MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 3617

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015865	AATC	2	8	551173	551180	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1002	NC_015865	AT	3	6	551217	551222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_015865	AAAG	2	8	551237	551244	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_015865	TTC	3	9	552577	552585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_015865	AGT	3	9	553394	553402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_015865	ACC	2	6	553988	553993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1007	NC_015865	GAT	2	6	554099	554104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_015865	T	6	6	554633	554638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_015865	CTTCC	2	10	554644	554653	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
1010	NC_015865	GA	3	6	554664	554669	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_015865	ACC	2	6	555463	555468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1012	NC_015865	GCG	2	6	555473	555478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_015865	CAA	2	6	555549	555554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_015865	TGA	2	6	555566	555571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_015865	TGAA	2	8	558394	558401	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_015865	ACGGC	2	10	559810	559819	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1017	NC_015865	TCA	2	6	559863	559868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_015865	TCC	2	6	561265	561270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1019	NC_015865	TA	4	8	561326	561333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_015865	ACC	3	9	561629	561637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1021	NC_015865	TTAA	2	8	561645	561652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_015865	GAA	2	6	562234	562239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_015865	CGA	2	6	562245	562250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_015865	G	6	6	562282	562287	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_015865	C	6	6	562302	562307	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1026	NC_015865	AAT	2	6	562339	562344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_015865	TGT	2	6	562401	562406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_015865	GTTT	2	8	562409	562416	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_015865	CGCA	2	8	562543	562550	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1030	NC_015865	CGG	2	6	562652	562657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_015865	TGA	2	6	562679	562684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_015865	CCTTT	2	10	563044	563053	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1033	NC_015865	TTTCG	2	10	563228	563237	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1034	NC_015865	TGAG	2	8	563265	563272	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_015865	GAC	2	6	564136	564141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_015865	TA	3	6	564180	564185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_015865	CTT	2	6	565019	565024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_015865	C	7	7	565030	565036	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1039	NC_015865	ATTACG	2	12	565052	565063	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1040	NC_015865	GT	4	8	565067	565074	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_015865	CTCTT	2	10	565428	565437	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1042	NC_015865	GGT	2	6	565446	565451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_015865	AT	3	6	567876	567881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_015865	GGT	2	6	567943	567948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_015865	GAA	2	6	567954	567959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_015865	GGTTT	2	10	567985	567994	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_015865	T	7	7	567992	567998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_015865	T	6	6	569198	569203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_015865	TGG	2	6	569229	569234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_015865	GTTTG	2	10	571008	571017	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_015865	TCT	2	6	571020	571025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_015865	ATTTT	2	10	571085	571094	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_015865	G	6	6	571112	571117	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_015865	CAC	2	6	575100	575105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1055	NC_015865	TTAA	2	8	575130	575137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_015865	TTG	2	6	576460	576465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_015865	A	6	6	576491	576496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_015865	GAGGT	2	10	576527	576536	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_015865	GAAAG	2	10	577804	577813	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_015865	A	6	6	577814	577819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_015865	TCCC	2	8	579461	579468	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1062	NC_015865	A	6	6	579525	579530	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_015865	TTA	2	6	579536	579541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_015865	AT	3	6	579554	579559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_015865	A	6	6	579561	579566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_015865	TCC	2	6	580258	580263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_015865	AGA	2	6	581045	581050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_015865	TTA	2	6	581060	581065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_015865	GAA	2	6	581152	581157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_015865	TA	3	6	581161	581166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_015865	A	6	6	581203	581208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_015865	AAAT	2	8	581740	581747	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_015865	CGG	2	6	581836	581841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_015865	CGA	2	6	581910	581915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_015865	TTA	2	6	581921	581926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_015865	CCT	2	6	582916	582921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1077	NC_015865	GAA	2	6	583035	583040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_015865	CT	4	8	583053	583060	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1079	NC_015865	TA	4	8	585587	585594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_015865	T	7	7	587397	587403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_015865	T	6	6	588852	588857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_015865	CTATT	2	10	589322	589331	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1083	NC_015865	TCT	2	6	589361	589366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_015865	CCG	2	6	590988	590993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1085	NC_015865	TA	3	6	590999	591004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_015865	GAA	2	6	591081	591086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_015865	GA	3	6	591090	591095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_015865	T	6	6	591225	591230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_015865	TCAG	2	8	591233	591240	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1090	NC_015865	AGG	2	6	593570	593575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_015865	AAGCTT	2	12	593581	593592	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1092	NC_015865	TGA	2	6	593618	593623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_015865	GGT	2	6	595342	595347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_015865	CCA	2	6	597604	597609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1095	NC_015865	GGA	2	6	597625	597630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_015865	TTAGG	2	10	598678	598687	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_015865	TTAA	2	8	603434	603441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_015865	GAGC	2	8	603466	603473	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1099	NC_015865	T	7	7	603474	603480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_015865	GA	3	6	603484	603489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_015865	TA	4	8	603510	603517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_015865	ACA	2	6	603542	603547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_015865	AGG	2	6	603584	603589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_015865	TTCC	2	8	605393	605400	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1105	NC_015865	TC	3	6	605409	605414	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1106	NC_015865	C	6	6	607976	607981	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1107	NC_015865	AATC	2	8	607989	607996	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1108	NC_015865	TC	3	6	610031	610036	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1109	NC_015865	AGG	2	6	610091	610096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_015865	CGG	2	6	610878	610883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_015865	CGA	2	6	612411	612416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_015865	GGAG	2	8	612495	612502	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_015865	CCT	2	6	616382	616387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1114	NC_015865	GCC	2	6	619690	619695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1115	NC_015865	GAT	2	6	619747	619752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_015865	ACT	2	6	620810	620815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_015865	TTTC	2	8	620822	620829	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1118	NC_015865	CTC	2	6	620848	620853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1119	NC_015865	AGG	2	6	620868	620873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_015865	AAT	2	6	624289	624294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_015865	CCG	2	6	624337	624342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1122	NC_015865	TCG	2	6	626515	626520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_015865	AC	4	8	629639	629646	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1124	NC_015865	TAT	2	6	629826	629831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_015865	ACC	2	6	634309	634314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1126	NC_015865	CT	3	6	635394	635399	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1127	NC_015865	GGT	2	6	635404	635409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_015865	AGA	2	6	637954	637959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_015865	AAGG	2	8	638012	638019	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_015865	T	6	6	639554	639559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_015865	TTG	2	6	640052	640057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_015865	GAA	2	6	640081	640086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_015865	TAA	2	6	640092	640097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_015865	GTG	2	6	640118	640123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_015865	GGGA	2	8	642754	642761	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_015865	GA	3	6	642760	642765	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_015865	CAC	2	6	643451	643456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1138	NC_015865	TAA	2	6	643480	643485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1139	NC_015865	GGA	2	6	643520	643525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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