MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 3617

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015865	GCC	2	6	229796	229801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
502	NC_015865	TCA	2	6	229859	229864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_015865	GGT	2	6	229873	229878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
504	NC_015865	TCTTG	2	10	232107	232116	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
505	NC_015865	TAT	2	6	232208	232213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_015865	CGG	2	6	233705	233710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_015865	CCCG	2	8	233715	233722	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
508	NC_015865	CCTTT	2	10	235099	235108	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
509	NC_015865	AGG	2	6	235124	235129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
510	NC_015865	TAGCC	2	10	235469	235478	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
511	NC_015865	CCA	2	6	235516	235521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_015865	CCA	2	6	235545	235550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_015865	TTC	2	6	235606	235611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_015865	TTCAA	2	10	235619	235628	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
515	NC_015865	GTT	2	6	235778	235783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_015865	CT	3	6	235799	235804	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
517	NC_015865	TA	3	6	240457	240462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_015865	GAG	2	6	240468	240473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
519	NC_015865	ACC	2	6	243624	243629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
520	NC_015865	GGA	2	6	245198	245203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
521	NC_015865	GAA	2	6	245235	245240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_015865	AAAGA	2	10	245243	245252	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
523	NC_015865	GGA	2	6	247191	247196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_015865	GTTAA	2	10	247235	247244	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
525	NC_015865	ACC	2	6	247257	247262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
526	NC_015865	AGA	2	6	247402	247407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_015865	CAG	2	6	248264	248269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_015865	GAG	2	6	248312	248317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
529	NC_015865	ACG	2	6	248336	248341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_015865	TCC	2	6	248358	248363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
531	NC_015865	GAG	2	6	248374	248379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
532	NC_015865	CTT	2	6	248739	248744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_015865	GAC	2	6	248792	248797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_015865	TGA	2	6	248817	248822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_015865	C	6	6	248874	248879	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
536	NC_015865	ACC	2	6	250514	250519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
537	NC_015865	ATGGA	2	10	250555	250564	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
538	NC_015865	CCT	2	6	250776	250781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
539	NC_015865	GCC	2	6	250804	250809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_015865	AAT	2	6	250810	250815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_015865	CCT	2	6	250820	250825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
542	NC_015865	GTG	2	6	250858	250863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
543	NC_015865	GGT	2	6	250939	250944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
544	NC_015865	CCCA	2	8	255063	255070	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
545	NC_015865	TA	3	6	255093	255098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_015865	CTTTT	2	10	259191	259200	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
547	NC_015865	T	6	6	259222	259227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_015865	TGTT	2	8	259252	259259	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
549	NC_015865	AAC	2	6	259303	259308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_015865	TTTA	2	8	259320	259327	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_015865	GGT	2	6	259350	259355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
552	NC_015865	G	6	6	259365	259370	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
553	NC_015865	GGA	2	6	259374	259379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
554	NC_015865	A	6	6	259390	259395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_015865	CAC	2	6	261179	261184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_015865	CCT	2	6	261232	261237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
557	NC_015865	T	6	6	261298	261303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_015865	AAG	2	6	265233	265238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_015865	ACT	2	6	265256	265261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_015865	GCG	2	6	266156	266161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_015865	TAT	2	6	266286	266291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_015865	ATC	2	6	266339	266344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_015865	C	6	6	266871	266876	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
564	NC_015865	CAC	2	6	266926	266931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_015865	CCA	2	6	266945	266950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_015865	GTTTC	2	10	269409	269418	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
567	NC_015865	TTA	2	6	269430	269435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_015865	TAA	2	6	269452	269457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_015865	GA	3	6	269459	269464	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
570	NC_015865	GGT	2	6	270016	270021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
571	NC_015865	AAT	2	6	271431	271436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_015865	AGG	2	6	271451	271456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
573	NC_015865	A	6	6	274393	274398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_015865	TTG	2	6	279478	279483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_015865	T	6	6	279536	279541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_015865	TTC	2	6	282054	282059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_015865	AGG	2	6	282144	282149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
578	NC_015865	GA	3	6	283906	283911	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
579	NC_015865	AGCA	2	8	284877	284884	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
580	NC_015865	CTT	2	6	284903	284908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_015865	GTTTTT	2	12	286081	286092	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
582	NC_015865	TC	3	6	288016	288021	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
583	NC_015865	CCTT	2	8	288025	288032	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
584	NC_015865	CTGTG	2	10	288038	288047	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
585	NC_015865	CTC	2	6	288048	288053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_015865	TGC	2	6	288057	288062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_015865	TGCA	2	8	288079	288086	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
588	NC_015865	GAA	2	6	299690	299695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_015865	TCGTT	2	10	300831	300840	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
590	NC_015865	TGT	2	6	300874	300879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_015865	GGT	2	6	300922	300927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
592	NC_015865	GTG	2	6	300944	300949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
593	NC_015865	GTC	2	6	300971	300976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_015865	CCG	3	9	300986	300994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
595	NC_015865	AGC	2	6	301031	301036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_015865	GAG	2	6	301042	301047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
597	NC_015865	ACC	2	6	301067	301072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
598	NC_015865	TGG	2	6	301089	301094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
599	NC_015865	GAG	2	6	301245	301250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
600	NC_015865	GAA	2	6	301283	301288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_015865	TCC	2	6	301317	301322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_015865	TA	3	6	301909	301914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_015865	TAAA	2	8	304196	304203	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_015865	ATTT	2	8	305584	305591	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_015865	TA	3	6	307822	307827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_015865	CG	3	6	307855	307860	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
607	NC_015865	TGG	2	6	307881	307886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
608	NC_015865	CCG	2	6	308019	308024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
609	NC_015865	CGGG	2	8	308051	308058	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
610	NC_015865	TTA	2	6	308091	308096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_015865	TCA	2	6	310153	310158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_015865	ACC	2	6	310712	310717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_015865	TAA	2	6	310740	310745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_015865	GAG	2	6	310797	310802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
615	NC_015865	GA	3	6	311426	311431	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
616	NC_015865	ACC	2	6	313088	313093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_015865	ACT	2	6	313396	313401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_015865	ACC	2	6	315116	315121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
619	NC_015865	GTGC	2	8	317729	317736	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
620	NC_015865	AAT	2	6	317762	317767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_015865	ACA	2	6	317794	317799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_015865	AT	3	6	325596	325601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_015865	TGG	2	6	325611	325616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
624	NC_015865	TGG	2	6	326406	326411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
625	NC_015865	CTT	2	6	326467	326472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_015865	CAC	2	6	326491	326496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
627	NC_015865	GCC	2	6	326518	326523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_015865	A	6	6	326546	326551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_015865	CTTT	2	8	329245	329252	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
630	NC_015865	AAAG	2	8	329279	329286	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
631	NC_015865	CTC	2	6	330455	330460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
632	NC_015865	GGT	2	6	330507	330512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
633	NC_015865	CCGG	2	8	330565	330572	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
634	NC_015865	AGC	2	6	330605	330610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_015865	AG	3	6	330639	330644	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
636	NC_015865	CTT	2	6	330818	330823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_015865	ATA	2	6	330829	330834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_015865	GTT	2	6	330862	330867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
639	NC_015865	GA	3	6	331917	331922	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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