MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 4018

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_016051	A	6	6	1798709	1798714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_016051	AAACA	2	10	1812118	1812127	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3503	NC_016051	ATC	2	6	1813728	1813733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_016051	ACGT	2	8	1813746	1813753	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3505	NC_016051	TCT	2	6	1813758	1813763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_016051	CCG	2	6	1813807	1813812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3507	NC_016051	T	7	7	1813848	1813854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_016051	TTTCT	2	10	1813856	1813865	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3509	NC_016051	GTT	2	6	1813976	1813981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_016051	ATT	2	6	1814033	1814038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_016051	GTT	2	6	1815979	1815984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_016051	TAAT	2	8	1816025	1816032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_016051	ATT	2	6	1816039	1816044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_016051	ACC	3	9	1816059	1816067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3515	NC_016051	CAAA	2	8	1816098	1816105	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3516	NC_016051	TA	3	6	1816158	1816163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_016051	CTG	2	6	1818338	1818343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3518	NC_016051	CCT	2	6	1818369	1818374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3519	NC_016051	TTC	2	6	1818407	1818412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_016051	TAG	2	6	1818422	1818427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_016051	TCA	2	6	1818473	1818478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_016051	TAA	2	6	1818510	1818515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_016051	TC	3	6	1818517	1818522	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3524	NC_016051	TAA	2	6	1818547	1818552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_016051	ATT	2	6	1818641	1818646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_016051	AATA	2	8	1818818	1818825	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_016051	CA	3	6	1819078	1819083	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3528	NC_016051	AGG	2	6	1819091	1819096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_016051	CA	3	6	1819119	1819124	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3530	NC_016051	AAG	2	6	1819235	1819240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_016051	TAA	2	6	1819348	1819353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_016051	GTT	2	6	1819392	1819397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_016051	CTG	2	6	1819399	1819404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_016051	TGG	2	6	1819412	1819417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_016051	ATA	2	6	1819426	1819431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_016051	TGC	2	6	1819436	1819441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_016051	ATTAG	2	10	1819492	1819501	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_016051	ATA	2	6	1819510	1819515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_016051	TTA	2	6	1820592	1820597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_016051	TCCT	2	8	1822655	1822662	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3541	NC_016051	CTC	2	6	1822671	1822676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3542	NC_016051	AGG	2	6	1822687	1822692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_016051	CTC	2	6	1822727	1822732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3544	NC_016051	GTA	2	6	1822744	1822749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_016051	T	6	6	1822780	1822785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_016051	AT	3	6	1822901	1822906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_016051	TGC	2	6	1822951	1822956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_016051	CTT	2	6	1822963	1822968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_016051	CAA	2	6	1823040	1823045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_016051	TCA	2	6	1823072	1823077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_016051	CCT	2	6	1824703	1824708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3552	NC_016051	TCA	2	6	1824796	1824801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_016051	TTA	2	6	1826501	1826506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_016051	T	6	6	1826529	1826534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_016051	CT	3	6	1826568	1826573	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3556	NC_016051	AAG	2	6	1826659	1826664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_016051	GAG	2	6	1826698	1826703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_016051	CCT	2	6	1826711	1826716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3559	NC_016051	GAT	2	6	1826725	1826730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_016051	GGT	2	6	1826749	1826754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_016051	AAC	2	6	1829521	1829526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_016051	AGG	2	6	1829605	1829610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_016051	TTA	2	6	1829648	1829653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_016051	TGA	2	6	1831203	1831208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_016051	TCA	2	6	1831280	1831285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_016051	CTT	2	6	1831305	1831310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_016051	CAAG	2	8	1831326	1831333	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3568	NC_016051	GTTT	2	8	1831425	1831432	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_016051	TAA	2	6	1831433	1831438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_016051	TGA	2	6	1831567	1831572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_016051	TGT	2	6	1831622	1831627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_016051	GGCG	2	8	1831671	1831678	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3573	NC_016051	CCGG	2	8	1831722	1831729	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3574	NC_016051	ACC	2	6	1831782	1831787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3575	NC_016051	GAGG	2	8	1831811	1831818	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_016051	AT	4	8	1835333	1835340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_016051	T	6	6	1836229	1836234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3579	NC_016051	AAT	2	6	1838549	1838554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_016051	TGG	2	6	1838588	1838593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3582	NC_016051	A	6	6	1838639	1838644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_016051	AGGT	2	8	1838648	1838655	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_016051	AGT	2	6	1838658	1838663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_016051	AGT	2	6	1838726	1838731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_016051	CAG	2	6	1838734	1838739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3587	NC_016051	TGC	2	6	1838768	1838773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3588	NC_016051	ATTAC	2	10	1838776	1838785	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3589	NC_016051	GGT	2	6	1838938	1838943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_016051	CCAA	2	8	1838952	1838959	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3591	NC_016051	TCC	2	6	1839017	1839022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3592	NC_016051	AG	3	6	1839031	1839036	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_016051	TAC	2	6	1839051	1839056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_016051	AT	3	6	1839089	1839094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_016051	ACT	2	6	1839253	1839258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_016051	AAT	2	6	1839281	1839286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_016051	CGT	2	6	1839434	1839439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_016051	GAA	2	6	1839615	1839620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_016051	GTG	2	6	1839634	1839639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_016051	CTTT	2	8	1847478	1847485	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3601	NC_016051	GTTT	2	8	1847490	1847497	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_016051	TGG	2	6	1847511	1847516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_016051	ATC	2	6	1849622	1849627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_016051	GAG	2	6	1849661	1849666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_016051	TCC	2	6	1849856	1849861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3606	NC_016051	T	6	6	1849889	1849894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3609	NC_016051	TTAT	2	8	1851155	1851162	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_016051	GGT	2	6	1852129	1852134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_016051	CCA	2	6	1852886	1852891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3612	NC_016051	TTA	2	6	1852913	1852918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_016051	CTG	2	6	1856084	1856089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_016051	AACT	2	8	1856091	1856098	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3615	NC_016051	AT	3	6	1856112	1856117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_016051	T	6	6	1856646	1856651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_016051	CA	3	6	1856711	1856716	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3618	NC_016051	GGGGA	2	10	1856743	1856752	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_016051	ACC	3	9	1857320	1857328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3620	NC_016051	GGAG	2	8	1857339	1857346	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_016051	TCA	2	6	1858556	1858561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3622	NC_016051	T	6	6	1858571	1858576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_016051	T	6	6	1858608	1858613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_016051	GTT	2	6	1858624	1858629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_016051	GTA	2	6	1858653	1858658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_016051	GTG	2	6	1859235	1859240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_016051	A	6	6	1859261	1859266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_016051	GGA	2	6	1859300	1859305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_016051	GAA	2	6	1859331	1859336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_016051	GAG	2	6	1864878	1864883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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