MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Tetragenococcus halophilus NBRC 12172

Total Repeats: 9867

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_016052	CAC	2	6	2386462	2386467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9002	NC_016052	AATG	2	8	2387085	2387092	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9003	NC_016052	ATT	2	6	2387094	2387099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9004	NC_016052	TCAT	2	8	2387107	2387114	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9005	NC_016052	TTCT	2	8	2387124	2387131	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9006	NC_016052	T	7	7	2387175	2387181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9007	NC_016052	TTA	2	6	2387203	2387208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9008	NC_016052	AAAT	2	8	2387209	2387216	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9009	NC_016052	TAAG	2	8	2387279	2387286	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9010	NC_016052	TA	4	8	2388337	2388344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9011	NC_016052	AGTT	2	8	2389801	2389808	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9012	NC_016052	TAA	2	6	2389848	2389853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9013	NC_016052	GCT	2	6	2389870	2389875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9014	NC_016052	CAA	2	6	2389882	2389887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9015	NC_016052	TAT	2	6	2389895	2389900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9016	NC_016052	ACT	2	6	2389930	2389935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9017	NC_016052	CTT	2	6	2390009	2390014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9018	NC_016052	A	7	7	2390015	2390021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9019	NC_016052	T	6	6	2390040	2390045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9020	NC_016052	TG	3	6	2390049	2390054	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9021	NC_016052	GGCAT	2	10	2390058	2390067	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9022	NC_016052	CTAG	2	8	2390072	2390079	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9023	NC_016052	GAT	2	6	2390139	2390144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9024	NC_016052	GAAG	2	8	2390150	2390157	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9025	NC_016052	TGG	2	6	2390158	2390163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9026	NC_016052	TGA	2	6	2390195	2390200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9027	NC_016052	TGG	2	6	2390208	2390213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9028	NC_016052	GA	3	6	2390284	2390289	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9029	NC_016052	AAG	2	6	2390355	2390360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9030	NC_016052	TAG	2	6	2390374	2390379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9031	NC_016052	AGA	2	6	2390432	2390437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9032	NC_016052	AGT	2	6	2390503	2390508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9033	NC_016052	AGG	2	6	2390539	2390544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9034	NC_016052	CGTA	2	8	2391885	2391892	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9035	NC_016052	CTATT	2	10	2391934	2391943	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9036	NC_016052	TCT	2	6	2392812	2392817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9037	NC_016052	TAGA	2	8	2392827	2392834	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9038	NC_016052	A	7	7	2392903	2392909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9039	NC_016052	A	7	7	2392948	2392954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9040	NC_016052	AGA	2	6	2392983	2392988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9041	NC_016052	T	6	6	2393776	2393781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9042	NC_016052	ACCA	2	8	2393794	2393801	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9043	NC_016052	AG	3	6	2393822	2393827	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9044	NC_016052	TG	3	6	2393832	2393837	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9045	NC_016052	TTTTC	2	10	2393894	2393903	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9046	NC_016052	AATC	2	8	2393926	2393933	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9047	NC_016052	TCA	2	6	2393950	2393955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9048	NC_016052	TTCA	2	8	2393975	2393982	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9049	NC_016052	T	6	6	2393992	2393997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9050	NC_016052	TTC	2	6	2394046	2394051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9051	NC_016052	TCTT	2	8	2396008	2396015	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9052	NC_016052	TCAT	2	8	2396019	2396026	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9053	NC_016052	TCTT	2	8	2396041	2396048	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9054	NC_016052	CCTT	2	8	2396071	2396078	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9055	NC_016052	A	8	8	2396099	2396106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9056	NC_016052	ACAA	2	8	2396118	2396125	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9057	NC_016052	CCT	2	6	2396763	2396768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9058	NC_016052	ATTT	2	8	2396781	2396788	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9059	NC_016052	ATT	2	6	2396806	2396811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9060	NC_016052	T	7	7	2396810	2396816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9061	NC_016052	A	6	6	2396856	2396861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9062	NC_016052	A	6	6	2396883	2396888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9063	NC_016052	T	6	6	2396893	2396898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9064	NC_016052	T	6	6	2397970	2397975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9065	NC_016052	CTA	2	6	2397995	2398000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9066	NC_016052	TCT	2	6	2398016	2398021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9067	NC_016052	TAT	2	6	2398043	2398048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9068	NC_016052	TAA	2	6	2398130	2398135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9069	NC_016052	ATAA	2	8	2398139	2398146	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9070	NC_016052	CTT	2	6	2402297	2402302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9072	NC_016052	TCT	2	6	2402322	2402327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9073	NC_016052	TAT	2	6	2402336	2402341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9077	NC_016052	TAT	2	6	2403441	2403446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9084	NC_016052	A	6	6	2404458	2404463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9085	NC_016052	A	7	7	2404468	2404474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9086	NC_016052	A	7	7	2404506	2404512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9088	NC_016052	CAA	2	6	2404540	2404545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9089	NC_016052	T	7	7	2405724	2405730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9090	NC_016052	ATGA	2	8	2405731	2405738	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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9093	NC_016052	AT	3	6	2405830	2405835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9094	NC_016052	AAT	2	6	2405837	2405842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9095	NC_016052	GAT	2	6	2405845	2405850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9098	NC_016052	CAT	2	6	2405902	2405907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9099	NC_016052	ATTC	2	8	2405943	2405950	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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9101	NC_016052	CTTT	2	8	2409103	2409110	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9102	NC_016052	