MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermovirga lienii DSM 17291 chromosome

Total Repeats: 3887

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016148	TGAA	2	8	437667	437674	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_016148	TAA	2	6	437679	437684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_016148	TAT	2	6	437687	437692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_016148	GAA	2	6	437717	437722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_016148	AAT	2	6	439898	439903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_016148	GGA	2	6	439974	439979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_016148	A	6	6	441446	441451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_016148	TTTAT	2	10	441498	441507	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_016148	AAT	3	9	441508	441516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_016148	GAG	2	6	441560	441565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_016148	C	6	6	442146	442151	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1012	NC_016148	TAT	2	6	442175	442180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_016148	CGC	2	6	442191	442196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1014	NC_016148	T	6	6	442263	442268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_016148	GGC	2	6	442301	442306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_016148	TACC	2	8	442403	442410	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1017	NC_016148	AGGG	2	8	442413	442420	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_016148	GGA	2	6	442472	442477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_016148	TGG	2	6	442515	442520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_016148	GCA	2	6	442613	442618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_016148	CGC	2	6	442660	442665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1022	NC_016148	GAA	2	6	442672	442677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_016148	TGT	2	6	442699	442704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_016148	GAA	2	6	442709	442714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_016148	CAG	2	6	442759	442764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_016148	GC	3	6	442817	442822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1027	NC_016148	CTG	2	6	442839	442844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_016148	GGA	2	6	442950	442955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_016148	GGC	2	6	442970	442975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_016148	GAA	2	6	443212	443217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_016148	GGGA	2	8	443259	443266	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_016148	TGC	2	6	443297	443302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_016148	GTC	2	6	443309	443314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_016148	TCGTG	2	10	443318	443327	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1035	NC_016148	GGA	2	6	443423	443428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_016148	TCA	2	6	443448	443453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_016148	AC	3	6	443474	443479	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1038	NC_016148	AC	3	6	443644	443649	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1039	NC_016148	CAC	2	6	443659	443664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1040	NC_016148	GAG	2	6	443708	443713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_016148	G	6	6	443736	443741	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_016148	CCT	2	6	443787	443792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1043	NC_016148	ATG	2	6	443805	443810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_016148	AT	4	8	443867	443874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_016148	GAA	2	6	443942	443947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_016148	GTA	2	6	444047	444052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_016148	GTGAA	2	10	444065	444074	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_016148	GGA	3	9	444089	444097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_016148	AGT	2	6	444119	444124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_016148	GTG	2	6	444309	444314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_016148	ACC	2	6	444368	444373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_016148	TAC	2	6	444387	444392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_016148	GCA	2	6	444407	444412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_016148	GAA	2	6	444525	444530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_016148	GGA	2	6	444685	444690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_016148	AAC	2	6	444939	444944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_016148	AGG	2	6	445013	445018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_016148	AGC	2	6	445029	445034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_016148	TGG	2	6	445189	445194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_016148	TCC	2	6	445286	445291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1061	NC_016148	CAG	2	6	445340	445345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_016148	AGG	2	6	445396	445401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_016148	G	6	6	445443	445448	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_016148	GAG	2	6	445550	445555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_016148	GCTG	2	8	445590	445597	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1066	NC_016148	GA	3	6	445615	445620	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_016148	CCAGGC	2	12	445726	445737	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1068	NC_016148	TAA	2	6	445745	445750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_016148	AGGGG	2	10	445821	445830	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_016148	CGG	2	6	445871	445876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_016148	GTG	2	6	446015	446020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_016148	ACC	2	6	446142	446147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1073	NC_016148	CCT	2	6	446230	446235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1074	NC_016148	GC	3	6	446250	446255	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1075	NC_016148	CGG	2	6	446366	446371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_016148	TCG	2	6	446482	446487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_016148	CGT	2	6	446562	446567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_016148	CCA	2	6	446587	446592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1079	NC_016148	GCT	2	6	446616	446621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_016148	CGGAT	2	10	446702	446711	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1081	NC_016148	CT	3	6	446870	446875	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1082	NC_016148	CAT	2	6	446887	446892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_016148	AT	3	6	446891	446896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_016148	GT	3	6	446904	446909	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_016148	TGG	2	6	446929	446934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_016148	CGC	2	6	447032	447037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1087	NC_016148	AC	3	6	447068	447073	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1088	NC_016148	A	6	6	447084	447089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_016148	A	7	7	447097	447103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_016148	A	6	6	447114	447119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_016148	CAAAAA	2	12	447140	447151	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1092	NC_016148	A	6	6	447157	447162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_016148	A	7	7	447164	447170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_016148	TA	3	6	447288	447293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_016148	A	6	6	447299	447304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_016148	TCC	2	6	448462	448467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1097	NC_016148	TTA	2	6	448512	448517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_016148	TA	3	6	448516	448521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_016148	TAT	2	6	448532	448537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_016148	AAG	2	6	448577	448582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_016148	TGG	2	6	449646	449651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_016148	AGG	2	6	450508	450513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_016148	A	7	7	458008	458014	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_016148	GTC	2	6	458055	458060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_016148	TGT	2	6	458065	458070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_016148	AGG	2	6	458580	458585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_016148	T	6	6	459054	459059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_016148	A	6	6	459085	459090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_016148	ATGGAA	2	12	459120	459131	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_016148	A	7	7	459164	459170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_016148	AGT	2	6	459208	459213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_016148	AGT	2	6	459277	459282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_016148	TG	3	6	459307	459312	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_016148	T	6	6	459323	459328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_016148	TTTG	2	8	459346	459353	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_016148	AGA	2	6	460755	460760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_016148	GACC	2	8	460784	460791	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_016148	AGC	2	6	467338	467343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_016148	CAG	2	6	467355	467360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_016148	GTC	2	6	467361	467366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_016148	AGG	2	6	467404	467409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_016148	TA	3	6	467433	467438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_016148	AG	3	6	467461	467466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_016148	AGG	2	6	467492	467497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_016148	G	6	6	467552	467557	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_016148	A	7	7	470709	470715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_016148	G	6	6	470803	470808	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_016148	GCA	2	6	470827	470832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_016148	GACG	2	8	470848	470855	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1130	NC_016148	TCC	3	9	470872	470880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1131	NC_016148	C	6	6	470879	470884	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1132	NC_016148	GTAG	2	8	470910	470917	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_016148	AG	3	6	470979	470984	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_016148	AGGGAA	2	12	471061	471072	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_016148	ATA	2	6	471075	471080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_016148	ACGCA	2	10	472510	472519	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1137	NC_016148	GGA	3	9	472871	472879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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