MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermovirga lienii DSM 17291 chromosome

Total Repeats: 3887

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016148	CAT	2	6	244578	244583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_016148	AGA	2	6	244623	244628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_016148	GAA	2	6	244630	244635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_016148	AGGCA	2	10	244674	244683	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
505	NC_016148	AT	3	6	244742	244747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_016148	A	7	7	244770	244776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_016148	AGT	2	6	244803	244808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_016148	ATG	2	6	244816	244821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_016148	CCCT	2	8	244856	244863	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
510	NC_016148	AAG	2	6	244873	244878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_016148	CTTAAT	2	12	244882	244893	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
512	NC_016148	AGG	2	6	244898	244903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
513	NC_016148	AC	3	6	246177	246182	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
514	NC_016148	CAA	2	6	246234	246239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_016148	AGG	2	6	246248	246253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
516	NC_016148	GGCT	2	8	246279	246286	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
517	NC_016148	GAT	2	6	246295	246300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_016148	TGA	2	6	246318	246323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_016148	CCA	2	6	246434	246439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
520	NC_016148	TA	4	8	246470	246477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_016148	AGG	2	6	246570	246575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
522	NC_016148	GTT	2	6	246589	246594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_016148	GGA	2	6	246685	246690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_016148	ACC	2	6	246709	246714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_016148	GGCG	2	8	246738	246745	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
526	NC_016148	CTG	2	6	246746	246751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_016148	A	6	6	246752	246757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_016148	A	7	7	246786	246792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_016148	A	6	6	246847	246852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_016148	A	6	6	246922	246927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_016148	CCTT	2	8	246962	246969	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
532	NC_016148	GGAA	2	8	247002	247009	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
533	NC_016148	CGC	2	6	247038	247043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
534	NC_016148	GCA	2	6	247049	247054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_016148	T	7	7	247084	247090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_016148	GT	4	8	247133	247140	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
537	NC_016148	G	6	6	252005	252010	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
538	NC_016148	TGA	2	6	253944	253949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_016148	CTT	2	6	253964	253969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_016148	AGGG	2	8	253979	253986	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
541	NC_016148	CAT	2	6	254021	254026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_016148	ACT	2	6	254034	254039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_016148	TGC	2	6	254046	254051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_016148	GAT	2	6	254059	254064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_016148	TTC	2	6	254068	254073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_016148	TGG	2	6	254090	254095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
547	NC_016148	TAT	2	6	256303	256308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_016148	CCGTC	2	10	256345	256354	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
549	NC_016148	GCG	2	6	256559	256564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_016148	GAA	2	6	256667	256672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_016148	CCT	2	6	256680	256685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
552	NC_016148	AT	3	6	256860	256865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_016148	ACA	2	6	257042	257047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_016148	ATATT	2	10	257119	257128	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_016148	CATCC	2	10	257298	257307	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
556	NC_016148	GAT	2	6	257332	257337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_016148	CTC	2	6	257370	257375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_016148	T	6	6	257442	257447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_016148	ACT	2	6	257561	257566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_016148	TC	3	6	257698	257703	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
561	NC_016148	CCA	2	6	257767	257772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
562	NC_016148	T	6	6	257857	257862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_016148	TTTCC	2	10	257884	257893	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
564	NC_016148	TG	3	6	257938	257943	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
565	NC_016148	ACT	2	6	257944	257949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_016148	TC	3	6	258036	258041	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
567	NC_016148	AT	3	6	258169	258174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_016148	CAA	2	6	258184	258189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_016148	TGC	2	6	258196	258201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_016148	GGC	2	6	258217	258222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_016148	AGGG	2	8	258235	258242	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
572	NC_016148	TAT	2	6	259139	259144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_016148	CAAC	2	8	259211	259218	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
574	NC_016148	GTG	2	6	259402	259407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
575	NC_016148	CAC	2	6	259413	259418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
576	NC_016148	GAG	2	6	259444	259449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
577	NC_016148	CCT	2	6	260949	260954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
578	NC_016148	T	7	7	260965	260971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_016148	GGA	2	6	261028	261033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
580	NC_016148	TGA	2	6	261112	261117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_016148	AGG	2	6	261134	261139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
582	NC_016148	GGAA	2	8	261141	261148	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
583	NC_016148	AGA	2	6	261492	261497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_016148	CAA	2	6	263864	263869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_016148	GCT	2	6	263870	263875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_016148	A	6	6	263896	263901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_016148	AG	3	6	263996	264001	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
588	NC_016148	TTG	2	6	264074	264079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_016148	TAAAG	2	10	264109	264118	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
590	NC_016148	TGT	2	6	264132	264137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_016148	GAA	2	6	265014	265019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_016148	AGC	2	6	265026	265031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_016148	TC	3	6	266633	266638	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
594	NC_016148	TC	3	6	266642	266647	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
595	NC_016148	AGT	2	6	266654	266659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_016148	A	6	6	267488	267493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_016148	GGCA	2	8	267546	267553	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
598	NC_016148	TGG	2	6	267563	267568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
599	NC_016148	A	6	6	267604	267609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_016148	GAA	2	6	270461	270466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_016148	T	7	7	270467	270473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_016148	TGT	2	6	270497	270502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_016148	T	7	7	270539	270545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_016148	T	6	6	270563	270568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_016148	T	8	8	270571	270578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_016148	TA	3	6	273239	273244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_016148	AGG	2	6	273247	273252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
608	NC_016148	ATT	2	6	278970	278975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_016148	AG	3	6	278978	278983	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
610	NC_016148	AGA	2	6	279000	279005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_016148	TAT	2	6	279061	279066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_016148	TTTTAG	2	12	279140	279151	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
613	NC_016148	CAA	2	6	279182	279187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_016148	TCC	2	6	279257	279262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_016148	CGA	2	6	279650	279655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_016148	GTC	2	6	279661	279666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_016148	TTCT	2	8	279797	279804	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
618	NC_016148	TCC	2	6	279857	279862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
619	NC_016148	ACG	2	6	279978	279983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_016148	ACA	2	6	280102	280107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_016148	AAC	2	6	280187	280192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_016148	CGC	2	6	280241	280246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
623	NC_016148	AAT	2	6	280314	280319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_016148	TTC	2	6	280790	280795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_016148	TCC	2	6	280833	280838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_016148	T	6	6	280843	280848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_016148	CAT	2	6	280923	280928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_016148	AAC	2	6	280966	280971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_016148	CCGA	2	8	281040	281047	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
630	NC_016148	AC	3	6	281096	281101	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
631	NC_016148	CGG	2	6	281175	281180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_016148	TGC	2	6	281298	281303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_016148	CT	3	6	281440	281445	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
634	NC_016148	ACC	2	6	281690	281695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
635	NC_016148	T	6	6	281712	281717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_016148	CAATT	2	10	281759	281768	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
637	NC_016148	AATA	2	8	282106	282113	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_016148	CAA	2	6	282156	282161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_016148	AGA	2	6	282167	282172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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921	NC_016148	TGT	2	6	398095	398100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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948	NC_016148	TGT	2	6	405029	405034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
949	NC_016148	CTT	2	6	405067	405072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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952	NC_016148	GGT	2	6	406220	406225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
953	NC_016148	CAT	2	6	406246	406251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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