MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Tetragenococcus halophilus NBRC 12172

Total Repeats: 9867

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_016052	T	6	6	2195864	2195869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_016052	ATA	2	6	2195870	2195875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_016052	TTCT	2	8	2195888	2195895	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8004	NC_016052	GAA	2	6	2195898	2195903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_016052	TGG	2	6	2196028	2196033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_016052	CTT	2	6	2196036	2196041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8007	NC_016052	T	7	7	2196060	2196066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_016052	AAAG	2	8	2196100	2196107	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_016052	A	6	6	2196134	2196139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_016052	TTTC	2	8	2196244	2196251	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8011	NC_016052	TCC	2	6	2197108	2197113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8012	NC_016052	TCCTC	2	10	2198852	2198861	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
8013	NC_016052	TGA	2	6	2198868	2198873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_016052	A	7	7	2198892	2198898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_016052	CTT	2	6	2198915	2198920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8016	NC_016052	ACC	2	6	2198953	2198958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8017	NC_016052	CTT	2	6	2198980	2198985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8018	NC_016052	TCC	2	6	2200334	2200339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8019	NC_016052	TTA	2	6	2200350	2200355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_016052	TCTA	2	8	2200378	2200385	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8021	NC_016052	TGA	2	6	2200434	2200439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_016052	A	6	6	2200439	2200444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_016052	TA	3	6	2200466	2200471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_016052	ATA	2	6	2200499	2200504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_016052	T	6	6	2200872	2200877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_016052	ATC	2	6	2201023	2201028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8027	NC_016052	GTAA	2	8	2201037	2201044	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_016052	TTG	2	6	2201100	2201105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_016052	GCT	2	6	2201144	2201149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8030	NC_016052	AT	3	6	2201177	2201182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_016052	A	7	7	2201188	2201194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_016052	A	6	6	2203560	2203565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_016052	AGT	2	6	2203586	2203591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_016052	T	6	6	2203617	2203622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_016052	AAT	2	6	2203630	2203635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_016052	A	8	8	2203645	2203652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_016052	TCT	2	6	2203655	2203660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8038	NC_016052	TTG	2	6	2203678	2203683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_016052	GTT	2	6	2203694	2203699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_016052	AAG	2	6	2203715	2203720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_016052	TGG	2	6	2205115	2205120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_016052	T	7	7	2205125	2205131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_016052	A	7	7	2205134	2205140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_016052	GTT	2	6	2205192	2205197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_016052	TTA	2	6	2205261	2205266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_016052	A	6	6	2205266	2205271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_016052	ATC	2	6	2205285	2205290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8048	NC_016052	TTTAT	2	10	2206154	2206163	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_016052	CCT	2	6	2207182	2207187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8050	NC_016052	TTCA	2	8	2207188	2207195	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8051	NC_016052	TTA	2	6	2207830	2207835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_016052	ACC	2	6	2207861	2207866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8053	NC_016052	GGT	2	6	2207877	2207882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_016052	AAC	2	6	2208493	2208498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8055	NC_016052	T	7	7	2208523	2208529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_016052	TTTCC	2	10	2208540	2208549	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
8057	NC_016052	T	6	6	2208567	2208572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_016052	TAA	2	6	2208612	2208617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_016052	A	7	7	2208616	2208622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8061	NC_016052	T	6	6	2209154	2209159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_016052	A	7	7	2209165	2209171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_016052	CCTTTA	2	12	2209191	2209202	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8064	NC_016052	AAG	2	6	2209260	2209265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8066	NC_016052	CAT	2	6	2209310	2209315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8068	NC_016052	AAC	2	6	2209371	2209376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8069	NC_016052	TCGA	2	8	2209418	2209425	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8070	NC_016052	TCT	2	6	2209483	2209488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8071	NC_016052	CTTT	2	8	2209502	2209509	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8072	NC_016052	CCA	2	6	2209617	2209622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8073	NC_016052	ACG	2	6	2209710	2209715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8076	NC_016052	GTT	2	6	2209944	2209949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8080	NC_016052	CCTA	2	8	2210181	2210188	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8081	NC_016052	TC	3	6	2210301	2210306	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8082	NC_016052	GCC	2	6	2210398	