MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermotoga thermarum DSM 5069 chromosome

Total Repeats: 4133

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015707	TAT	2	6	1	6	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015707	GTTT	2	8	21	28	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015707	ACCA	2	8	8226	8233	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015707	GGT	2	6	8312	8317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015707	CACC	2	8	8430	8437	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6	NC_015707	CCT	2	6	11439	11444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_015707	C	6	6	12085	12090	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8	NC_015707	A	6	6	12135	12140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015707	GTCA	2	8	12147	12154	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015707	ATAA	2	8	12212	12219	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015707	AGG	2	6	12303	12308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015707	AGG	2	6	14117	14122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015707	GGGC	2	8	14582	14589	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14	NC_015707	AGG	2	6	14618	14623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015707	CTT	2	6	16870	16875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015707	T	7	7	16874	16880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015707	TAA	2	6	17813	17818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015707	A	6	6	17830	17835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015707	TGAA	2	8	17886	17893	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015707	TCA	2	6	17907	17912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015707	A	6	6	17912	17917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015707	ATC	2	6	22028	22033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015707	TA	3	6	22065	22070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015707	GTT	2	6	22099	22104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015707	TAG	3	9	22105	22113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015707	ATATT	2	10	22161	22170	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015707	AGA	2	6	22183	22188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015707	GT	3	6	22191	22196	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015707	GC	3	6	22219	22224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015707	AGG	2	6	22238	22243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015707	T	6	6	22274	22279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015707	G	6	6	22318	22323	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015707	TTA	2	6	24422	24427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015707	CTTT	2	8	24465	24472	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_015707	T	6	6	24474	24479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015707	TA	3	6	24521	24526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015707	AGG	2	6	26396	26401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015707	ATC	2	6	26405	26410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015707	GTA	2	6	32531	32536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015707	AT	3	6	32537	32542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015707	ATT	2	6	37461	37466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015707	T	6	6	37476	37481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015707	T	6	6	41732	41737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015707	AATC	2	8	41782	41789	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_015707	CCTT	2	8	41800	41807	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_015707	A	7	7	41836	41842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015707	AGT	2	6	41855	41860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015707	AGA	2	6	41946	41951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015707	GAA	2	6	41983	41988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015707	CTTT	2	8	42025	42032	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_015707	A	7	7	42035	42041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015707	CTTG	2	8	42197	42204	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_015707	GAT	2	6	42206	42211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015707	ATGTGA	2	12	42232	42243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015707	A	6	6	42315	42320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015707	GTT	2	6	42330	42335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015707	TGA	2	6	42358	42363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015707	ACG	2	6	42421	42426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015707	TA	3	6	42593	42598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015707	CGAT	2	8	42715	42722	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_015707	CAG	2	6	42737	42742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015707	TGA	2	6	42745	42750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015707	AAC	2	6	42766	42771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015707	CTT	2	6	42801	42806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015707	GAT	2	6	42890	42895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015707	CGA	2	6	42896	42901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015707	AT	3	6	42925	42930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015707	GAA	2	6	42948	42953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015707	ACAA	2	8	48121	48128	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_015707	TTGA	2	8	48140	48147	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015707	AAGA	2	8	55089	55096	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015707	TTG	2	6	55127	55132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015707	ATT	2	6	55171	55176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015707	CTC	2	6	59890	59895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_015707	A	6	6	59896	59901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015707	CTTT	2	8	60141	60148	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_015707	ACC	2	6	60184	60189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_015707	AAC	2	6	62399	62404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015707	T	7	7	62483	62489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015707	TG	3	6	62502	62507	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015707	T	6	6	62566	62571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015707	T	6	6	62581	62586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015707	AG	3	6	62593	62598	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015707	A	6	6	62615	62620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015707	TAT	2	6	62621	62626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015707	AGG	2	6	62640	62645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015707	AGG	2	6	66492	66497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015707	TGAA	2	8	67336	67343	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015707	ATT	2	6	69755	69760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015707	A	6	6	69860	69865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015707	TC	3	6	70676	70681	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_015707	T	6	6	70690	70695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015707	ACC	2	6	71246	71251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_015707	TTCA	2	8	71285	71292	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_015707	AT	3	6	71313	71318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015707	TTA	2	6	72575	72580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015707	TACG	2	8	72589	72596	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_015707	ATC	2	6	72626	72631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015707	GGA	2	6	72644	72649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015707	TGT	2	6	72700	72705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015707	A	7	7	72774	72780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015707	GAA	2	6	72809	72814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015707	ATT	2	6	72917	72922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015707	TGGT	2	8	72930	72937	