MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 3617

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015865	CAG	2	6	8	13	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015865	GCAG	2	8	30	37	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_015865	ACC	2	6	38	43	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_015865	ATA	2	6	320	325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015865	CT	3	6	347	352	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015865	AGT	2	6	419	424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015865	GTC	2	6	500	505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015865	CAT	2	6	532	537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015865	CTC	2	6	583	588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_015865	CAC	2	6	10700	10705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_015865	AGC	2	6	11778	11783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015865	TAA	2	6	11804	11809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015865	ATG	2	6	11828	11833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015865	TCC	2	6	14859	14864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_015865	ATC	2	6	14873	14878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015865	TCA	2	6	14881	14886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015865	TTA	2	6	22261	22266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015865	TTA	2	6	22278	22283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015865	GTT	2	6	22286	22291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015865	AAAG	2	8	24403	24410	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015865	ACC	2	6	29503	29508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_015865	GA	3	6	29522	29527	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015865	GGGT	2	8	29561	29568	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015865	TGTCT	2	10	29602	29611	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_015865	CAA	2	6	29614	29619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015865	AACA	2	8	29683	29690	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_015865	CCG	2	6	29859	29864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_015865	GCG	2	6	29931	29936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015865	ACC	3	9	31198	31206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_015865	A	6	6	31238	31243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015865	GGC	2	6	31255	31260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015865	GAC	2	6	37222	37227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015865	A	6	6	37240	37245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015865	AC	3	6	38468	38473	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015865	CAC	2	6	40869	40874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_015865	GGA	2	6	40920	40925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015865	TAT	2	6	40926	40931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015865	ACT	2	6	41001	41006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015865	GTG	2	6	41017	41022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015865	AAAT	2	8	41109	41116	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015865	GGT	2	6	41176	41181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015865	AAG	2	6	42315	42320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015865	TC	3	6	45204	45209	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015865	CTC	2	6	45231	45236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_015865	TAT	2	6	45354	45359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015865	ATC	2	6	45364	45369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015865	TGGT	2	8	45419	45426	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015865	TTCG	2	8	45663	45670	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_015865	CTT	2	6	45685	45690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015865	TC	3	6	45705	45710	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015865	CTC	2	6	45755	45760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_015865	TAT	2	6	45766	45771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015865	CCG	2	6	46021	46026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_015865	GAC	2	6	46082	46087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015865	GA	3	6	46145	46150	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015865	TCC	2	6	48064	48069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_015865	CTT	2	6	48980	48985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015865	GA	3	6	48995	49000	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015865	GAT	2	6	49627	49632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015865	TTTC	2	8	49638	49645	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_015865	GCT	2	6	49682	49687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015865	TTCA	2	8	50857	50864	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_015865	TTTC	2	8	51345	51352	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_015865	TTCC	2	8	51355	51362	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_015865	ACC	2	6	51409	51414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_015865	AACT	2	8	51420	51427	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_015865	ACC	2	6	52821	52826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_015865	CAC	2	6	57682	57687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_015865	CGA	2	6	57753	57758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015865	AAC	2	6	57768	57773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_015865	TCA	2	6	63572	63577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015865	ACC	2	6	65258	65263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_015865	GCA	2	6	66951	66956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015865	GAG	2	6	66983	66988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015865	GTT	2	6	67103	67108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015865	GCT	2	6	67142	67147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015865	GGTC	2	8	67258	67265	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_015865	AAG	2	6	67276	67281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015865	AGG	2	6	80573	80578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015865	CCT	2	6	80627	80632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_015865	TGG	2	6	80683	80688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015865	ACA	2	6	80712	80717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015865	CCG	2	6	81836	81841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_015865	GTT	2	6	81869	81874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015865	GAG	2	6	83870	83875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015865	CCT	2	6	83881	83886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_015865	CTT	2	6	85063	85068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015865	T	6	6	85077	85082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015865	C	6	6	85091	85096	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
