MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermoanaerobacter wiegelii Rt8.B1 chromosome

Total Repeats: 11503

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015958	TTA	2	6	23	28	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015958	AACT	2	8	31	38	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_015958	ATA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015958	TAT	2	6	52	57	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015958	AGG	2	6	101	106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015958	T	6	6	1484	1489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015958	TAA	2	6	1505	1510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015958	AAT	2	6	1516	1521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015958	TAC	2	6	1601	1606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015958	ACT	2	6	1608	1613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015958	CTTAT	2	10	1619	1628	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_015958	TTA	2	6	1629	1634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015958	TGATT	2	10	1637	1646	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015958	A	7	7	1648	1654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015958	T	6	6	2806	2811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015958	GAGC	2	8	6859	6866	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015958	CAA	2	6	6931	6936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015958	ACC	2	6	9047	9052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_015958	A	6	6	9059	9064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015958	TATAT	2	10	9423	9432	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015958	TATAT	2	10	9452	9461	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015958	AAT	2	6	9469	9474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015958	ATT	2	6	9484	9489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015958	ATAAA	2	10	9554	9563	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015958	CTT	2	6	14985	14990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015958	ATA	2	6	15010	15015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015958	A	7	7	15090	15096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015958	T	7	7	15103	15109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015958	T	6	6	15125	15130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015958	ATT	2	6	15149	15154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015958	AAT	2	6	15166	15171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015958	TGC	2	6	15193	15198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015958	AG	3	6	15288	15293	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015958	GGT	2	6	15296	15301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015958	CGG	2	6	15358	15363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015958	TTA	2	6	15369	15374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015958	GGT	2	6	15453	15458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015958	GGA	2	6	15466	15471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015958	AGG	2	6	17029	17034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015958	CGG	2	6	24407	24412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015958	GGAGAA	2	12	24477	24488	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015958	T	6	6	24519	24524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015958	T	6	6	24550	24555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015958	AGG	2	6	24561	24566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015958	AGG	2	6	26314	26319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015958	TGAAT	2	10	27535	27544	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015958	GAA	2	6	27562	27567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015958	CCT	2	6	29148	29153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_015958	TAT	2	6	29161	29166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015958	TGA	2	6	29178	29183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015958	ATT	2	6	29203	29208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015958	TAA	2	6	29214	29219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015958	A	7	7	29218	29224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015958	CCG	2	6	29226	29231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_015958	TC	3	6	29420	29425	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_015958	AAT	2	6	29429	29434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015958	TAT	2	6	29445	29450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015958	AT	3	6	29455	29460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015958	A	7	7	29483	29489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015958	TTTG	2	8	29496	29503	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015958	GAG	2	6	29538	29543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015958	AGT	2	6	30090	30095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015958	AGT	2	6	30103	30108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015958	ATA	2	6	30109	30114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015958	ATA	2	6	30124	30129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015958	AGT	2	6	30150	30155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015958	AG	3	6	30171	30176	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015958	TGG	3	9	30178	30186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015958	CTTA	2	8	30273	30280	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_015958	ATT	2	6	30331	30336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015958	AT	3	6	31629	31634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015958	TA	3	6	31653	31658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015958	T	7	7	31812	31818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015958	CCT	2	6	31913	31918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_015958	TAT	2	6	31931	31936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015958	TGC	2	6	31939	31944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015958	A	6	6	31959	31964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015958	TCC	2	6	33213	33218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_015958	ATT	2	6	33234	33239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015958	TA	3	6	33245	33250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015958	AT	3	6	33255	33260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015958	CAATTG	2	12	36165	36176	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_015958	TTA	2	6	36196	36201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015958	TA	3	6	36200	36205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015958	CTCC	2	8	36276	36283	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
