MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 3617

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015865	TAA	2	6	845152	845157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_015865	GGTT	2	8	845926	845933	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_015865	TCCCC	2	10	846025	846034	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
1504	NC_015865	GTGC	2	8	846084	846091	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1505	NC_015865	TCT	2	6	846109	846114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_015865	A	6	6	846200	846205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_015865	TTC	2	6	847272	847277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_015865	CAC	2	6	848651	848656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1509	NC_015865	ACA	2	6	851244	851249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_015865	CTG	2	6	851253	851258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_015865	AGA	2	6	851274	851279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_015865	GTG	2	6	851352	851357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_015865	GAA	2	6	852947	852952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_015865	ACC	2	6	854218	854223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1515	NC_015865	AT	3	6	854264	854269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_015865	AGG	2	6	854284	854289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_015865	CGA	2	6	854336	854341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_015865	TCC	2	6	854351	854356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1519	NC_015865	T	6	6	854395	854400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_015865	AGAC	2	8	854438	854445	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1521	NC_015865	GCG	2	6	854473	854478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_015865	TCA	2	6	854497	854502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_015865	ATC	2	6	854526	854531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_015865	CCAT	2	8	854537	854544	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1525	NC_015865	T	6	6	854654	854659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_015865	A	7	7	854729	854735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_015865	AAC	2	6	854843	854848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_015865	TTTC	2	8	856523	856530	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1529	NC_015865	G	7	7	856538	856544	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_015865	ATAG	2	8	857625	857632	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_015865	AAACAA	2	12	857661	857672	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1532	NC_015865	GA	3	6	859796	859801	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_015865	ACC	2	6	862604	862609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1534	NC_015865	TAA	2	6	864157	864162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_015865	AAT	2	6	864183	864188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_015865	ACG	2	6	864219	864224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_015865	GGA	2	6	864235	864240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_015865	GTTT	2	8	865653	865660	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_015865	CAA	2	6	866941	866946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_015865	TGG	2	6	866975	866980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_015865	ATT	3	9	869106	869114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_015865	T	6	6	869113	869118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_015865	T	6	6	869133	869138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_015865	AAG	2	6	869172	869177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_015865	GTCG	2	8	869937	869944	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1546	NC_015865	AAT	2	6	869976	869981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_015865	TGA	2	6	869991	869996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_015865	C	6	6	872107	872112	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1549	NC_015865	G	6	6	872216	872221	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_015865	TCT	2	6	872226	872231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_015865	C	6	6	872272	872277	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1552	NC_015865	A	6	6	872307	872312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_015865	GAG	2	6	872317	872322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1561	NC_015865	TA	3	6	880886	880891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_015865	GGA	2	6	880930	880935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_015865	GTG	2	6	885821	885826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_015865	ACC	2	6	890012	890017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1565	NC_015865	GGT	2	6	890068	890073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_015865	TGT	2	6	890932	890937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_015865	TTTCT	2	10	890959	890968	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1568	NC_015865	ACA	2	6	891020	891025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_015865	CCTG	2	8	891040	891047	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1570	NC_015865	GAAGC	2	10	891094	891103	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1571	NC_015865	GAAG	2	8	891137	891144	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_015865	GA	3	6	891200	891205	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_015865	AGA	2	6	891234	891239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_015865	GTAG	2	8	891362	891369	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_015865	TGA	2	6	891413	891418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1578	NC_015865	GGT	2	6	891630	891635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1580	NC_015865	GGT	2	6	891774	891779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1584	NC_015865	GAGT	2	8	892092	892099	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1586	NC_015865	GA	3	6	892222	892227	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_015865	A	7	7	892266	892272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_015865	C	6	6	893643	893648	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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1592	NC_015865	A	6	6	893743	893748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1601	NC_015865	GTC	2	6	897434	897439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_015865	TGAA	2	8	897452	897459	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_015865	AT	3	6	897461	897466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_015865	A	6	6	897502	897507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_015865	ACATT	2	10	897520	897529	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1606	NC_015865	CCAAC	2	10	897540	897549	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
1607	NC_015865	GA	3	6	897584	897589	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_015865	CCCTT	2	10	901259	901268	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
1609	NC_015865	CTAG	2	8	901299	901306	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1612	NC_015865	CCG	2	6	901352	901357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1613	NC_015865	CA	3	6	901367	901372	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1614	NC_015865	TCT	2	6	901374	901379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_015865	GAT	2	6	901409	901414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_015865	TTCAT	2	10	901442	901451	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1617	NC_015865	GAA	2	6	901511	901516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_015865	A	6	6	901515	901520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1620	NC_015865	TTAAA	2	10	901882	901891	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1629	NC_015865	GAAT	2	8	904898	904905	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_015865	TC	3	6	905331	905336	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1631	NC_015865	CCT	2	6	906148	906153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1632	NC_015865	CT	3	6	906159	906164	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1633	NC_015865	GCGGGG	2	12	906213	906224	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
1634	NC_015865	ACGGG	2	10	906245	906254	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1635	NC_015865	A	6	6	907091	907096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_015865	GTT	2	6	907100	907105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1638	NC_015865	CGA	2	6	911090	911095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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