MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 3617

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015865	CGGG	2	8	1931337	1931344	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3502	NC_015865	T	6	6	1931922	1931927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_015865	GGT	2	6	1931950	1931955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_015865	CAC	2	6	1935939	1935944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3505	NC_015865	AAC	2	6	1935983	1935988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_015865	GGT	2	6	1935996	1936001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_015865	T	6	6	1938201	1938206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_015865	TCT	2	6	1938327	1938332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_015865	TCA	2	6	1938390	1938395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_015865	TTC	2	6	1938406	1938411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_015865	G	6	6	1938426	1938431	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_015865	CAAA	2	8	1938545	1938552	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3513	NC_015865	AGA	2	6	1938623	1938628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_015865	CGGGG	2	10	1938678	1938687	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
3515	NC_015865	GGA	2	6	1943677	1943682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_015865	GA	3	6	1945739	1945744	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_015865	GTACC	2	10	1948818	1948827	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3518	NC_015865	GGAA	2	8	1950295	1950302	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_015865	C	6	6	1951740	1951745	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3520	NC_015865	AT	3	6	1953826	1953831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_015865	TCA	2	6	1953844	1953849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_015865	TC	3	6	1954968	1954973	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3523	NC_015865	AAC	2	6	1954977	1954982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_015865	GAA	2	6	1956128	1956133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_015865	ACC	3	9	1956855	1956863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3526	NC_015865	CCA	2	6	1958308	1958313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3527	NC_015865	C	6	6	1960442	1960447	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3528	NC_015865	GCAT	2	8	1963562	1963569	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3529	NC_015865	GAT	2	6	1963571	1963576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_015865	AT	3	6	1963620	1963625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_015865	GAA	2	6	1963630	1963635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_015865	GATA	2	8	1966465	1966472	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_015865	T	7	7	1966474	1966480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_015865	ATA	2	6	1966485	1966490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_015865	A	6	6	1966521	1966526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_015865	GAA	2	6	1966663	1966668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_015865	T	6	6	1966674	1966679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_015865	TTA	2	6	1966720	1966725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_015865	GGT	2	6	1966751	1966756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_015865	T	6	6	1968877	1968882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_015865	CTT	2	6	1968883	1968888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_015865	CAA	2	6	1968900	1968905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_015865	TCA	2	6	1970701	1970706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_015865	CGG	2	6	1970724	1970729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_015865	TCA	2	6	1973598	1973603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3546	NC_015865	G	6	6	1973608	1973613	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_015865	GAA	2	6	1973648	1973653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_015865	GGC	2	6	1973680	1973685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_015865	GA	3	6	1973751	1973756	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_015865	AAAT	2	8	1975803	1975810	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_015865	ACC	2	6	1976447	1976452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3552	NC_015865	AAATG	2	10	1976454	1976463	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_015865	ACC	2	6	1977544	1977549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3554	NC_015865	TTG	2	6	1979474	1979479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_015865	A	6	6	1979504	1979509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_015865	GTGG	2	8	1981010	1981017	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_015865	TAA	2	6	1981029	1981034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_015865	A	6	6	1981033	1981038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_015865	AGCA	2	8	1981049	1981056	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3560	NC_015865	A	7	7	1981056	1981062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_015865	GGA	2	6	1981064	1981069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_015865	GGT	2	6	1982274	1982279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_015865	TTC	2	6	1983412	1983417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_015865	TGG	2	6	1983431	1983436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_015865	A	6	6	1987414	1987419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_015865	TTTGG	2	10	1987866	1987875	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_015865	GC	3	6	1987897	1987902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3568	NC_015865	CCA	2	6	1992432	1992437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3569	NC_015865	AGC	2	6	1992452	1992457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_015865	T	7	7	1992477	1992483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_015865	TC	3	6	1992492	1992497	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3572	NC_015865	AGA	2	6	1992517	1992522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_015865	CTT	2	6	1992573	1992578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_015865	CAT	2	6	1993197	1993202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3575	NC_015865	TGG	2	6	1993306	1993311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_015865	A	6	6	1994776	1994781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_015865	TGA	2	6	1994782	1994787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_015865	CAC	2	6	1995830	1995835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3579	NC_015865	GAAA	2	8	1995872	1995879	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_015865	ACC	2	6	1997788	1997793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3581	NC_015865	GTT	2	6	1997893	1997898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_015865	CCG	2	6	1999070	1999075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3583	NC_015865	GGC	2	6	2000114	2000119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_015865	T	6	6	2002561	2002566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_015865	GTAG	2	8	2002638	2002645	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_015865	TTGG	2	8	2002669	2002676	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_015865	G	6	6	2003829	2003834	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_015865	GCCAC	2	10	2003909	2003918	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3589	NC_015865	TAAAA	2	10	2003921	2003930	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_015865	T	6	6	2004956	2004961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_015865	CAA	2	6	2004971	2004976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_015865	TTA	2	6	2004991	2004996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_015865	TTA	2	6	2005003	2005008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_015865	ATT	2	6	2005013	2005018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_015865	GTTT	2	8	2006192	2006199	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_015865	TA	3	6	2006264	2006269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_015865	GGAG	2	8	2007154	2007161	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_015865	ATCA	2	8	2007186	2007193	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3599	NC_015865	CGG	2	6	2007207	2007212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_015865	TGG	2	6	2007312	2007317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_015865	ACC	2	6	2008623	2008628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3602	NC_015865	AGA	2	6	2008684	2008689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_015865	AGT	2	6	2008742	2008747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_015865	T	6	6	2008825	2008830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_015865	GGT	2	6	2008855	2008860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_015865	TA	3	6	2009002	2009007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_015865	CCT	2	6	2009030	2009035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3608	NC_015865	T	8	8	2010375	2010382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_015865	TCTT	2	8	2010400	2010407	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3610	NC_015865	ATA	2	6	2010441	2010446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_015865	ACAA	2	8	2010486	2010493	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3612	NC_015865	A	6	6	2010492	2010497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_015865	AGG	2	6	2010544	2010549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_015865	AAG	2	6	2011225	2011230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_015865	TGG	2	6	2011278	2011283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_015865	GCT	2	6	2011292	2011297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_015865	TCA	2	6	2011305	2011310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.