MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 4018

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016051	GGCAAT	2	12	285279	285290	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
502	NC_016051	CCG	2	6	285316	285321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_016051	TCT	2	6	285326	285331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_016051	TCT	2	6	285376	285381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_016051	AAT	2	6	285417	285422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_016051	GGCAAC	2	12	285435	285446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_016051	CCG	2	6	285472	285477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_016051	T	6	6	285482	285487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_016051	GAA	2	6	285518	285523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_016051	ATA	2	6	285534	285539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_016051	AAT	2	6	285573	285578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_016051	GGCAAT	2	12	285591	285602	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
513	NC_016051	CCG	2	6	285628	285633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_016051	TCT	2	6	285638	285643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_016051	ACC	2	6	285693	285698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_016051	TTC	2	6	285716	285721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_016051	GGCAAC	2	12	285747	285758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_016051	CCG	2	6	285784	285789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_016051	T	6	6	285794	285799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_016051	GAA	2	6	285830	285835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_016051	ATA	2	6	285846	285851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_016051	AAT	2	6	285885	285890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_016051	TCA	2	6	285925	285930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_016051	GCC	2	6	285939	285944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_016051	CAC	2	6	285958	285963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
526	NC_016051	ACTC	2	8	285996	286003	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
527	NC_016051	AGG	2	6	286006	286011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
528	NC_016051	CAC	2	6	286060	286065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_016051	TAT	2	6	287434	287439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_016051	TA	3	6	287570	287575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_016051	GAT	2	6	290035	290040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_016051	TA	3	6	290050	290055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_016051	T	6	6	290068	290073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_016051	GGT	2	6	290077	290082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
535	NC_016051	CCG	2	6	290578	290583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_016051	GGT	2	6	290634	290639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_016051	GAGCG	2	10	290650	290659	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
538	NC_016051	TCC	2	6	290758	290763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
539	NC_016051	ACC	2	6	293336	293341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_016051	TAAGCT	2	12	294093	294104	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
541	NC_016051	T	6	6	294783	294788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_016051	GCCC	2	8	294822	294829	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
543	NC_016051	GAG	2	6	294838	294843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
544	NC_016051	GAT	2	6	294875	294880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_016051	TTTGC	2	10	294886	294895	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
546	NC_016051	AGG	2	6	298791	298796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
547	NC_016051	CTT	2	6	302145	302150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_016051	GTG	2	6	302208	302213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
549	NC_016051	AGAA	2	8	304909	304916	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
550	NC_016051	AAC	2	6	305672	305677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_016051	TCA	2	6	305693	305698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_016051	CCA	2	6	306373	306378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_016051	TCGG	2	8	306392	306399	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
554	NC_016051	T	6	6	306430	306435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_016051	TA	3	6	306489	306494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_016051	GGA	2	6	306535	306540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
557	NC_016051	CTT	2	6	308242	308247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_016051	AAT	2	6	309168	309173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_016051	AAGA	2	8	311967	311974	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
560	NC_016051	TAA	2	6	314067	314072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_016051	C	6	6	315273	315278	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
562	NC_016051	AAC	2	6	316308	316313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_016051	GAAA	2	8	316365	316372	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
564	NC_016051	T	6	6	316454	316459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_016051	AGT	2	6	318592	318597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_016051	TG	4	8	318600	318607	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
567	NC_016051	CAT	2	6	318626	318631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_016051	T	6	6	318694	318699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_016051	GT	5	10	318722	318731	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
570	NC_016051	CCA	3	9	318744	318752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
571	NC_016051	CTT	2	6	318796	318801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_016051	ACC	2	6	318839	318844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_016051	ACC	2	6	322075	322080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_016051	AAG	2	6	327135	327140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_016051	GAA	2	6	327162	327167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_016051	AG	3	6	327174	327179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
577	NC_016051	A	6	6	327643	327648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_016051	TCCC	2	8	329142	329149	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
579	NC_016051	AGG	2	6	331810	331815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
580	NC_016051	GAA	2	6	331853	331858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_016051	TGC	2	6	331867	331872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_016051	CCG	2	6	331937	331942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
583	NC_016051	TAAA	2	8	335357	335364	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_016051	AGGA	2	8	335414	335421	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
585	NC_016051	CCT	2	6	337805	337810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_016051	CCA	2	6	337954	337959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
587	NC_016051	TGA	2	6	337984	337989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_016051	TAG	2	6	338013	338018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_016051	GATG	2	8	338048	338055	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
590	NC_016051	TAA	2	6	338056	338061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_016051	ACA	2	6	338103	338108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_016051	TAA	2	6	338118	338123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_016051	TG	3	6	338129	338134	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
594	NC_016051	CTT	2	6	342118	342123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_016051	TTA	2	6	342150	342155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_016051	CCG	2	6	344033	344038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
597	NC_016051	GGT	2	6	344041	344046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
598	NC_016051	GGAA	2	8	344052	344059	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
599	NC_016051	GGT	3	9	344088	344096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
600	NC_016051	GTG	2	6	345779	345784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
601	NC_016051	GGT	2	6	347255	347260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
602	NC_016051	C	6	6	348981	348986	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
603	NC_016051	CCCG	2	8	349002	349009	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
604	NC_016051	AGG	2	6	350407	350412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
605	NC_016051	TAGCC	2	10	350752	350761	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
606	NC_016051	CTT	2	6	350837	350842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_016051	ATT	2	6	350945	350950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_016051	CTTTA	2	10	350957	350966	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
609	NC_016051	GAA	2	6	350994	350999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_016051	GGT	2	6	351069	351074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
611	NC_016051	GGT	2	6	354041	354046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
612	NC_016051	GTTTTA	2	12	355164	355175	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
613	NC_016051	ATC	2	6	355202	355207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_016051	AGTTA	2	10	355236	355245	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
615	NC_016051	AGG	2	6	355310	355315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
616	NC_016051	A	6	6	356624	356629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_016051	GCC	2	6	356642	356647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
618	NC_016051	CTC	2	6	356663	356668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
619	NC_016051	GGA	2	6	356696	356701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
620	NC_016051	CGA	2	6	356715	356720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_016051	AT	3	6	356727	356732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_016051	AACC	2	8	356743	356750	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
623	NC_016051	GTC	2	6	356839	356844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_016051	TGG	2	6	356848	356853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
625	NC_016051	T	6	6	357526	357531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_016051	ACC	2	6	359182	359187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
627	NC_016051	TCA	2	6	359720	359725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_016051	AAT	2	6	359804	359809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_016051	A	6	6	359819	359824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_016051	A	6	6	359895	359900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_016051	GTT	2	6	360516	360521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_016051	TTTC	2	8	360554	360561	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
633	NC_016051	GA	3	6	360580	360585	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
634	NC_016051	CAC	2	6	360586	360591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
635	NC_016051	CAA	2	6	366304	366309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_016051	GAT	2	6	366341	366346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
637	NC_016051	CCA	2	6	366381	366386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
638	NC_016051	AGAA	2	8	366402	366409	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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641	NC_016051	AAGGA	2	10	371245	371254	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
642	NC_016051	CAT	2	6	377738	377743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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647	NC_016051	C	6	6	382039	382044	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
648	NC_016051	CGA	2	6	383444	383449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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662	NC_016051	TGG	2	6	396534	396539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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