MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 4018

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016051	CCCTT	2	10	566202	566211	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
1002	NC_016051	CCG	2	6	566240	566245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_016051	TGA	2	6	566270	566275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_016051	CCA	2	6	567292	567297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1005	NC_016051	GGT	2	6	568137	568142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_016051	AAAG	2	8	568168	568175	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_016051	CT	3	6	569630	569635	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1008	NC_016051	GACG	2	8	569655	569662	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1009	NC_016051	A	6	6	569665	569670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_016051	GGAAC	2	10	569681	569690	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1011	NC_016051	GGAG	2	8	569705	569712	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_016051	GAC	2	6	570244	570249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_016051	CCCT	2	8	570255	570262	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1014	NC_016051	TGA	2	6	570269	570274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_016051	GTG	2	6	570329	570334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_016051	CGG	2	6	572274	572279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_016051	TGGG	2	8	572993	573000	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_016051	TAA	2	6	574618	574623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_016051	TAA	2	6	574637	574642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_016051	TGA	2	6	574656	574661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_016051	GA	3	6	576528	576533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_016051	GCGTCG	2	12	576537	576548	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_016051	GAC	2	6	577111	577116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_016051	GAT	2	6	577838	577843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_016051	TGA	2	6	577868	577873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_016051	GCCG	2	8	577901	577908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1027	NC_016051	GAT	2	6	577939	577944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_016051	CGTT	2	8	578017	578024	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1029	NC_016051	GTG	2	6	580166	580171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_016051	T	6	6	581199	581204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_016051	GGA	2	6	584313	584318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_016051	ACC	2	6	587014	587019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1033	NC_016051	TGT	2	6	587026	587031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_016051	AAAC	2	8	588212	588219	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1035	NC_016051	GTT	2	6	588294	588299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_016051	CAT	2	6	588373	588378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_016051	GAG	2	6	588393	588398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_016051	TCT	2	6	588551	588556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_016051	TGA	2	6	588560	588565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_016051	T	6	6	589398	589403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_016051	GCG	2	6	589426	589431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_016051	GTT	2	6	589432	589437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_016051	GAA	2	6	590940	590945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_016051	TA	3	6	591031	591036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_016051	TGA	2	6	594657	594662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_016051	GATG	2	8	594677	594684	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_016051	AC	3	6	594698	594703	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1048	NC_016051	AG	3	6	596156	596161	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_016051	TCCT	2	8	596188	596195	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1050	NC_016051	GGA	2	6	596212	596217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_016051	GAG	2	6	596246	596251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_016051	TC	3	6	597015	597020	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_016051	GTAC	2	8	597055	597062	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1054	NC_016051	TCA	2	6	597590	597595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_016051	GAA	2	6	597603	597608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_016051	TCC	2	6	597620	597625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1057	NC_016051	GGA	2	6	597918	597923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_016051	AAGA	2	8	601480	601487	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_016051	CGGGG	2	10	601539	601548	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1060	NC_016051	GGA	2	6	601670	601675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_016051	CGG	2	6	602461	602466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_016051	CGG	2	6	602551	602556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_016051	ACC	2	6	604963	604968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1064	NC_016051	GAA	2	6	604970	604975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_016051	CGT	2	6	607388	607393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_016051	TCTCC	2	10	607469	607478	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
1067	NC_016051	GAG	2	6	607479	607484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_016051	CTTC	2	8	607554	607561	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1069	NC_016051	CA	3	6	607580	607585	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1070	NC_016051	CTTAAA	2	12	608132	608143	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1071	NC_016051	CAC	2	6	610364	610369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_016051	CAC	3	9	612576	612584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1073	NC_016051	TCTT	2	8	612617	612624	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1074	NC_016051	T	6	6	612657	612662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_016051	G	6	6	612688	612693	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_016051	T	6	6	616593	616598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_016051	TTTC	2	8	616603	616610	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1078	NC_016051	T	6	6	617870	617875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_016051	CGT	2	6	617911	617916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_016051	CTT	2	6	619234	619239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_016051	CTT	2	6	619244	619249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_016051	TCT	2	6	619286	619291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_016051	TGG	2	6	619328	619333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_016051	CCA	2	6	621050	621055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1085	NC_016051	TTG	2	6	621873	621878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_016051	A	6	6	621898	621903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_016051	A	6	6	622497	622502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_016051	ATA	2	6	622798	622803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_016051	ACCA	2	8	623323	623330	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1090	NC_016051	CGA	2	6	623418	623423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_016051	G	6	6	623455	623460	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_016051	C	6	6	623475	623480	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1093	NC_016051	CGC	2	6	625483	625488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1094	NC_016051	AGGGA	2	10	630835	630844	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_016051	C	6	6	633299	633304	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1096	NC_016051	ACC	2	6	634228	634233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1097	NC_016051	TGG	2	6	634302	634307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_016051	CAC	2	6	635837	635842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1099	NC_016051	ATA	2	6	637393	637398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_016051	TC	3	6	640093	640098	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1101	NC_016051	CCTC	2	8	640182	640189	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1102	NC_016051	CTC	2	6	640199	640204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NC_016051	CTC	2	6	640208	640213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1104	NC_016051	CGG	2	6	640218	640223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_016051	A	6	6	640260	640265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_016051	ACCTCT	2	12	640287	640298	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
1107	NC_016051	CCT	2	6	640426	640431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1108	NC_016051	TCA	2	6	643397	643402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_016051	GAT	2	6	643404	643409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_016051	CTT	2	6	643615	643620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_016051	T	6	6	643619	643624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_016051	TAC	2	6	643626	643631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_016051	AGGTG	2	10	643650	643659	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_016051	GAA	2	6	643660	643665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_016051	TCC	2	6	645536	645541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1116	NC_016051	GCC	2	6	645564	645569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1117	NC_016051	GAA	2	6	645584	645589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_016051	ACC	2	6	645608	645613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1119	NC_016051	GTAG	2	8	645621	645628	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_016051	A	6	6	645635	645640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_016051	A	7	7	645652	645658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_016051	CCA	2	6	647002	647007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1123	NC_016051	AAG	2	6	648583	648588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_016051	AGG	2	6	648599	648604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_016051	GAA	2	6	648610	648615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_016051	AAGA	2	8	648682	648689	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_016051	TC	3	6	648999	649004	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1128	NC_016051	GAA	2	6	649018	649023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_016051	ACC	2	6	650721	650726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1130	NC_016051	ACC	2	6	651099	651104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1131	NC_016051	ACC	2	6	655587	655592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1132	NC_016051	GTA	2	6	655607	655612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_016051	GGTA	2	8	655637	655644	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_016051	TA	3	6	655643	655648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_016051	GAAA	2	8	655673	655680	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_016051	GTC	2	6	656157	656162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1137	NC_016051	CAT	2	6	656213	656218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1173	NC_016051	GTG	2	6	679963	679968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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