MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermodesulfatator indicus DSM 15286 chromosome

Total Repeats: 5363

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015681	CAAA	2	8	43	50	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015681	A	6	6	73	78	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015681	AAT	2	6	88	93	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015681	T	8	8	130	137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015681	T	6	6	158	163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015681	TTC	2	6	238	243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015681	G	6	6	246	251	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015681	TA	3	6	2954	2959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015681	AAG	2	6	7389	7394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015681	CTC	2	6	9127	9132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_015681	ATT	2	6	9140	9145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015681	T	7	7	9144	9150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015681	TAC	2	6	9154	9159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015681	AAAC	2	8	9162	9169	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015681	TGG	2	6	9269	9274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015681	CGA	2	6	9316	9321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015681	GAG	2	6	9344	9349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015681	CGA	2	6	9361	9366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015681	CAG	2	6	9431	9436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015681	T	6	6	9489	9494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015681	ATT	2	6	9522	9527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015681	A	6	6	9536	9541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015681	ATA	2	6	9567	9572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015681	AGG	2	6	9634	9639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015681	ATT	2	6	9876	9881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015681	AGG	2	6	11735	11740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015681	GCTA	2	8	15641	15648	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015681	TAT	2	6	17758	17763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015681	A	6	6	20194	20199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015681	A	7	7	20201	20207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015681	GAA	2	6	20255	20260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015681	TTA	2	6	20263	20268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015681	T	6	6	21369	21374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015681	T	6	6	21384	21389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015681	AAG	2	6	21399	21404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015681	A	6	6	21419	21424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015681	A	6	6	21507	21512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015681	AGG	2	6	21516	21521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015681	GAAA	2	8	22421	22428	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015681	A	6	6	22434	22439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015681	T	6	6	25850	25855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015681	TCC	2	6	28340	28345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_015681	TAAA	2	8	28347	28354	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015681	ATT	2	6	28366	28371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015681	TCT	2	6	28383	28388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015681	TATC	2	8	28389	28396	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_015681	TTAAA	2	10	28452	28461	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015681	AAT	2	6	28462	28467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015681	ATA	2	6	28800	28805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015681	CAT	2	6	28954	28959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015681	GAC	2	6	29002	29007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015681	CAT	2	6	29032	29037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015681	TGG	2	6	29046	29051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015681	T	6	6	29126	29131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015681	GCT	2	6	29220	29225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015681	ATC	2	6	29246	29251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015681	AT	3	6	29262	29267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015681	TAG	2	6	29278	29283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015681	AGAA	2	8	29330	29337	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015681	ATA	2	6	29355	29360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015681	T	6	6	29371	29376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015681	T	7	7	29389	29395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015681	TCT	2	6	29476	29481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015681	CCA	2	6	29484	29489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_015681	A	6	6	29591	29596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015681	A	6	6	29604	29609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015681	A	6	6	29735	29740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015681	CTT	3	9	29767	29775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015681	TA	3	6	29787	29792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015681	TGTCT	2	10	29815	29824	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_015681	T	7	7	29875	29881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015681	ATT	2	6	29914	29919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015681	CTT	2	6	30003	30008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015681	TC	3	6	30018	30023	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_015681	ATA	2	6	30050	30055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015681	T	6	6	30063	30068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015681	T	7	7	30199	30205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015681	TAAT	2	8	30217	30224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015681	TTA	2	6	30232	30237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015681	ACTT	2	8	33382	33389	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015681	ATT	2	6	33390	33395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015681	CCT	3	9	35211	35219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_015681	TGG	2	6	36384	36389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015681	AT	3	6	36464	36469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015681	ATCCTC	2	12	36486	36497	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_015681	C	6	6	38213	38218	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
87	NC_015681	A	7	7	42323	42329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015681	TCCC	2	8	42540	42547	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