86	NC_015958	GA	3	6	36298	36303	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015958	T	6	6	36332	36337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015958	ATT	2	6	36380	36385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015958	CAT	2	6	36397	36402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015958	ATAG	2	8	36404	36411	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015958	TTA	2	6	36434	36439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015958	TCTA	2	8	36469	36476	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_015958	A	6	6	36513	36518	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015958	AAGT	2	8	36564	36571	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015958	ATT	2	6	36707	36712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015958	ATT	2	6	36727	36732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015958	TCC	2	6	36753	36758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_015958	TTA	2	6	36773	36778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015958	TGG	2	6	36869	36874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015958	GGT	2	6	36875	36880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015958	A	6	6	37639	37644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015958	TGT	2	6	37660	37665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015958	TTTTAT	2	12	37676	37687	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015958	ATA	2	6	37729	37734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015958	TAT	2	6	37748	37753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015958	A	7	7	37771	37777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015958	TTG	2	6	37780	37785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015958	TG	3	6	37808	37813	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015958	ATA	2	6	37832	37837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015958	TA	3	6	37836	37841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015958	TAA	2	6	37861	37866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015958	ACG	2	6	37867	37872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015958	ATA	2	6	44520	44525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015958	AGG	2	6	47303	47308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015958	ATA	2	6	48371	48376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015958	ACTAA	2	10	48417	48426	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_015958	GCCTT	2	10	48467	48476	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_015958	GCCT	2	8	48505	48512	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_015958	TCT	2	6	48513	48518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015958	AGCAA	2	10	48566	48575	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_015958	CA	3	6	48657	48662	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_015958	T	6	6	48696	48701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015958	AAC	2	6	48705	48710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015958	TCCA	2	8	48737	48744	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_015958	T	6	6	48750	48755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015958	TAA	2	6	48809	48814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015958	TGAG	2	8	48840	48847	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015958	GTA	2	6	48862	48867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015958	T	7	7	48886	48892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015958	T	6	6	48961	48966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015958	AT	4	8	49029	49036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015958	ACT	2	6	49111	49116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015958	ATA	2	6	49117	49122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015958	CAAG	2	8	49132	49139	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_015958	AGGA	2	8	49152	49159	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015958	AT	3	6	49543	49548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015958	GAG	2	6	49552	49557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015958	ATGA	2	8	51206	51213	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015958	A	7	7	51218	51224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015958	TGCG	2	8	51253	51260	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_015958	GAAG	2	8	51359	51366	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015958	TGA	2	6	51387	51392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015958	GATG	2	8	51421	51428	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015958	AT	3	6	51488	51493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015958	CAG	2	6	51601	51606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_015958	AAGG	2	8	51639	51646	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015958	AGG	2	6	51657	51662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015958	CCG	2	6	53093	53098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_015958	GTAC	2	8	53110	53117	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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432	NC_015958	TGG	2	6	100283	100288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
433	NC_015958	ACC	2	6	100335	100340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
434	NC_015958	TAC	2	6	100354	100359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
435	NC_015958	GGGAG	2	10	100410	100419	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
436	NC_015958	GA	3	6	100466	100471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
437	NC_015958	GAT	2	6	100475	100480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
438	NC_015958	AAGCGA	2	12	100549	100560	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
439	NC_015958	TGC	2	6	100581	100586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
440	NC_015958	TGG	2	6	100643	100648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
441	NC_015958	AGGA	2	8	100846	100853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
442	NC_015958	AGC	2	6	100990	100995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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444	NC_015958	CCG	2	6	101209	101214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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452	NC_015958	ACC	2	6	102040	102045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
453	NC_015958	CCT	2	6	102128	102133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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455	NC_015958	AG	3	6	102187	102192	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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457	NC_015958	CGG	2	6	102264	102269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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461	NC_015958	TGTT	2	8	104085	104092	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
462	NC_015958	CGTTT	2	10	104113	104122	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
463	NC_015958	TAT	2	6	104133	104138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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465	NC_015958	GAG	2	6	104248	104253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
466	NC_015958	AGG	2	6	105581	105586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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468	NC_015958	AGG	2	6	108130	108135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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470	NC_015958	GTGC	2	8	108559	108566	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
471	NC_015958	GAAG	2	8	108666	108673	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
472	NC_015958	TGA	2	6	108694	108699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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475	NC_015958	CAG	2	6	108908	108913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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