MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thioalkalimicrobium cyclicum ALM1 chromosome

Total Repeats: 2569

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015581	GAT	2	6	80	85	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015581	TAA	2	6	4317	4322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015581	T	8	8	4341	4348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015581	CGAC	2	8	4364	4371	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015581	AAT	2	6	4420	4425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015581	CTT	2	6	6304	6309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015581	TAT	2	6	6385	6390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015581	AAGCC	2	10	6447	6456	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_015581	TTAT	2	8	8235	8242	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015581	TAC	2	6	8244	8249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015581	T	7	7	8283	8289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015581	T	6	6	8305	8310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015581	GA	3	6	9560	9565	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015581	GCC	2	6	10068	10073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_015581	CTC	2	6	10307	10312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_015581	ATG	2	6	10340	10345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015581	TCT	2	6	12784	12789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015581	TGA	2	6	12830	12835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015581	TTA	2	6	12887	12892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015581	A	7	7	13079	13085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015581	GA	3	6	13122	13127	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015581	CCA	2	6	13182	13187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_015581	ATT	2	6	13223	13228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015581	GTG	2	6	13239	13244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015581	AC	3	6	13269	13274	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015581	TAT	2	6	13332	13337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015581	A	7	7	13372	13378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015581	AAC	2	6	13437	13442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015581	CAT	2	6	13457	13462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015581	ATA	2	6	13513	13518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015581	G	6	6	13554	13559	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015581	A	8	8	14888	14895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015581	T	6	6	14945	14950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015581	TA	3	6	15088	15093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015581	ATT	2	6	19318	19323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015581	A	8	8	22411	22418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015581	TAT	2	6	22433	22438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015581	A	6	6	22457	22462	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015581	A	6	6	22509	22514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015581	TAA	2	6	22845	22850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015581	TAAT	2	8	22940	22947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015581	GTC	2	6	24311	24316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015581	CGTT	2	8	27374	27381	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_015581	GCG	2	6	27386	27391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015581	TGCA	2	8	28757	28764	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_015581	ATT	2	6	28897	28902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015581	ACC	2	6	29455	29460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_015581	TTTAA	2	10	31152	31161	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015581	TTTC	2	8	31177	31184	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_015581	AAT	2	6	31222	31227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015581	ATG	2	6	31237	31242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015581	T	10	10	31255	31264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015581	TAA	2	6	31284	31289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015581	A	7	7	34097	34103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015581	TGGCT	2	10	34123	34132	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_015581	TTG	2	6	34190	34195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015581	AAT	2	6	35233	35238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015581	GCCA	2	8	41362	41369	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_015581	TAA	2	6	41390	41395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015581	GTT	2	6	41405	41410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015581	ATG	2	6	42512	42517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015581	GTTTG	2	10	42521	42530	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015581	AAT	2	6	42544	42549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015581	TAAT	3	12	42555	42566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015581	GTA	2	6	42624	42629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015581	TAA	2	6	45810	45815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015581	AAT	2	6	45822	45827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015581	AAC	2	6	48277	48282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015581	TGA	2	6	51610	51615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015581	AAAT	2	8	51634	51641	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015581	GATG	2	8	51654	51661	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015581	A	6	6	51689	51694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015581	TA	3	6	51697	51702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015581	GCAAA	2	10	51741	51750	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_015581	TAT	2	6	51757	51762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015581	T	6	6	51813	51818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015581	GTT	2	6	51820	51825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015581	AATAAC	2	12	51858	51869	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_015581	GTT	2	6	51885	51890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015581	CT	3	6	54416	54421	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_015581	GCCC	2	8	54431	54438	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