90	NC_015865	TGG	2	6	85106	85111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015865	G	7	7	85110	85116	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015865	TA	4	8	85134	85141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015865	CT	3	6	88032	88037	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_015865	CGT	2	6	88062	88067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015865	AGG	2	6	88073	88078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015865	GAAC	2	8	88155	88162	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_015865	CTTT	2	8	88202	88209	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_015865	GTA	2	6	88228	88233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015865	TAT	2	6	88270	88275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015865	AGCTC	2	10	88281	88290	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_015865	CCT	2	6	88338	88343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_015865	AGT	2	6	88373	88378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015865	ATC	2	6	88619	88624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015865	ACC	2	6	88644	88649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_015865	AT	3	6	88667	88672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015865	CCT	2	6	90193	90198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_015865	CCA	2	6	91339	91344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_015865	TGGG	2	8	91356	91363	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015865	ACC	3	9	92770	92778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_015865	GAA	2	6	93917	93922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015865	GAA	2	6	94620	94625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015865	AGA	2	6	94679	94684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015865	AAGGAA	2	12	94691	94702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015865	TCG	2	6	95025	95030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015865	ACCA	2	8	95107	95114	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_015865	TGGT	2	8	95169	95176	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015865	TTG	2	6	96576	96581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015865	TCA	2	6	96587	96592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015865	TCG	2	6	96593	96598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015865	TC	3	6	96605	96610	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_015865	ATT	2	6	96625	96630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015865	CATT	2	8	96679	96686	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_015865	AT	3	6	96687	96692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015865	TTA	2	6	96732	96737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015865	A	6	6	96745	96750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015865	ATT	2	6	96788	96793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015865	TG	3	6	96795	96800	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015865	TG	3	6	96809	96814	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015865	GAGT	2	8	96831	96838	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015865	TGC	2	6	97014	97019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_015865	TGT	2	6	97040	97045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015865	ATC	2	6	97050	97055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015865	TCC	2	6	97097	97102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_015865	TAG	2	6	97152	97157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015865	AATG	2	8	97240	97247	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015865	CTT	2	6	97287	97292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_015865	TAAA	2	8	97345	97352	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015865	GTA	2	6	97353	97358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015865	GGA	2	6	97439	97444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015865	C	6	6	97475	97480	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
141	NC_015865	TCG	2	6	97492	97497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_015865	GCT	2	6	97511	97516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_015865	TGC	2	6	97905	97910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_015865	GT	4	8	97936	97943	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015865	TG	3	6	97972	97977	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015865	T	7	7	98022	98028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015865	T	6	6	98038	98043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015865	CTT	2	6	98055	98060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_015865	ATA	2	6	98081	98086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015865	TAT	2	6	98102	98107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015865	TAA	2	6	98149	98154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015865	GA	3	6	98212	98217	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015865	CTCC	2	8	98744	98751	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
154	NC_015865	TGG	2	6	98763	98768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
155	NC_015865	GA	3	6	98770	98775	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
156	NC_015865	AG	3	6	99280	99285	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
157	NC_015865	TTC	2	6	99315	99320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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160	NC_015865	CTTCTC	2	12	101430	101441	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
161	NC_015865	CAG	2	6	101442	101447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_015865	ATT	2	6	101474	101479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_015865	CGG	2	6	101482	101487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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167	NC_015865	A	6	6	103388	103393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_015865	TCCT	2	8	103630	103637	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
169	NC_015865	AG	3	6	103675	103680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
170	NC_015865	ACC	2	6	104303	104308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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180	NC_015865	GCC	2	6	107657	107662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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182	NC_015865	ACC	2	6	109047	109052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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193	NC_015865	A	6	6	118716	118721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_015865	AG	3	6	118769	118774	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_015865	AGA	2	6	120655	120660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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199	NC_015865	CTG	2	6	120693	120698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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228	NC_015865	CA	3	6	131714	131719	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
229	NC_015865	CA	3	6	131783	131788	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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232	NC_015865	CA	3	6	131919	131924	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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280	NC_015865	GTTGC	2	10	136273	136282	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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286	NC_015865	GAG	2	6	136482	136487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
287	NC_015865	CAAACC	2	12	136511	136522	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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