MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 4018

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016051	CT	3	6	1674486	1674491	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3002	NC_016051	CTGG	2	8	1674524	1674531	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3003	NC_016051	AG	3	6	1674554	1674559	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_016051	CTTT	2	8	1677120	1677127	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3005	NC_016051	GGT	2	6	1677142	1677147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_016051	GAA	2	6	1683755	1683760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_016051	AAC	2	6	1686626	1686631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_016051	ACC	2	6	1686911	1686916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3009	NC_016051	CCA	2	6	1686933	1686938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3010	NC_016051	TGA	2	6	1687156	1687161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_016051	TA	3	6	1687167	1687172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_016051	TTC	2	6	1687212	1687217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_016051	AAG	2	6	1687235	1687240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_016051	GGC	2	6	1687405	1687410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_016051	CAGTC	2	10	1687411	1687420	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3016	NC_016051	AG	3	6	1687460	1687465	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_016051	AACG	2	8	1687472	1687479	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3018	NC_016051	ACC	2	6	1687497	1687502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3019	NC_016051	AGAA	2	8	1687530	1687537	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_016051	CTT	2	6	1687558	1687563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_016051	AGA	2	6	1687823	1687828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_016051	CCG	2	6	1687874	1687879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3023	NC_016051	GAT	2	6	1688030	1688035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_016051	AGA	2	6	1688049	1688054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_016051	AAC	2	6	1688115	1688120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_016051	AAT	2	6	1688121	1688126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_016051	GAAA	2	8	1688202	1688209	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_016051	ATA	2	6	1688211	1688216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_016051	CTT	2	6	1688277	1688282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_016051	TTA	2	6	1688297	1688302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_016051	GAG	2	6	1688352	1688357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_016051	TAT	2	6	1688409	1688414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_016051	CAGTG	2	10	1688451	1688460	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3034	NC_016051	TCC	2	6	1688466	1688471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3035	NC_016051	A	7	7	1688551	1688557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_016051	CAT	2	6	1688562	1688567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_016051	TCA	2	6	1688612	1688617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_016051	CAG	2	6	1688885	1688890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_016051	TAGCA	2	10	1689011	1689020	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3040	NC_016051	AGG	2	6	1689093	1689098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_016051	ACA	3	9	1689117	1689125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_016051	AG	3	6	1689243	1689248	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_016051	AAAAAC	2	12	1689259	1689270	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3044	NC_016051	GAA	2	6	1689322	1689327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_016051	GTG	2	6	1689348	1689353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_016051	TTC	2	6	1689365	1689370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_016051	AAC	2	6	1689526	1689531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_016051	GA	3	6	1689614	1689619	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_016051	AGA	2	6	1689661	1689666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_016051	CAT	2	6	1689694	1689699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_016051	TC	3	6	1689735	1689740	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3052	NC_016051	GTA	2	6	1689828	1689833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_016051	GTT	2	6	1689939	1689944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_016051	CTT	2	6	1689950	1689955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_016051	CTT	2	6	1689964	1689969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_016051	ACT	2	6	1690079	1690084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_016051	GAGAG	2	10	1690088	1690097	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_016051	ATG	2	6	1690106	1690111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_016051	ATA	2	6	1690235	1690240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_016051	GGA	2	6	1690243	1690248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_016051	A	6	6	1690261	1690266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_016051	AGC	2	6	1690310	1690315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_016051	TC	3	6	1690349	1690354	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3064	NC_016051	AAC	2	6	1690367	1690372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_016051	ACC	2	6	1690416	1690421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3066	NC_016051	AATG	2	8	1690437	1690444	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_016051	TAT	2	6	1690455	1690460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_016051	AGG	2	6	1690652	1690657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_016051	A	6	6	1690691	1690696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_016051	CAC	2	6	1690732	1690737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3071	NC_016051	GAA	2	6	1690740	1690745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_016051	ACT	2	6	1690753	1690758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3073	NC_016051	GAA	2	6	1690805	1690810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_016051	A	6	6	1690817	1690822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_016051	TCA	2	6	1690856	1690861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_016051	CCAG	2	8	1690870	1690877	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3077	NC_016051	CCAG	2	8	1691151	1691158	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3078	NC_016051	TAAA	2	8	1691171	1691178	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_016051	TGTA	2	8	1691269	1691276	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_016051	GAA	2	6	1691291	1691296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_016051	GAG	2	6	1691368	1691373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_016051	CACC	2	8	1691489	1691496	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3083	NC_016051	CAACT	2	10	1691530	1691539	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3084	NC_016051	AG	3	6	1691547	1691552	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_016051	AGT	2	6	1691562	1691567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_016051	AT	3	6	1691590	1691595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_016051	CCA	2	6	1691613	1691618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3088	NC_016051	AGCA	2	8	1691629	1691636	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3089	NC_016051	TAG	2	6	1691660	1691665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_016051	AGA	2	6	1691711	1691716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_016051	GAT	2	6	1691758	1691763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_016051	CCA	2	6	1691790	1691795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3093	NC_016051	TGT	2	6	1691853	1691858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_016051	A	6	6	1691869	1691874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_016051	TTGA	2	8	1691936	1691943	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_016051	A	6	6	1691954	1691959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_016051	AT	3	6	1692169	1692174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_016051	GTA	2	6	1692438	1692443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_016051	TCT	2	6	1692495	1692500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_016051	ATC	2	6	1692514	1692519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_016051	CAC	2	6	1692522	1692527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3102	NC_016051	AG	3	6	1692538	1692543	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_016051	AATG	2	8	1692581	1692588	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_016051	AGGA	2	8	1692605	1692612	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_016051	TCA	2	6	1692666	1692671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_016051	CTA	2	6	1692768	1692773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_016051	TTC	2	6	1692890	1692895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_016051	TTCC	2	8	1693006	1693013	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3109	NC_016051	AAT	2	6	1693022	1693027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_016051	TCC	2	6	1693076	1693081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3111	NC_016051	CTG	3	9	1693454	1693462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_016051	TCC	2	6	1693513	1693518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3113	NC_016051	ATAA	2	8	1693610	1693617	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_016051	CA	3	6	1693668	1693673	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3115	NC_016051	C	6	6	1693678	1693683	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3116	NC_016051	ACG	2	6	1693684	1693689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_016051	GTT	2	6	1693692	1693697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_016051	AT	3	6	1693826	1693831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_016051	TAA	2	6	1693901	1693906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_016051	GTC	2	6	1694064	1694069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_016051	T	6	6	1694161	1694166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_016051	TTAGTG	2	12	1694186	1694197	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_016051	AGT	2	6	1694205	1694210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_016051	CA	3	6	1694229	1694234	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3125	NC_016051	TTC	2	6	1694328	1694333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_016051	CCGTTG	2	12	1694335	1694346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3127	NC_016051	CCGT	2	8	1694353	1694360	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3128	NC_016051	AGTAT	2	10	1694395	1694404	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_016051	CTT	2	6	1694498	1694503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3130	NC_016051	GAC	2	6	1694531	1694536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3132	NC_016051	GTT	2	6	1694661	1694666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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