MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermotoga thermarum DSM 5069 chromosome

Total Repeats: 4133

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015707	CTAA	2	8	301954	301961	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
502	NC_015707	GTGTG	2	10	301985	301994	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
503	NC_015707	T	6	6	301996	302001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_015707	TTC	2	6	302004	302009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_015707	TTC	3	9	302013	302021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_015707	GAA	2	6	302042	302047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_015707	A	6	6	302083	302088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_015707	GTA	2	6	302123	302128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_015707	AC	3	6	302140	302145	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
510	NC_015707	TTTC	2	8	302288	302295	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
511	NC_015707	TTAAG	2	10	302330	302339	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
512	NC_015707	AAC	3	9	302367	302375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_015707	GAA	2	6	302392	302397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_015707	T	6	6	302407	302412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_015707	CAA	2	6	302420	302425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_015707	CTT	2	6	302426	302431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_015707	CAAC	2	8	302441	302448	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
518	NC_015707	T	6	6	302455	302460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_015707	CGC	2	6	302497	302502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
520	NC_015707	T	6	6	302587	302592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_015707	CTAA	2	8	302670	302677	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
522	NC_015707	TTA	2	6	302761	302766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_015707	A	6	6	302797	302802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_015707	TGA	2	6	302837	302842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_015707	TCT	2	6	302847	302852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_015707	T	7	7	302852	302858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_015707	T	7	7	302860	302866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_015707	AAC	2	6	302883	302888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_015707	TAA	2	6	302931	302936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_015707	TTG	2	6	304257	304262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_015707	TAA	2	6	304341	304346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_015707	AAG	2	6	304361	304366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_015707	TCAA	2	8	304500	304507	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
534	NC_015707	GAA	2	6	304611	304616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_015707	TAT	2	6	304670	304675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_015707	T	6	6	304691	304696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_015707	T	6	6	304839	304844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_015707	CCTTC	2	10	304859	304868	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
539	NC_015707	TCA	2	6	304897	304902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_015707	AAG	2	6	304903	304908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_015707	CGA	2	6	304930	304935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_015707	CATC	2	8	305086	305093	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
543	NC_015707	TCT	2	6	305104	305109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_015707	ATG	2	6	305113	305118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_015707	TAT	2	6	305231	305236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_015707	ATG	2	6	305256	305261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_015707	TCA	2	6	305329	305334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_015707	TTTA	2	8	305351	305358	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_015707	CTT	2	6	305470	305475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_015707	AAC	2	6	305553	305558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_015707	GAA	2	6	305579	305584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_015707	GCCA	2	8	305591	305598	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
553	NC_015707	GGAT	2	8	305693	305700	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
554	NC_015707	AAC	2	6	305732	305737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_015707	CTT	2	6	305751	305756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_015707	GTT	2	6	305799	305804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_015707	CAT	2	6	305846	305851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_015707	GTT	2	6	305859	305864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_015707	CAA	2	6	305953	305958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_015707	AGT	2	6	306056	306061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_015707	ATT	2	6	306073	306078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_015707	C	6	6	308199	308204	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
563	NC_015707	TTA	2	6	308960	308965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_015707	ATC	2	6	308998	309003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_015707	GAA	2	6	309013	309018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_015707	A	7	7	309022	309028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_015707	GCC	2	6	309038	309043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
568	NC_015707	CTC	2	6	309069	309074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_015707	TAG	2	6	309085	309090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_015707	TCT	2	6	309094	309099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_015707	AACC	2	8	309121	309128	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
572	NC_015707	TCT	2	6	309141	309146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_015707	CCA	2	6	309289	309294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_015707	AGGTGT	2	12	309300	309311	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
575	NC_015707	ATA	2	6	309369	309374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_015707	TG	3	6	309389	309394	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
577	NC_015707	TAT	2	6	309420	309425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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579	NC_015707	TTC	2	6	309598	309603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_015707	TCA	2	6	309736	309741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_015707	ACA	2	6	309858	309863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_015707	AGG	2	6	309914	309919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
583	NC_015707	AT	3	6	309954	309959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_015707	ATG	2	6	310005	310010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_015707	GGAT	2	8	310046	310053	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
586	NC_015707	AAGC	2	8	310058	310065	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
587	NC_015707	CCT	2	6	311155	311160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_015707	A	6	6	311192	311197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_015707	TAG	2	6	311286	311291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_015707	TA	3	6	311292	311297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_015707	GGA	2	6	314782	314787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
592	NC_015707	A	7	7	325436	325442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_015707	GCATA	2	10	325452	325461	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
594	NC_015707	AAC	2	6	325496	325501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_015707	AGG	2	6	325542	325547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
596	NC_015707	TTCC	2	8	327942	327949	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
597	NC_015707	GTTTT	2	10	327958	327967	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
598	NC_015707	AAG	2	6	327971	327976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_015707	T	6	6	327998	328003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_015707	ACT	2	6	328017	328022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_015707	AAT	2	6	328030	328035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_015707	A	6	6	328060	328065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_015707	GGT	2	6	328074	328079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
604	NC_015707	G	6	6	328753	328758	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
605	NC_015707	TCT	2	6	333569	333574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_015707	TTGG	2	8	333582	333589	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
607	NC_015707	A	7	7	333590	333596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_015707	CG	3	6	333817	333822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
609	NC_015707	CG	3	6	333831	333836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
610	NC_015707	TTTTA	2	10	333839	333848	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_015707	T	6	6	333856	333861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_015707	G	6	6	337932	337937	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
613	NC_015707	AAT	2	6	337954	337959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_015707	ATG	2	6	340743	340748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_015707	CCT	2	6	343178	343183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_015707	T	7	7	343187	343193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_015707	AT	3	6	343198	343203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_015707	CAT	2	6	346500	346505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_015707	T	6	6	346524	346529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_015707	T	6	6	346540	346545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_015707	CTA	2	6	346555	346560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_015707	ATA	2	6	346571	346576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_015707	AAT	2	6	346598	346603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_015707	CGG	2	6	346634	346639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_015707	TTA	2	6	346640	346645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_015707	TAA	2	6	346673	346678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_015707	AACC	2	8	348718	348725	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
628	NC_015707	GCG	2	6	348736	348741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_015707	T	6	6	348754	348759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_015707	TAT	2	6	348770	348775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_015707	GTTT	2	8	348794	348801	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
632	NC_015707	CAC	2	6	348807	348812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
633	NC_015707	AACG	2	8	348813	348820	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
634	NC_015707	ACCA	2	8	348823	348830	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
635	NC_015707	GTTG	2	8	348832	348839	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
636	NC_015707	TA	3	6	348862	348867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_015707	A	6	6	348880	348885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_015707	T	6	6	348920	348925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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640	NC_015707	A	6	6	348969	348974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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