82	NC_015581	CTTTT	2	10	54450	54459	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_015581	TAA	2	6	54478	54483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015581	AAC	2	6	54492	54497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015581	AAT	2	6	54506	54511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015581	TTA	2	6	55507	55512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015581	TAT	2	6	55575	55580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015581	GTT	2	6	59528	59533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015581	GATTC	2	10	61091	61100	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_015581	AGA	2	6	61106	61111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015581	AGA	2	6	61129	61134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015581	A	6	6	61177	61182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015581	TAA	2	6	64327	64332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015581	AAAT	2	8	67476	67483	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015581	TGT	2	6	68959	68964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015581	T	6	6	68994	68999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015581	GCA	2	6	70764	70769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015581	GT	3	6	70780	70785	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015581	AAG	2	6	72736	72741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015581	T	8	8	73238	73245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015581	A	7	7	73981	73987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015581	ATAG	2	8	74892	74899	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015581	ATA	2	6	74911	74916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015581	AAT	2	6	81218	81223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015581	A	6	6	81237	81242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015581	AACC	2	8	81838	81845	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_015581	CGC	2	6	83005	83010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_015581	GC	3	6	83040	83045	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_015581	GCCTA	2	10	84326	84335	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
110	NC_015581	ACA	2	6	84379	84384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015581	A	6	6	85042	85047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015581	TAA	2	6	85457	85462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015581	TTA	2	6	85484	85489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015581	TGC	2	6	85536	85541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015581	GAA	2	6	93133	93138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015581	TAAC	2	8	93159	93166	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_015581	T	7	7	93251	93257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015581	TGTT	2	8	95302	95309	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015581	A	6	6	95314	95319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015581	CTG	2	6	97592	97597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015581	CAA	2	6	97617	97622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015581	TGT	2	6	97627	97632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015581	AAGTT	2	10	99260	99269	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015581	T	6	6	99273	99278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015581	A	7	7	99284	99290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015581	TGC	2	6	100402	100407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015581	T	6	6	100434	100439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015581	A	7	7	100487	100493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015581	CAA	2	6	100543	100548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015581	TCA	3	9	100561	100569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_015581	CCCCG	2	10	101744	101753	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
132	NC_015581	T	6	6	101760	101765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015581	CAAA	2	8	101772	101779	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_015581	ACA	2	6	101786	101791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_015581	CAA	2	6	101824	101829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015581	TAT	2	6	102861	102866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015581	ATT	2	6	102880	102885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015581	T	6	6	105139	105144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015581	ATT	2	6	105145	105150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015581	GGTTA	2	10	110548	110557	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015581	AG	3	6	110574	110579	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015581	TAA	2	6	111090	111095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015581	TGA	2	6	113841	113846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015581	ATT	2	6	113864	113869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015581	TTG	2	6	113889	113894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015581	GT	3	6	113899	113904	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015581	CTG	2	6	113974	113979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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288	NC_015581	GC	3	6	252438	252443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
289	NC_015581	A	6	6	252444	252449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_015581	AATA	2	8	252525	252532	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_015581	GGT	2	6	253891	253896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
292	NC_015581	CTG	2	6	253921	253926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
293	NC_015581	TGT	2	6	255534	255539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
294	NC_015581	TAA	2	6	255549	255554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_015581	ATG	2	6	256831	256836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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297	NC_015581	TAA	2	6	260567	260572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
298	NC_015581	A	6	6	260584	260589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
299	NC_015581	A	7	7	260594	260600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_015581	A	6	6	260605	260610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
301	NC_015581	AAG	2	6	260667	260672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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303	NC_015581	AAAT	2	8	260708	260715	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
304	NC_015581	ATA	2	6	260742	260747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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308	NC_015581	CTG	2	6	261038	261043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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310	NC_015581	ACGT	2	8	261108	261115	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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316	NC_015581	GAG	2	6	261392	261397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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322	NC_015581	TAG	2	6	261800	261805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
323	NC_015581	GAA	2	6	261922	261927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
324	NC_015581	AGAT	2	8	261963	261970	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
325	NC_015581	TGC	2	6	261998	262003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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333	NC_015581	GGT	2	6	262218	262223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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335	NC_015581	AC	3	6	262342	262347	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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406	NC_015581	ATA	2	6	270130	270135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
407	NC_015581	AAT	2	6	270145	270150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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416	NC_015581	CCG	2	6	270944	270949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
417	NC_015581	TAT	2	6	272072	272077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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421	NC_015581	AAT	2	6	276926	276931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
422	NC_015581	CAA	2	6	276941	276946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
423	NC_015581	CTG	2	6	277470	277475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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