MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thioalkalimicrobium cyclicum ALM1 chromosome

Total Repeats: 2569

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015581	AGTT	2	8	745885	745892	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_015581	TAA	2	6	745896	745901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_015581	GGA	2	6	746112	746117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_015581	GCG	2	6	746146	746151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_015581	CGA	2	6	746210	746215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_015581	G	6	6	746298	746303	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_015581	ACC	2	6	746304	746309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1008	NC_015581	CT	3	6	746325	746330	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_015581	ACCG	2	8	746331	746338	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1010	NC_015581	AGG	2	6	746380	746385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_015581	GTAC	2	8	746411	746418	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1012	NC_015581	AGT	2	6	746454	746459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_015581	AGCGA	2	10	746493	746502	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1014	NC_015581	A	7	7	746511	746517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_015581	TG	3	6	746582	746587	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_015581	TAG	2	6	746643	746648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_015581	AGC	2	6	746885	746890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_015581	CAA	2	6	746911	746916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_015581	GACA	2	8	746931	746938	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1020	NC_015581	AAC	2	6	746969	746974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_015581	AGG	2	6	747042	747047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_015581	AGC	2	6	747058	747063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_015581	AAAG	2	8	747072	747079	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_015581	CGT	2	6	747176	747181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_015581	TGA	2	6	747500	747505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_015581	TCT	2	6	747551	747556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_015581	GA	3	6	747627	747632	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_015581	TGAAGG	2	12	747690	747701	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_015581	TTA	2	6	747753	747758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_015581	CGG	2	6	747879	747884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_015581	ACC	2	6	748150	748155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1032	NC_015581	TGG	2	6	748211	748216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_015581	TCC	2	6	748237	748242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1034	NC_015581	GGA	2	6	748254	748259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_015581	GACA	2	8	748331	748338	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1036	NC_015581	GGT	2	6	748374	748379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_015581	TG	3	6	748382	748387	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_015581	CGG	2	6	748461	748466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_015581	TCA	2	6	748489	748494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_015581	CGT	2	6	748569	748574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_015581	G	6	6	748618	748623	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_015581	CTG	2	6	748690	748695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_015581	TCT	2	6	748779	748784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_015581	TG	3	6	748838	748843	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_015581	TG	3	6	748906	748911	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_015581	ACC	2	6	749046	749051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1047	NC_015581	T	9	9	749168	749176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_015581	GTT	2	6	753226	753231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_015581	TAAA	2	8	753242	753249	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_015581	TAG	2	6	753257	753262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_015581	GTT	2	6	753360	753365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_015581	T	7	7	753364	753370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_015581	A	6	6	753381	753386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_015581	AAT	2	6	753400	753405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_015581	AGG	2	6	753416	753421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_015581	T	7	7	753424	753430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_015581	AAC	2	6	753448	753453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_015581	AAG	2	6	753987	753992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_015581	GA	3	6	754025	754030	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_015581	T	6	6	755778	755783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_015581	TAT	2	6	756428	756433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_015581	A	7	7	756440	756446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_015581	TAA	2	6	756568	756573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_015581	TTTG	2	8	759125	759132	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_015581	CTTT	2	8	759755	759762	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1066	NC_015581	TAA	2	6	760479	760484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_015581	GCG	2	6	760511	760516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_015581	TAG	2	6	760538	760543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_015581	T	7	7	762643	762649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_015581	T	6	6	762655	762660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_015581	ACG	2	6	764721	764726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_015581	T	6	6	764745	764750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_015581	CCA	2	6	764782	764787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1074	NC_015581	GAT	2	6	764794	764799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_015581	GTG	2	6	767241	767246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_015581	GAGCA	2	10	772116	772125	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1077	NC_015581	CATGCT	2	12	775889	775900	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_015581	GAA	2	6	775913	775918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_015581	TGG	2	6	775935	775940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_015581	GTT	2	6	775953	775958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_015581	T	7	7	777935	777941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_015581	CCT	2	6	777965	777970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1083	NC_015581	T	7	7	777980	777986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_015581	GATG	2	8	780243	780250	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_015581	AT	3	6	781326	781331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_015581	T	6	6	781419	781424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_015581	AGA	2	6	781449	781454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_015581	CA	3	6	782300	782305	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1089	NC_015581	AAT	2	6	789787	789792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_015581	TAAGAA	2	12	792732	792743	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_015581	GTAAC	2	10	794295	794304	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1092	NC_015581	TAA	2	6	795791	795796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_015581	T	6	6	796359	796364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_015581	AAATAT	2	12	796418	796429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_015581	AGT	2	6	796430	796435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_015581	TA	3	6	796452	796457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_015581	TTTAT	2	10	797826	797835	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_015581	ATA	2	6	798375	798380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_015581	TAAT	2	8	798393	798400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_015581	TGCT	2	8	800548	800555	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1101	NC_015581	TG	4	8	801427	801434	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_015581	T	7	7	801439	801445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_015581	A	6	6	801488	801493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_015581	ACAAA	2	10	801496	801505	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1105	NC_015581	TAAA	2	8	801510	801517	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_015581	TGC	2	6	802009	802014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_015581	GTT	2	6	802017	802022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_015581	ACC	2	6	802060	802065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1109	NC_015581	CCA	2	6	802071	802076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_015581	GGT	2	6	802083	802088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_015581	CAC	2	6	802217	802222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1112	NC_015581	CAA	2	6	802272	802277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_015581	ATT	2	6	802288	802293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_015581	TGA	2	6	802378	802383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_015581	TTGGT	2	10	802392	802401	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_015581	GTT	2	6	802412	802417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_015581	TTG	2	6	802462	802467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_015581	TTTA	2	8	802514	802521	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_015581	TCCC	2	8	803870	803877	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1120	NC_015581	TTG	2	6	803880	803885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_015581	T	8	8	803943	803950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_015581	GTT	2	6	804005	804010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_015581	GAAG	2	8	804022	804029	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_015581	CACC	2	8	808499	808506	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1125	NC_015581	TCCGC	2	10	808579	808588	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1126	NC_015581	T	6	6	808614	808619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_015581	ACG	2	6	808626	808631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_015581	CACC	2	8	808756	808763	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1129	NC_015581	TCCGC	2	10	808836	808845	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1130	NC_015581	T	7	7	808884	808890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_015581	A	7	7	811565	811571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_015581	TGA	2	6	811572	811577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_015581	TA	3	6	811592	811597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_015581	ATTT	2	8	811602	811609	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_015581	GC	3	6	811626	811631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1136	NC_015581	A	6	6	814292	814297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1411	NC_015581	CAA	2	6	1059001	1059006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1412	NC_015581	TGG	2	6	1059081	1059086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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