MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermovirga lienii DSM 17291 chromosome

Total Repeats: 3887

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016148	ATT	2	6	10	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016148	T	6	6	52	57	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016148	AAGG	2	8	1433	1440	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016148	TTG	2	6	1513	1518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016148	T	7	7	1529	1535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016148	A	6	6	1547	1552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016148	ATT	2	6	1556	1561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016148	CTA	2	6	1572	1577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016148	AT	3	6	1587	1592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016148	TAA	2	6	7060	7065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016148	TAA	2	6	7084	7089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016148	A	6	6	7101	7106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016148	CCT	2	6	8276	8281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_016148	GTT	3	9	8297	8305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016148	GCA	2	6	8306	8311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016148	A	6	6	8396	8401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016148	AGGAA	2	10	8406	8415	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016148	TGG	2	6	8423	8428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016148	GTAA	2	8	8474	8481	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016148	ATAAA	2	10	8489	8498	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016148	AGG	2	6	8503	8508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016148	TTA	2	6	8564	8569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016148	T	8	8	10039	10046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016148	GGT	2	6	10053	10058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016148	A	6	6	10074	10079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016148	AGGGG	2	10	10095	10104	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016148	TG	3	6	10127	10132	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016148	TGA	2	6	11412	11417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016148	CTT	2	6	11432	11437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016148	AGGG	2	8	11447	11454	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016148	CAT	2	6	11489	11494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_016148	ATAA	2	8	14042	14049	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016148	AGG	2	6	14051	14056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016148	CCT	2	6	14078	14083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_016148	CTTT	2	8	15977	15984	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_016148	CTG	2	6	16000	16005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_016148	AT	3	6	16014	16019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016148	TAA	2	6	16060	16065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016148	AGT	2	6	16078	16083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016148	ATA	2	6	16109	16114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016148	GAT	2	6	16116	16121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016148	TTTG	2	8	16122	16129	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016148	TCA	2	6	16134	16139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_016148	ATG	3	9	16140	16148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016148	GA	3	6	16157	16162	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016148	GAG	3	9	16886	16894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016148	ATG	2	6	18553	18558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016148	AGG	2	6	18567	18572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016148	C	6	6	19606	19611	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
50	NC_016148	ATT	2	6	19633	19638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016148	AAAT	2	8	20459	20466	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016148	TGT	2	6	20507	20512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016148	ATAAAA	2	12	20515	20526	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016148	AGG	2	6	21544	21549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016148	CA	3	6	22741	22746	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_016148	AGG	2	6	22752	22757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016148	GCGG	2	8	23491	23498	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
58	NC_016148	CAAGG	2	10	24300	24309	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_016148	ATTT	2	8	24317	24324	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016148	CAT	2	6	24352	24357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_016148	TAA	2	6	24364	24369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016148	AGG	2	6	24404	24409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016148	GGA	2	6	25602	25607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016148	TTG	2	6	25638	25643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016148	GGT	2	6	26365	26370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016148	T	6	6	28260	28265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016148	ATG	2	6	28286	28291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016148	GTG	2	6	28292	28297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016148	GCGTCA	2	12	28314	28325	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_016148	TTA	2	6	30326	30331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016148	GTT	2	6	30353	30358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016148	GGT	2	6	30374	30379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016148	GA	3	6	30388	30393	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016148	ACAAAA	2	12	30418	30429	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_016148	AGG	2	6	30432	30437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016148	A	6	6	31510	31515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016148	AGC	2	6	31536	31541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_016148	GCT	2	6	31555	31560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_016148	T	7	7	31560	31566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016148	CTTC	2	8	33242	33249	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_016148	TCCC	2	8	36071	36078	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
82	NC_016148	TAC	2	6	36087	36092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_016148	TAC	2	6	36098	36103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_016148	A	6	6	36152	36157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016148	A	7	7	37611	37617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016148	T	6	6	41432	41437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016148	CCA	2	6	43994	43999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_016148	TGT	2	6	44018	44023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016148	TCC	2	6	44854	44859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_016148	GA	3	6	44957	44962	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016148	TGT	2	6	44996	45001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016148	T	6	6	45001	45006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016148	TTG	2	6	45012	45017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016148	TAA	2	6	45026	45031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016148	TATAA	2	10	45034	45043	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016148	GGT	2	6	47061	47066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016148	GAC	2	6	51174	51179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_016148	TAT	2	