TCC	2	6	2409555	2409560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9103	NC_016052	T	6	6	2409568	2409573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9104	NC_016052	TAAAAC	2	12	2409593	2409604	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9105	NC_016052	ATC	2	6	2409622	2409627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9106	NC_016052	AAT	2	6	2409631	2409636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9107	NC_016052	ATT	3	9	2409655	2409663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9108	NC_016052	ACAA	2	8	2409665	2409672	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9109	NC_016052	TAG	2	6	2409692	2409697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9112	NC_016052	AGG	2	6	2410557	2410562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9113	NC_016052	TAAA	2	8	2412013	2412020	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9114	NC_016052	T	7	7	2412037	2412043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9115	NC_016052	ACAA	2	8	2412856	2412863	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9116	NC_016052	TAAAA	2	10	2412869	2412878	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9117	NC_016052	TA	3	6	2412901	2412906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9118	NC_016052	ATT	2	6	2412907	2412912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9123	NC_016052	AAC	2	6	2413143	2413148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9124	NC_016052	ATT	2	6	2413156	2413161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9125	NC_016052	TTA	2	6	2413208	2413213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9128	NC_016052	TTA	2	6	2413371	2413376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9129	NC_016052	TA	4	8	2413404	2413411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9130	NC_016052	A	7	7	2413422	2413428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9131	NC_016052	T	7	7	2413453	2413459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9132	NC_016052	A	9	9	2413473	2413481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9133	NC_016052	TG	3	6	2413484	2413489	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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9269	NC_016052	TCGC	2	8	2443181	2443188	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9270	NC_016052	CTC	2	6	2443204	2443209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9271	NC_016052	GAC	2	6	2443210	2443215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9272	NC_016052	CTT	2	6	2443245	2443250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9273	NC_016052	TCCC	2	8	2443301	2443308	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
9274	NC_016052	CTTT	2	8	2443390	2443397	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9275	NC_016052	CCT	2	6	2443400	2443405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9276	NC_016052	ATG	2	6	2443756	2443761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9277	NC_016052	GCT	2	6	2443762	2443767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9278	NC_016052	CCT	2	6	2443803	2443808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9279	NC_016052	ACAT	2	8	2443819	2443826	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9280	NC_016052	TGG	2	6	2443841	2443846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9281	NC_016052	CGA	2	6	2443865	2443870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9282	NC_016052	TCAC	2	8	2443880	2443887	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9283	NC_016052	CAAT	2	8	2443906	2443913	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9284	NC_016052	CAT	2	6	2443981	2443986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9286	NC_016052	ACGT	2	8	2444090	2444097	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9287	NC_016052	TCC	2	6	2444106	2444111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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9289	NC_016052	TCC	2	6	2444424	2444429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9290	NC_016052	CGT	2	6	2444457	2444462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9291	NC_016052	CGG	2	6	2444519	2444524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9292	NC_016052	TCGC	2	8	2444617	2444624	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9293	NC_016052	TTTTTC	2	12	2444643	2444654	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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9297	NC_016052	CTTA	2	8	2444864	2444871	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9298	NC_016052	TGCT	2	8	2444909	2444916	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9299	NC_016052	A	6	6	2444959	2444964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9300	NC_016052	TTG	2	6	2444997	2445002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9301	NC_016052	CAAA	2	8	2445028	2445035	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9302	NC_016052	ATCG	2	8	2445045	2445052	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9303	NC_016052	CCT	2	6	2445084	2445089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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9307	NC_016052	GT	3	6	2445343	2445348	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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9310	NC_016052	GT	3	6	2445513	2445518	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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9321	NC_016052	CTC	2	6	2446074	2446079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9322	NC_016052	GCT	2	6	2446218	2446223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9329	NC_016052	A	6	6	2446662	2446667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9330	NC_016052	TCT	2	6	2446676	2446681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9337	NC_016052	AAG	2	6	2446850	2446855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9344	NC_016052	A	6	6	2447040	2447045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9347	NC_016052	TAA	2	6	2447146	2447151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9348	NC_016052	T	6	6	2447230	2447235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9351	NC_016052	T	6	6	2447284	2447289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9352	NC_016052	TCC	2	6	2448791	2448796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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9354	NC_016052	T	6	6	2448872	2448877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9361	NC_016052	TTCAA	2	10	2454103	2454112	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9362	NC_016052	A	6	6	2454111	2454116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9363	NC_016052	A	7	7	2454123	2454129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9366	NC_016052	TCC	2	6	2454642	2454647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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9383	NC_016052	TCATC	2	10	2462654	2462663	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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9389	NC_016052	TAA	2	6	2462817	2462822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9391	NC_016052	A	7	7	2464314	2464320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9392	NC_016052	A	6	6	2464328	2464333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9393	NC_016052	CT	3	6	2464335	2464340	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9394	NC_016052	TCC	2	6	2465075	2465080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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9396	NC_016052	TA	3	6	2465126	2465131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9397	NC_016052	A	6	6	2465705	2465710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9398	NC_016052	T	7	7	2465712	2465718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9399	NC_016052	T	7	7	2465724	2465730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9400	NC_016052	A	6	6	2465748	2465753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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