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015707	AC	3	6	73009	73014	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_015707	A	7	7	74562	74568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015707	TGAT	2	8	82701	82708	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015707	CCT	2	6	84262	84267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_015707	T	6	6	84274	84279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015707	A	7	7	84318	84324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015707	T	6	6	84334	84339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015707	AC	3	6	84581	84586	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_015707	TAT	2	6	84597	84602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015707	AGG	2	6	84626	84631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015707	AGG	2	6	86011	86016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015707	GCT	2	6	86017	86022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015707	TTCG	2	8	87789	87796	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_015707	CTT	2	6	87823	87828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015707	AGG	2	6	87842	87847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015707	AT	3	6	98318	98323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015707	ATTC	2	8	98361	98368	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_015707	TGT	2	6	98380	98385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015707	ATT	2	6	98387	98392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015707	TAA	2	6	98397	98402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015707	GGA	2	6	98468	98473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015707	TG	3	6	98505	98510	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015707	GTT	2	6	98522	98527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015707	A	6	6	101515	101520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015707	CCT	2	6	103322	103327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_015707	GGTT	2	8	103339	103346	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015707	TTTAT	2	10	103351	103360	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015707	AGAA	2	8	103457	103464	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015707	GAA	2	6	103590	103595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015707	AT	3	6	103614	103619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015707	TTC	2	6	103798	103803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015707	TTCCAT	2	12	103825	103836	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_015707	AAG	3	9	103851	103859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015707	CGA	2	6	103938	103943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015707	TGT	2	6	103950	103955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015707	TTC	2	6	104035	104040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_015707	ACTT	2	8	104058	104065	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_015707	AGTG	2	8	104109	104116	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015707	AAG	2	6	105490	105495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015707	AGG	2	6	105621	105626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015707	CT	3	6	105705	105710	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_015707	G	6	6	105752	105757	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015707	TTGG	2	8	105775	105782	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015707	GA	3	6	105902	105907	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_015707	GTT	2	6	106077	106082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_015707	AAC	2	6	170794	170799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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285	NC_015707	T	6	6	174096	174101	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_015707	AACTC	2	10	175138	175147	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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288	NC_015707	AC	3	6	175260	175265	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
289	NC_015707	A	6	6	175272	175277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_015707	GGA	2	6	175291	175296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
291	NC_015707	AAT	2	6	175309	175314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_015707	A	6	6	175329	175334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_015707	AGG	2	6	175372	175377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
294	NC_015707	GTT	2	6	189008	189013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
295	NC_015707	TCC	2	6	191690	191695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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297	NC_015707	AAC	2	6	191796	191801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
298	NC_015707	AGATT	2	10	191812	191821	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
299	NC_015707	A	6	6	193521	193526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_015707	ATA	2	6	195508	195513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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303	NC_015707	TTA	2	6	195617	195622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
304	NC_015707	TCA	2	6	195631	195636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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306	NC_015707	TGT	2	6	197486	197491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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312	NC_015707	A	7	7	207723	207729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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321	NC_015707	ATA	2	6	215424	215429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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324	NC_015707	CTT	2	6	216314	216319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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363	NC_015707	CCT	2	6	233294	233299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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429	NC_015707	TCT	2	6	254869	254874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
430	NC_015707	CTT	2	6	254890	254895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
431	NC_015707	TCC	2	6	254907	254912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
432	NC_015707	GAA	2	6	255006	255011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
433	NC_015707	GAT	2	6	255027	255032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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447	NC_015707	TCA	2	6	255457	255462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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450	NC_015707	T	6	6	259617	259622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_015707	AAT	2	6	259626	259631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_015707	G	6	6	259671	259676	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
453	NC_015707	T	7	7	262701	262707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_015707	ATC	2	6	265397	265402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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456	NC_015707	CCT	2	6	266142	266147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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458	NC_015707	TA	3	6	266213	266218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
459	NC_015707	CAA	2	6	266263	266268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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467	NC_015707	TTA	2	6	273012	273017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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469	NC_015707	T	6	6	273036	273041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
470	NC_015707	T	6	6	273055	273060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_015707	GTT	2	6	273151	273156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
472	NC_015707	A	6	6	273159	273164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
473	NC_015707	ACC	2	6	273172	273177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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489	NC_015707	AT	3	6	295747	295752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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