6	51196	51201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016148	TAA	2	6	51217	51222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016148	TTTA	2	8	51246	51253	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016148	AG	3	6	51270	51275	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016148	AGT	2	6	51818	51823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016148	AGG	2	6	51845	51850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016148	AGG	2	6	52247	52252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016148	GA	3	6	52431	52436	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016148	AATA	2	8	52437	52444	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016148	AAG	2	6	52456	52461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016148	ATT	2	6	52501	52506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016148	TTC	2	6	52591	52596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_016148	T	6	6	52615	52620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016148	CATG	2	8	52636	52643	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_016148	GAA	2	6	52708	52713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016148	AGG	2	6	52736	52741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016148	T	6	6	54090	54095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016148	GCC	2	6	54135	54140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_016148	CGG	2	6	54151	54156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_016148	GGA	2	6	54161	54166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016148	AGGA	2	8	55145	55152	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016148	GCTTT	2	10	55205	55214	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_016148	TA	3	6	55309	55314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016148	TAA	2	6	55377	55382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016148	CCT	2	6	57112	57117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_016148	TCA	2	6	58570	58575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_016148	TTTGT	2	10	61391	61400	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016148	AT	3	6	61426	61431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016148	CAGA	2	8	65938	65945	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_016148	ACCA	2	8	66457	66464	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_016148	TTTGT	2	10	66485	66494	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016148	ATA	2	6	66508	66513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016148	TA	4	8	66512	66519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016148	AT	3	6	66526	66531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016148	AGG	2	6	69704	69709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016148	AAAGG	2	10	69761	69770	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016148	ATAG	2	8	70939	70946	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016148	GGA	2	6	71155	71160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016148	GA	3	6	71221	71226	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016148	T	6	6	71231	71236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016148	T	7	7	71251	71257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016148	GGT	2	6	71280	71285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016148	CGA	2	6	73126	73131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_016148	GA	3	6	73133	73138	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016148	A	7	7	73230	73236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016148	GCC	2	6	73266	73271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_016148	AT	3	6	73319	73324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016148	AG	3	6	73329	73334	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016148	AT	3	6	75300	75305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016148	GTT	2	6	75831	75836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016148	TTTTG	2	10	75839	75848	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016148	GGC	2	6	75869	75874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_016148	AGG	3	9	75908	75916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
151	NC_016148	AGGA	2	8	80799	80806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_016148	TGT	2	6	81982	81987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_016148	TACT	2	8	82009	82016	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
154	NC_016148	TAA	2	6	82048	82053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_016148	TAAA	2	8	82068	82075	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_016148	GTG	2	6	88461	88466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_016148	T	6	6	90715	90720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_016148	TATT	2	8	98773	98780	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_016148	G	6	6	98803	98808	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
165	NC_016148	T	7	7	98812	98818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_016148	AGG	2	6	99608	99613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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173	NC_016148	CGG	2	6	99825	99830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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176	NC_016148	GAG	2	6	102174	102179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
177	NC_016148	GTG	2	6	102195	102200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_016148	CAG	2	6	108027	108032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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193	NC_016148	ACA	2	6	113189	113194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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281	NC_016148	ATG	2	6	167087	167092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_016148	TCA	2	6	167926	167931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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421	NC_016148	T	7	7	235812	235818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
422	NC_016148	GCG	2	6	235837	235842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
423	NC_016148	GA	3	6	235875	235880	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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428	NC_016148	CAT	2	6	236314	236319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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430	NC_016148	ATT	2	6	236385	236390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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432	NC_016148	AGA	2	6	236488	236493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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434	NC_016148	AT	3	6	236528	236533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
435	NC_016148	AAC	2	6	236566	236571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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452	NC_016148	TCT	2	6	237409	237414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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454	NC_016148	GTT	2	6	237546	237551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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458	NC_016148	TAT	2	6	237692	237697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
459	NC_016148	TCT	2	6	237712	237717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
460	NC_016148	AGTA	2	8	237728	237735	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
461	NC_016148	TAC	2	6	237764	237769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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476	NC_016148	T	6	6	243375	243380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_016148	ACC	2	6	243530	243535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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