MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 4018

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016051	TAA	2	6	868927	868932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_016051	TCACC	2	10	871581	871590	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1503	NC_016051	TACG	2	8	871631	871638	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1504	NC_016051	GTG	2	6	871639	871644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_016051	TTC	2	6	874536	874541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_016051	AGC	2	6	874584	874589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_016051	TAC	2	6	875571	875576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_016051	AGC	2	6	875614	875619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_016051	ATT	2	6	877407	877412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_016051	GTG	2	6	877457	877462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_016051	TCC	2	6	877497	877502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1512	NC_016051	CTG	2	6	877531	877536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_016051	GCTCT	2	10	878524	878533	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1514	NC_016051	ACTTT	2	10	878596	878605	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1515	NC_016051	T	6	6	878603	878608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_016051	GTT	2	6	883456	883461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_016051	TTG	2	6	884173	884178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_016051	CT	3	6	885853	885858	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1519	NC_016051	AC	3	6	885875	885880	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1520	NC_016051	GA	3	6	885954	885959	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_016051	TAT	2	6	887439	887444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_016051	AAGT	2	8	887486	887493	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_016051	TTG	2	6	887560	887565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_016051	TTA	2	6	888094	888099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_016051	GGA	2	6	888107	888112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_016051	CTT	2	6	888167	888172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_016051	TCA	2	6	888190	888195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_016051	TGA	2	6	888203	888208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_016051	GGT	2	6	893409	893414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_016051	CGGGC	2	10	896570	896579	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1531	NC_016051	TCCA	2	8	896620	896627	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1532	NC_016051	ACC	2	6	899441	899446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1533	NC_016051	ACC	2	6	900626	900631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1534	NC_016051	AAAGGG	2	12	900669	900680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_016051	GAG	2	6	901292	901297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_016051	CCA	2	6	901317	901322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1537	NC_016051	TCA	2	6	901349	901354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_016051	AT	4	8	903192	903199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_016051	ATCGGC	2	12	903204	903215	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_016051	TCA	2	6	903233	903238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_016051	CA	3	6	903256	903261	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1542	NC_016051	TCC	2	6	903727	903732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1543	NC_016051	GTT	2	6	903737	903742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_016051	TA	3	6	903833	903838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_016051	TCT	2	6	905180	905185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_016051	CCTC	2	8	909718	909725	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1547	NC_016051	GAA	2	6	909787	909792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_016051	TCC	2	6	909897	909902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1549	NC_016051	TTTCC	2	10	909914	909923	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1550	NC_016051	GAA	2	6	909946	909951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_016051	GGA	2	6	912896	912901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_016051	TC	3	6	913188	913193	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1553	NC_016051	A	7	7	913249	913255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_016051	GAA	2	6	913280	913285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_016051	TCC	2	6	913823	913828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1556	NC_016051	CAC	2	6	917116	917121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1557	NC_016051	ACGG	2	8	918970	918977	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1558	NC_016051	CCA	2	6	923651	923656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1559	NC_016051	GTT	2	6	923666	923671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_016051	GGA	2	6	925212	925217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_016051	CGG	2	6	925220	925225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_016051	CTT	2	6	925229	925234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_016051	CCT	2	6	925264	925269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1564	NC_016051	AAG	2	6	925277	925282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_016051	TCC	2	6	925315	925320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1566	NC_016051	GAT	2	6	925382	925387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_016051	GTC	2	6	925565	925570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_016051	GGT	3	9	925609	925617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_016051	GAA	2	6	925676	925681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_016051	GTCC	2	8	925697	925704	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1571	NC_016051	CGT	2	6	925831	925836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_016051	TGG	2	6	925878	925883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_016051	GCC	2	6	925885	925890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1574	NC_016051	GA	3	6	928785	928790	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_016051	CAC	2	6	931012	931017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1576	NC_016051	A	6	6	931030	931035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_016051	GTG	2	6	932812	932817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_016051	GGC	2	6	933140	933145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_016051	AGAA	2	8	933259	933266	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_016051	A	6	6	933287	933292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_016051	GTG	2	6	934638	934643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_016051	GAA	2	6	934688	934693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_016051	AGAAA	2	10	934694	934703	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_016051	GAAG	2	8	934730	934737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_016051	AGA	2	6	934739	934744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_016051	CTG	2	6	934759	934764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_016051	AT	3	6	934788	934793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_016051	AT	5	10	934894	934903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_016051	A	6	6	934930	934935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_016051	CTT	2	6	934975	934980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_016051	CAC	2	6	935008	935013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1592	NC_016051	TAG	2	6	936082	936087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_016051	CTA	2	6	936098	936103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_016051	ACC	2	6	937758	937763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1595	NC_016051	CCG	2	6	937804	937809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1596	NC_016051	GATC	2	8	937842	937849	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1597	NC_016051	CGG	2	6	937855	937860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_016051	ACC	2	6	939904	939909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1599	NC_016051	CTT	2	6	939939	939944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_016051	ATA	2	6	940806	940811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_016051	AC	3	6	941377	941382	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1602	NC_016051	TGG	2	6	941432	941437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_016051	TTA	2	6	941511	941516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_016051	TA	3	6	941551	941556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_016051	ACA	2	6	941584	941589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_016051	CCT	2	6	942381	942386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1607	NC_016051	G	6	6	942403	942408	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_016051	ACC	2	6	943798	943803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1609	NC_016051	CCT	2	6	944684	944689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1610	NC_016051	TCA	2	6	944708	944713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_016051	GCGG	2	8	944720	944727	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1612	NC_016051	TTCG	2	8	944795	944802	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1613	NC_016051	GAGAA	2	10	946156	946165	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_016051	GA	3	6	946167	946172	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_016051	ACC	3	9	946975	946983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1616	NC_016051	T	6	6	947024	947029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_016051	A	6	6	947177	947182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_016051	GAAAA	2	10	947206	947215	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_016051	GAA	2	6	952945	952950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_016051	CCT	2	6	953196	953201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1621	NC_016051	ACC	2	6	954222	954227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1622	NC_016051	T	6	6	954453	954458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_016051	A	6	6	954480	954485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_016051	CTCC	2	8	956707	956714	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1625	NC_016051	AT	3	6	957656	957661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_016051	GTGG	2	8	957718	957725	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_016051	GGA	2	6	957761	957766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_016051	GTT	2	6	958468	958473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_016051	TCA	2	6	958512	958517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_016051	ATC	2	6	958520	958525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_016051	GGT	2	6	958540	958545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_016051	CTT	2	6	960966	960971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_016051	GGT	2	6	960988	960993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_016051	T	6	6	961716	961721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_016051	ATC	2	6	962367	962372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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