89	NC_015681	A	6	6	42564	42569	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015681	ACC	2	6	42577	42582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_015681	CAA	2	6	42597	42602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015681	CAA	2	6	42620	42625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015681	TAA	2	6	42634	42639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015681	T	6	6	42644	42649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015681	AAAGG	2	10	43698	43707	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015681	CAG	2	6	43744	43749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015681	CAA	2	6	43769	43774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015681	T	6	6	43801	43806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015681	GTT	2	6	43821	43826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015681	AAAT	2	8	45734	45741	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015681	T	7	7	45748	45754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015681	T	6	6	45756	45761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015681	TCT	2	6	45767	45772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015681	TC	3	6	45774	45779	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_015681	A	6	6	45868	45873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015681	AGG	2	6	45877	45882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015681	ACTT	2	8	46754	46761	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_015681	GAAA	2	8	46789	46796	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015681	A	6	6	46810	46815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015681	AAT	2	6	48852	48857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015681	T	6	6	51622	51627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015681	A	6	6	51628	51633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015681	TAA	2	6	51637	51642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015681	CAA	2	6	51655	51660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015681	TTAAAA	2	12	51693	51704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015681	T	6	6	55106	55111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015681	TTATCT	2	12	55123	55134	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_015681	CTCC	2	8	58041	58048	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
119	NC_015681	CCT	2	6	59137	59142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_015681	T	7	7	59198	59204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015681	CCT	2	6	60803	60808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_015681	TTG	2	6	60811	60816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015681	CCT	2	6	63632	63637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_015681	TTTTG	2	10	63638	63647	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015681	ATT	2	6	64601	64606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015681	ATC	2	6	65627	65632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015681	AGG	2	6	65799	65804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015681	GGC	2	6	67653	67658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_015681	GCC	2	6	67670	67675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_015681	C	6	6	69202	69207	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
131	NC_015681	C	6	6	69870	69875	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
132	NC_015681	A	8	8	69937	69944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015681	AAAT	2	8	69973	69980	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015681	GA	3	6	69984	69989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015681	ATT	2	6	70062	70067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015681	T	6	6	70102	70107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015681	CAA	2	6	70745	70750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_015681	CCT	2	6	74003	74008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_015681	A	6	6	74033	74038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015681	TAT	2	6	74358	74363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015681	CCA	2	6	76449	76454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_015681	TAG	2	6	79017	79022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015681	T	6	6	80860	80865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015681	T	7	7	80874	80880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015681	ATA	2	6	80945	80950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015681	T	6	6	80954	80959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015681	AT	3	6	80977	80982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015681	TTG	2	6	81632	81637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015681	AGT	2	6	81670	81675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015681	TTCA	2	8	81696	81703	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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175	NC_015681	TAA	2	6	95332	95337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_015681	AGG	2	6	95614	95619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_015681	CTC	2	6	149829	149834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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291	NC_015681	A	6	6	151426	151431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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293	NC_015681	ATA	2	6	154359	154364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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296	NC_015681	ATC	2	6	154514	154519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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423	NC_015681	AAT	2	6	219056	219061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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427	NC_015681	A	6	6	219127	219132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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432	NC_015681	GTA	2	6	229070	229075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
433	NC_015681	ACTT	2	8	229082	229089	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
434	NC_015681	CAAA	2	8	229104	229111	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
435	NC_015681	A	6	6	229169	229174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
436	NC_015681	TCCTGA	2	12	229300	229311	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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439	NC_015681	TAG	2	6	229427	229432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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446	NC_015681	TAG	2	6	230333	230338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
447	NC_015681	T	7	7	230360	230366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
448	NC_015681	TCT	2	6	236580	236585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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452	NC_015681	A	6	6	236694	236699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_015681	T	6	6	236719	236724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_015681	CG	3	6	236739	236744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
455	NC_015681	A	6	6	236822	236827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
456	NC_015681	AT	3	6	236861	236866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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466	NC_015681	CTAA	2	8	238481	238488	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
467	NC_015681	CTG	2	6	238520	238525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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473	NC_015681	CTAA	2	8	238682	238689	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
474	NC_015681	AAG	2	6	238731	238736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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