MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Tannerella forsythia ATCC 43037 chromosome

Total Repeats: 10094

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_016610	GT	3	6	3362119	3362124	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_016610	GAC	2	6	3362284	3362289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10003	NC_016610	GCA	2	6	3362296	3362301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10004	NC_016610	GAA	2	6	3362323	3362328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_016610	CGT	2	6	3362342	3362347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10006	NC_016610	ATC	2	6	3362381	3362386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10007	NC_016610	TCC	2	6	3362403	3362408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10008	NC_016610	ATC	2	6	3362523	3362528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10009	NC_016610	TCC	2	6	3362804	3362809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10010	NC_016610	GCT	2	6	3362821	3362826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10011	NC_016610	AAG	2	6	3362902	3362907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_016610	CTG	2	6	3362984	3362989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10013	NC_016610	GTT	2	6	3363336	3363341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_016610	T	7	7	3363349	3363355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_016610	AT	3	6	3363379	3363384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_016610	T	6	6	3363417	3363422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_016610	TAC	2	6	3363427	3363432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10018	NC_016610	A	6	6	3363853	3363858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_016610	ATC	2	6	3363867	3363872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10020	NC_016610	A	7	7	3366371	3366377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_016610	TAA	2	6	3368265	3368270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_016610	A	7	7	3368332	3368338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_016610	CCA	2	6	3368349	3368354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10024	NC_016610	A	6	6	3368354	3368359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_016610	GT	3	6	3368368	3368373	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_016610	AC	3	6	3368391	3368396	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10027	NC_016610	AAC	2	6	3368492	3368497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10028	NC_016610	A	6	6	3369670	3369675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_016610	CGATA	2	10	3371196	3371205	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10030	NC_016610	GAA	2	6	3371231	3371236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_016610	T	6	6	3371250	3371255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_016610	CCT	2	6	3371284	3371289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10033	NC_016610	CAC	2	6	3371297	3371302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10034	NC_016610	TCCAC	2	10	3371319	3371328	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
10035	NC_016610	AAC	2	6	3371337	3371342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10036	NC_016610	TTACCT	2	12	3371359	3371370	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10037	NC_016610	A	7	7	3371375	3371381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_016610	TGT	2	6	3373458	3373463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_016610	AAC	2	6	3373493	3373498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10040	NC_016610	AGG	2	6	3373505	3373510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10041	NC_016610	AGA	2	6	3373605	3373610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10042	NC_016610	GTT	2	6	3374898	3374903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_016610	AATA	2	8	3374948	3374955	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_016610	A	6	6	3377003	3377008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_016610	CGT	2	6	3377046	3377051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10046	NC_016610	CCCG	2	8	3377067	3377074	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10047	NC_016610	TA	3	6	3377240	3377245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10048	NC_016610	A	7	7	3377261	3377267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10049	NC_016610	ACTC	2	8	3377277	3377284	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10050	NC_016610	TCTT	2	8	3377291	3377298	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10051	NC_016610	ACA	2	6	3377301	3377306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10052	NC_016610	A	6	6	3377376	3377381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_016610	A	7	7	3377397	3377403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_016610	TTC	2	6	3381202	3381207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10055	NC_016610	TGC	2	6	3381223	3381228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10056	NC_016610	TAA	2	6	3381234	3381239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_016610	TCG	2	6	3381255	3381260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10058	NC_016610	ATT	2	6	3381302	3381307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_016610	TATT	2	8	3381313	3381320	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_016610	TAA	2	6	3384829	3384834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_016610	T	6	6	3384852	3384857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_016610	A	7	7	3388878	3388884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_016610	CA	3	6	3391688	3391693	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10064	NC_016610	CCCTCC	2	12	3396392	3396403	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
10065	NC_016610	ATC	2	6	3398284	3398289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10066	NC_016610	AT	3	6	3399328	3399333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10067	NC_016610	AACAGA	2	12	3399334	3399345	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10068	NC_016610	C	7	7	3400744	3400750	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10069	NC_016610	C	11	11	3400768	3400778	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10070	NC_016610	T	6	6	3400779	3400784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10071	NC_016610	CCG	2	6	3402352	3402357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10072	NC_016610	A	8	8	3402368	3402375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_016610	AT	3	6	3402395	3402400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_016610	AGG	2	6	3403098	3403103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_016610	T	7	7	3403604	3403610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10076	NC_016610	ATT	2	6	3403625	3403630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10077	NC_016610	TGC	2	6	3403636	3403641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10078	NC_016610	AT	3	6	3403656	3403661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10079	NC_016610	CAA	2	6	3404854	3404859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10080	NC_016610	TA	3	6	3404893	3404898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_016610	ATT	2	6	3404947	3404952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10082	NC_016610	TTG	2	6	3405001	3405006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10083	NC_016610	CAA	2	6	3405052	3405057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10084	NC_016610	GAA	2	6	3405087	3405092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10085	NC_016610	CAA	2	6	3405104	3405109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10086	NC_016610	A	6	6	3405130	3405135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10087	NC_016610	ATG	2	6	3405234	3405239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10088	NC_016610	ATC	2	6	3405270	3405275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10089	NC_016610	AAC	2	6	3405368	3405373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10090	NC_016610	TCG	2	6	3405390	3405395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10091	NC_016610	ATG	2	6	3405421	3405426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10092	NC_016610	ACA	2	6	3405453	3405458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10093	NC_016610	GCC	2	6	3405471	3405476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10094	NC_016610	TGAG	2	8	3405478	3405485	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.