MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Treponema primitia ZAS-2 chromosome

Total Repeats: 8889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015578	CTA	2	6	220132	220137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_015578	GTA	2	6	220149	220154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_015578	GGCA	2	8	220212	220219	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
504	NC_015578	G	8	8	220260	220267	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
505	NC_015578	TGG	2	6	220322	220327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
506	NC_015578	CAT	2	6	220409	220414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_015578	T	6	6	220420	220425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_015578	GCAG	2	8	220639	220646	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
509	NC_015578	AGG	2	6	220675	220680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
510	NC_015578	AGC	2	6	220691	220696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_015578	A	6	6	220702	220707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_015578	G	6	6	220733	220738	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
513	NC_015578	AAT	2	6	221533	221538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_015578	ATA	2	6	221633	221638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_015578	TAA	2	6	222823	222828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_015578	TCC	2	6	222882	222887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_015578	CCT	2	6	222892	222897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_015578	CTG	2	6	222926	222931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_015578	A	6	6	222973	222978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_015578	TGAAGC	2	12	222979	222990	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
521	NC_015578	GAG	2	6	222992	222997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
522	NC_015578	GA	3	6	223073	223078	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
523	NC_015578	TA	3	6	223091	223096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_015578	A	6	6	223113	223118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_015578	GCA	2	6	223348	223353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_015578	T	6	6	223523	223528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_015578	A	6	6	223532	223537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_015578	AG	3	6	225376	225381	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
529	NC_015578	T	6	6	225386	225391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_015578	CTT	2	6	225478	225483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_015578	TTA	2	6	225488	225493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_015578	ATA	2	6	226494	226499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_015578	AG	3	6	228896	228901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
534	NC_015578	T	6	6	244549	244554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_015578	TAT	2	6	247182	247187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_015578	TAT	2	6	247225	247230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_015578	AGG	2	6	247254	247259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
538	NC_015578	GCG	2	6	248970	248975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_015578	GCC	2	6	250408	250413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_015578	T	6	6	250470	250475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_015578	GGT	2	6	250580	250585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
542	NC_015578	GTCGC	2	10	250603	250612	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
543	NC_015578	G	7	7	250679	250685	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
544	NC_015578	CCGA	2	8	250704	250711	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
545	NC_015578	GGA	2	6	250715	250720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
546	NC_015578	GGC	2	6	250724	250729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_015578	GCC	2	6	250735	250740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_015578	GTT	2	6	253384	253389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_015578	TCTA	2	8	253526	253533	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
550	NC_015578	A	8	8	253793	253800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_015578	G	6	6	253885	253890	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
552	NC_015578	A	7	7	254501	254507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_015578	ATT	2	6	255454	255459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_015578	ATA	2	6	255469	255474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_015578	A	7	7	255489	255495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_015578	TTTA	2	8	255523	255530	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_015578	AT	3	6	255545	255550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_015578	AAT	2	6	255599	255604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_015578	GGGA	2	8	255676	255683	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
560	NC_015578	ATAA	2	8	255744	255751	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_015578	AGA	2	6	255767	255772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_015578	TTC	2	6	255804	255809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_015578	TAT	2	6	255815	255820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_015578	ATA	2	6	255860	255865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_015578	TGGG	2	8	255870	255877	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
566	NC_015578	AT	3	6	255938	255943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_015578	TGT	2	6	255984	255989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_015578	TGAT	2	8	256031	256038	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
569	NC_015578	ATT	2	6	256068	256073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_015578	GGT	2	6	256123	256128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
571	NC_015578	ATA	2	6	256136	256141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_015578	ACT	2	6	256153	256158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_015578	TAA	2	6	256187	256192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_015578	A	6	6	256197	256202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_015578	AAT	2	6	256257	256262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_015578	ATT	2	6	256288	256293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_015578	GAAC	2	8	256297	256304	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
578	NC_015578	ATG	2	6	256326	256331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_015578	CAA	2	6	256368	256373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_015578	AAT	2	6	256375	256380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_015578	ATA	2	6	256398	256403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_015578	AGAA	2	8	256472	256479	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
583	NC_015578	TGA	2	6	256527	256532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_015578	TAA	2	6	256563	256568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_015578	ATT	3	9	256779	256787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_015578	TAA	2	6	258150	258155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_015578	ATT	2	6	258197	258202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_015578	ATA	2	6	258212	258217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_015578	A	7	7	258220	258226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_015578	ATT	2	6	258287	258292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_015578	TAT	2	6	258329	258334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_015578	TATT	2	8	258345	258352	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_015578	TCAA	2	8	258366	258373	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
594	NC_015578	TA	3	6	259096	259101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_015578	TTA	2	6	259123	259128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_015578	TAA	2	6	262971	262976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_015578	TAAT	2	8	266308	266315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_015578	AATT	2	8	267488	267495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_015578	TTTAA	2	10	267496	267505	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_015578	TA	3	6	267524	267529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_015578	ATTT	2	8	267550	267557	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_015578	TTTATA	2	12	269425	269436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_015578	CTT	2	6	269451	269456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_015578	T	6	6	269464	269469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_015578	T	6	6	269475	269480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_015578	TATT	2	8	269521	269528	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_015578	TTGA	2	8	269544	269551	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
608	NC_015578	TAA	2	6	269558	269563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_015578	TAA	2	6	269575	269580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_015578	AAT	2	6	269603	269608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_015578	AAAT	2	8	269612	269619	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_015578	ATT	2	6	269640	269645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_015578	TTG	2	6	269652	269657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_015578	AAGC	2	8	270645	270652	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
615	NC_015578	T	7	7	278599	278605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_015578	CTAA	2	8	278606	278613	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
617	NC_015578	T	6	6	278616	278621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_015578	TAT	2	6	278627	278632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_015578	A	6	6	278635	278640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_015578	CTT	2	6	279914	279919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_015578	ACC	2	6	279921	279926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_015578	A	6	6	280254	280259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_015578	TTC	2	6	280268	280273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_015578	GGTAT	2	10	280278	280287	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
625	NC_015578	A	6	6	280490	280495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_015578	A	6	6	281869	281874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_015578	TCC	2	6	283166	283171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_015578	AGT	2	6	283185	283190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_015578	GT	3	6	283189	283194	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
630	NC_015578	ATT	2	6	284409	284414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_015578	ATT	2	6	284423	284428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_015578	GTT	2	6	284447	284452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_015578	T	6	6	284461	284466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_015578	ATT	2	6	284481	284486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_015578	GAGCG	2	10	284616	284625	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
636	NC_015578	TCC	2	6	284686	284691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
637	NC_015578	AC	3	6	284817	284822	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
638	NC_015578	CGC	2	6	284875	284880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
639	NC_015578	T	7	7	284920	284926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_015578	AAAG	2	8	284935	284942	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
641	NC_015578	TAT	2	6	284944	284949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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