2210403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8083	NC_016052	CTC	2	6	2210446	2210451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8084	NC_016052	GCT	2	6	2210555	2210560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8085	NC_016052	AGC	2	6	2210567	2210572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8086	NC_016052	TCGC	2	8	2210625	2210632	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8087	NC_016052	CTC	2	6	2210648	2210653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8088	NC_016052	GAC	2	6	2210654	2210659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8089	NC_016052	CTT	2	6	2210689	2210694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8090	NC_016052	TCCC	2	8	2210745	2210752	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8091	NC_016052	CTTT	2	8	2210834	2210841	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8092	NC_016052	CCT	2	6	2210844	2210849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8093	NC_016052	TCT	2	6	2211056	2211061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8094	NC_016052	ATG	2	6	2211200	2211205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8097	NC_016052	ACAT	2	8	2211263	2211270	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8098	NC_016052	TGG	2	6	2211285	2211290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_016052	CGA	2	6	2211309	2211314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8100	NC_016052	TCAC	2	8	2211324	2211331	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8101	NC_016052	TCAA	2	8	2211349	2211356	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8102	NC_016052	CAT	2	6	2211425	2211430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8103	NC_016052	GA	3	6	2211464	2211469	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_016052	ACGT	2	8	2211534	2211541	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8105	NC_016052	TCC	2	6	2211550	2211555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8106	NC_016052	GCCA	2	8	2211682	2211689	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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8108	NC_016052	CGT	2	6	2211901	2211906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8109	NC_016052	CGG	2	6	2211963	2211968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8110	NC_016052	TCGC	2	8	2212061	2212068	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8111	NC_016052	TTTTTC	2	12	2212087	2212098	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8112	NC_016052	CTA	2	6	2212108	2212113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8113	NC_016052	CTTA	2	8	2212223	2212230	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8114	NC_016052	CCG	2	6	2212292	2212297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8115	NC_016052	CTTA	2	8	2212308	2212315	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8116	NC_016052	A	6	6	2212403	2212408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_016052	TTG	2	6	2212441	2212446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8119	NC_016052	GGC	2	6	2212622	2212627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8120	NC_016052	GTG	2	6	2212676	2212681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_016052	GT	3	6	2212691	2212696	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_016052	GA	3	6	2212792	2212797	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_016052	GGCTT	2	10	2212825	2212834	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8124	NC_016052	GT	3	6	2212861	2212866	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8125	NC_016052	ATG	2	6	2212886	2212891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_016052	TCC	2	6	2212912	2212917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8127	NC_016052	CACGA	2	10	2213011	2213020	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
8128	NC_016052	GAC	2	6	2213024	2213029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8129	NC_016052	CAC	2	6	2213037	2213042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8130	NC_016052	TTC	2	6	2213112	2213117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8131	NC_016052	GCA	2	6	2213231	2213236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8132	NC_016052	AG	3	6	2213351	2213356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8133	NC_016052	TCC	2	6	2213376	2213381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8134	NC_016052	AT	3	6	2213382	2213387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8135	NC_016052	CTC	2	6	2213422	2213427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8136	NC_016052	GCT	2	6	2213566	2213571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8138	NC_016052	CTT	2	6	2213675	2213680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8139	NC_016052	CTG	2	6	2213734	2213739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8141	NC_016052	A	7	7	2213908	2213914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8142	NC_016052	A	6	6	2214010	2214015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8149	NC_016052	AAG	2	6	2214197	2214202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8150	NC_016052	TGCT	2	8	2214224	2214231	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8151	NC_016052	TTG	2	6	2214258	2214263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8152	NC_016052	TAT	2	6	2214279	2214284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8153	NC_016052	ATC	2	6	2214285	2214290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8154	NC_016052	TTA	2	6	2214366	2214371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8164	NC_016052	T	6	6	2214569	2214574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8165	NC_016052	CTT	2	6	2216622	2216627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8175	NC_016052	TAT	2	6	2220596	2220601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8176	NC_016052	A	8	8	2220609	2220616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8177	NC_016052	ATTT	2	8	2220631	2220638	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8251	NC_016052	A	6	6	2238896	2238901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8257	NC_016052	AACC	2	8	2241853	2241860	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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8262	NC_016052	A	6	6	2248315	2248320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8263	NC_016052	A	6	6	2248353	2248358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8264	NC_016052	TAA	2	6	2248374	2248379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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