MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermotoga thermarum DSM 5069 chromosome

Total Repeats: 4133

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015707	CAAAT	2	10	570484	570493	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1002	NC_015707	TAA	2	6	570521	570526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_015707	CTTTTT	2	12	570542	570553	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1004	NC_015707	TCC	2	6	574456	574461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1005	NC_015707	CGC	2	6	574588	574593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1006	NC_015707	ACA	2	6	574646	574651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_015707	A	6	6	574667	574672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_015707	TTG	2	6	574682	574687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_015707	TCGAT	2	10	574702	574711	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1010	NC_015707	TCT	2	6	574713	574718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_015707	TCT	2	6	574744	574749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_015707	CTT	2	6	574766	574771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_015707	CAC	2	6	574790	574795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1014	NC_015707	CGAA	2	8	574880	574887	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1015	NC_015707	CCTG	2	8	574901	574908	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1016	NC_015707	TCA	2	6	575068	575073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_015707	TGG	2	6	575148	575153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_015707	GTG	2	6	575207	575212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_015707	T	6	6	575218	575223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_015707	T	6	6	582292	582297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_015707	AGG	2	6	583940	583945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_015707	CCT	2	6	584885	584890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1023	NC_015707	GAT	2	6	585653	585658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_015707	AGGG	2	8	586881	586888	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_015707	CCT	2	6	587906	587911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1026	NC_015707	TAC	2	6	587936	587941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_015707	A	6	6	587976	587981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_015707	ATA	2	6	594731	594736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_015707	AG	3	6	594752	594757	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_015707	AGGG	2	8	598786	598793	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_015707	GCC	2	6	605066	605071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1032	NC_015707	T	6	6	605117	605122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_015707	C	6	6	608373	608378	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1034	NC_015707	CCG	2	6	608380	608385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1035	NC_015707	CCT	2	6	612486	612491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1036	NC_015707	CAC	2	6	615668	615673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1037	NC_015707	A	7	7	617885	617891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_015707	ACAA	2	8	622560	622567	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1039	NC_015707	AGG	2	6	622568	622573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_015707	AGG	2	6	624517	624522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_015707	ATGG	2	8	625862	625869	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_015707	CTT	2	6	625876	625881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_015707	CCA	2	6	625911	625916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_015707	GAATG	2	10	625944	625953	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_015707	TGG	2	6	625982	625987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_015707	ACTC	2	8	626003	626010	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1047	NC_015707	GAT	2	6	626076	626081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_015707	CGA	2	6	626117	626122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_015707	T	6	6	626250	626255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_015707	CTTT	2	8	626260	626267	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1051	NC_015707	AC	3	6	626275	626280	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1052	NC_015707	GAA	2	6	626383	626388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_015707	AGA	2	6	626478	626483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_015707	TTC	2	6	626497	626502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_015707	TGA	2	6	626507	626512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_015707	TGT	2	6	626597	626602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_015707	GTT	2	6	626622	626627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_015707	A	6	6	626817	626822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_015707	AGC	2	6	627065	627070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_015707	TTG	2	6	627126	627131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_015707	TGA	2	6	627199	627204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_015707	AAG	2	6	627232	627237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_015707	GA	3	6	627338	627343	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_015707	TAT	2	6	627405	627410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_015707	GGC	2	6	627471	627476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_015707	AGA	2	6	627509	627514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_015707	GAT	2	6	627540	627545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_015707	GATA	2	8	627603	627610	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_015707	TCTT	2	8	627656	627663	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1070	NC_015707	ACA	2	6	627669	627674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_015707	GAT	2	6	627711	627716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_015707	TTC	2	6	627723	627728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_015707	CTC	2	6	627758	627763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1074	NC_015707	TTG	2	6	627803	627808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_015707	CAA	2	6	627846	627851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1077	NC_015707	GCT	2	6	627931	627936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_015707	ATA	2	6	627946	627951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_015707	TGT	2	6	627954	627959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_015707	TGA	2	6	628025	628030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_015707	G	6	6	629957	629962	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_015707	A	6	6	634312	634317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_015707	AGG	2	6	639866	639871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1085	NC_015707	T	6	6	643171	643176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_015707	TGA	2	6	643194	643199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_015707	AT	3	6	643907	643912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_015707	AGG	2	6	643951	643956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_015707	AGG	2	6	645150	645155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_015707	TG	3	6	652096	652101	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_015707	TTGC	2	8	652126	652133	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1092	NC_015707	CCT	2	6	652226	652231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1093	NC_015707	A	7	7	652235	652241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_015707	CAAA	2	8	652249	652256	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1095	NC_015707	GAA	2	6	652267	652272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_015707	CTTGCT	2	12	652273	652284	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_015707	AGC	2	6	652297	652302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_015707	CGC	2	6	652512	652517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1099	NC_015707	CCA	2	6	652520	652525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1100	NC_015707	AT	3	6	661238	661243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_015707	CAAA	2	8	661268	661275	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1102	NC_015707	T	7	7	661310	661316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_015707	GAT	2	6	663376	663381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_015707	CCG	2	6	663396	663401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1105	NC_015707	ATTG	2	8	663409	663416	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_015707	AGG	2	6	664891	664896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_015707	CCT	2	6	664903	664908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1108	NC_015707	TGG	2	6	664911	664916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_015707	AAAG	2	8	666154	666161	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_015707	GGTT	2	8	666165	666172	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_015707	AT	3	6	666256	666261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_015707	AAG	2	6	666716	666721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_015707	TGT	2	6	666729	666734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_015707	AGG	2	6	666757	666762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_015707	TTTCA	2	10	668280	668289	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1116	NC_015707	AGG	2	6	669895	669900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_015707	ATT	2	6	670698	670703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_015707	ACA	2	6	670719	670724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_015707	TTA	2	6	670738	670743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_015707	TCC	2	6	670764	670769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1121	NC_015707	AT	3	6	670819	670824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_015707	CAA	2	6	672478	672483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_015707	TAA	2	6	672562	672567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_015707	TTCC	2	8	672573	672580	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1125	NC_015707	AGG	2	6	672642	672647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_015707	ATT	2	6	672649	672654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_015707	CCT	2	6	674933	674938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1128	NC_015707	TAT	2	6	674944	674949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_015707	T	6	6	674982	674987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_015707	AAT	2	6	678973	678978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_015707	CAATT	2	10	679009	679018	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1132	NC_015707	AAT	2	6	679025	679030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_015707	AAAT	2	8	680270	680277	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_015707	ATT	2	6	680304	680309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_015707	TAT	2	6	680387	680392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1137	NC_015707	AAC	2	6	680416	680421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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