MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Tepidanaerobacter sp. Re1 chromosome

Total Repeats: 10537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015519	CAGC	2	8	984198	984205	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4002	NC_015519	A	6	6	984368	984373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_015519	AAT	2	6	984377	984382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_015519	T	6	6	984433	984438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_015519	CAT	2	6	984447	984452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_015519	TA	3	6	984553	984558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_015519	GATT	2	8	984575	984582	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_015519	AT	3	6	984611	984616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_015519	AT	3	6	984651	984656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_015519	CA	3	6	984661	984666	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4011	NC_015519	TCC	2	6	984686	984691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4012	NC_015519	TCC	2	6	985406	985411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4013	NC_015519	TAT	2	6	985442	985447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_015519	TCA	3	9	985457	985465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_015519	TAATG	2	10	985474	985483	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_015519	TAC	2	6	985524	985529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_015519	AT	3	6	985819	985824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_015519	ATTT	2	8	985842	985849	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_015519	AGG	2	6	985855	985860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_015519	TATT	2	8	985863	985870	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_015519	GA	3	6	986579	986584	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_015519	GCA	2	6	986636	986641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_015519	CTG	2	6	986711	986716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_015519	T	6	6	986769	986774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_015519	A	6	6	986823	986828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_015519	GAG	2	6	986830	986835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_015519	TATC	2	8	987252	987259	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4028	NC_015519	ATT	2	6	987262	987267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_015519	ACA	2	6	987448	987453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_015519	TTA	2	6	987494	987499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_015519	AGG	2	6	987532	987537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_015519	AAT	2	6	988373	988378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_015519	T	6	6	989736	989741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_015519	GAG	2	6	991276	991281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_015519	TAA	2	6	991294	991299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_015519	CTC	2	6	991308	991313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4037	NC_015519	TTA	2	6	991314	991319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_015519	AAAATC	2	12	991341	991352	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4039	NC_015519	ATTTA	2	10	991390	991399	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_015519	A	6	6	991424	991429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_015519	AGTT	2	8	991515	991522	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_015519	AT	4	8	991549	991556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_015519	TAG	2	6	991618	991623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_015519	ATT	2	6	991683	991688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_015519	AAT	2	6	991693	991698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_015519	GA	3	6	991715	991720	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_015519	GATTA	2	10	992308	992317	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_015519	ATA	2	6	992343	992348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_015519	AAGA	2	8	992368	992375	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_015519	TAA	2	6	992441	992446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_015519	AGT	2	6	992455	992460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_015519	ATT	2	6	992503	992508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_015519	ATTA	2	8	992523	992530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_015519	AAT	2	6	992538	992543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_015519	TAT	2	6	992580	992585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_015519	AGT	2	6	992595	992600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_015519	GGT	2	6	992655	992660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_015519	TTC	2	6	992674	992679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_015519	AC	3	6	992713	992718	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4060	NC_015519	A	6	6	992757	992762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_015519	TAT	2	6	992819	992824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_015519	AT	3	6	992852	992857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_015519	A	7	7	992894	992900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_015519	CT	3	6	992903	992908	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4065	NC_015519	AAG	2	6	992925	992930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_015519	ATT	2	6	992948	992953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_015519	GAA	2	6	992971	992976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_015519	TA	3	6	992982	992987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_015519	TAG	2	6	993075	993080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_015519	A	6	6	993085	993090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_015519	AAAT	2	8	993154	993161	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_015519	TTG	2	6	993177	993182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_015519	TAA	2	6	993193	993198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_015519	AAT	2	6	993251	993256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_015519	A	6	6	993271	993276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_015519	A	6	6	993279	993284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_015519	CAT	2	6	993352	993357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4079	NC_015519	A	6	6	993398	993403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_015519	ATA	3	9	993413	993421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_015519	TGG	2	6	993457	993462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_015519	AT	3	6	993478	993483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_015519	ATTA	2	8	993530	993537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_015519	AGG	2	6	993544	993549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4086	NC_015519	ATT	2	6	995100	995105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_015519	TAA	2	6	995120	995125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_015519	GAA	2	6	995133	995138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_015519	TAA	3	9	995152	995160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_015519	AAT	2	6	995161	995166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_015519	AGA	3	9	995256	995264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_015519	ATA	2	6	995280	995285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_015519	AAAAT	2	10	995296	995305	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_015519	TAA	2	6	995402	995407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_015519	T	6	6	995408	995413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_015519	ATT	2	6	996016	996021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_015519	TTC	2	6	996022	996027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_015519	T	6	6	996036	996041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_015519	ATA	2	6	996058	996063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_015519	CAAGCT	2	12	996194	996205	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_015519	TAT	2	6	996233	996238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_015519	GTTTC	2	10	996289	996298	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4103	NC_015519	T	6	6	996323	996328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_015519	ATAAAT	2	12	996417	996428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_015519	A	7	7	996480	996486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_015519	ACGTT	2	10	996506	996515	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4107	NC_015519	TTC	2	6	997848	997853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_015519	T	6	6	997854	997859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_015519	A	7	7	997899	997905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_015519	ATT	2	6	997949	997954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_015519	GAT	2	6	997956	997961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_015519	AG	3	6	998015	998020	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_015519	ATT	2	6	998115	998120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_015519	AAAT	2	8	998180	998187	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_015519	GATA	2	8	998226	998233	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_015519	AGG	2	6	998243	998248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_015519	A	7	7	998329	998335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_015519	AAC	2	6	998358	998363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_015519	ATA	2	6	998415	998420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_015519	ACAAT	2	10	998520	998529	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4121	NC_015519	TAT	2	6	998700	998705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_015519	A	6	6	998722	998727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_015519	GAA	2	6	998736	998741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_015519	AGG	2	6	998771	998776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_015519	TGA	2	6	998824	998829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_015519	TAA	2	6	998872	998877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_015519	A	6	6	998876	998881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_015519	TTA	2	6	998929	998934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_015519	TACA	2	8	999719	999726	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4130	NC_015519	ATG	2	6	999849	999854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_015519	CAA	2	6	999939	999944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4132	NC_015519	CAG	2	6	999947	999952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4133	NC_015519	AAAT	2	8	1000038	1000045	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_015519	GAA	2	6	1000065	1000070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_015519	T	8	8	1000126	1000133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_015519	ATT	2	6	1000135	1000140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4137	NC_015519	TAT	2	6	1000142	1000147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4138	NC_015519	TATAC	2	10	1000170	1000179	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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4442	NC_015519	GGGA	2	8	1025216	1025223	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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4445	NC_015519	T	6	6	1029043	1029048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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