	6	1083537	1083542	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1600	NC_016844	CAA	2	6	1083613	1083618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_016844	T	6	6	1083620	1083625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_016844	CTG	2	6	1083675	1083680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_016844	TTC	2	6	1083734	1083739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_016844	CCT	2	6	1083741	1083746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1605	NC_016844	CCG	2	6	1083765	1083770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1606	NC_016844	TCG	2	6	1083872	1083877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_016844	ATA	2	6	1083931	1083936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_016844	GCT	2	6	1083942	1083947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_016844	AAT	2	6	1083964	1083969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_016844	CG	3	6	1083971	1083976	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1611	NC_016844	CAA	2	6	1084000	1084005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_016844	CCG	2	6	1084064	1084069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1613	NC_016844	TAA	2	6	1084110	1084115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_016844	GCT	2	6	1084116	1084121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_016844	CA	3	6	1084127	1084132	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1616	NC_016844	GTG	2	6	1084151	1084156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_016844	GC	3	6	1084165	1084170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1618	NC_016844	CTG	2	6	1084233	1084238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_016844	A	6	6	1084243	1084248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_016844	AGA	2	6	1084363	1084368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_016844	GCG	2	6	1084389	1084394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_016844	GCA	2	6	1084401	1084406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_016844	AC	3	6	1084440	1084445	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1624	NC_016844	CA	3	6	1084455	1084460	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1625	NC_016844	CATGC	2	10	1084501	1084510	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1626	NC_016844	AAC	2	6	1084564	1084569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_016844	TG	3	6	1086413	1086418	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_016844	TTCC	2	8	1087824	1087831	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1629	NC_016844	TCC	2	6	1087921	1087926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1630	NC_016844	ACG	2	6	1090429	1090434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_016844	A	6	6	1090491	1090496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_016844	GC	3	6	1090551	1090556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1633	NC_016844	CTT	2	6	1090557	1090562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_016844	GGC	2	6	1090572	1090577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1637	NC_016844	AAG	2	6	1093388	1093393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1643	NC_016844	TCCG	2	8	1102493	1102500	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1644	NC_016844	CG	3	6	1102588	1102593	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1653	NC_016844	TTC	2	6	1106043	1106048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1669	NC_016844	CTG	2	6	1120239	1120244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1677	NC_016844	GC	3	6	1125905	1125910	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1724	NC_016844	CG	3	6	1139915	1139920	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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